MTHFD1L - MTHFD1L

MTHFD1L
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMTHFD1L, FTHFSDC1, MTC1THFS, dJ292B18.2, метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (НАДФ + зависимая) 1-подобная, метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (НАДФ + зависимая) 1 подобная
Внешние идентификаторыOMIM: 611427 MGI: 1924836 ГомолоГен: 56706 Генные карты: MTHFD1L
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение MTHFD1L
Геномное расположение MTHFD1L
Группа6q25.1Начинать150,865,549 бп[1]
Конец151,101,887 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001170785
NM_001170786
NM_172308

RefSeq (белок)

NP_001164256
NP_001164257
NP_758512

Расположение (UCSC)Chr 6: 150,87 - 151,1 МбChr 10: 3.97 - 4.17 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Монофункциональная C1-тетрагидрофолатсинтаза, митохондриальная также известный как формилтетрагидрофолат синтетаза, является фермент что у людей кодируется MTHFD1L ген (метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (НАДФ + зависимая) 1-подобная).[5][6][7]

Функция

Одноуглеродные замещенные формы тетрагидрофолат (THF) участвуют в синтез de novo из пурины и тимидилат и поддержка сотовой связи метилирование реакции через регенерацию метионин из гомоцистеин. MTHFD1L - это фермент, участвующий в синтезе THF в митохондрии.[7]

В отличие от MTHFD1 который имеет трифункциональный метилентетрагидрофолатдегидрогеназа, метенилтетрагидрофолат циклогидролаза, и формилтетрагидрофолат синтетаза ферментативная активность, MTHFD1L обладает только формилтетрагидрофолатсинтетазной активностью.[8]

Клиническое значение

Определенные варианты MTHFD1L связаны дефекты нервной трубки.[9] Различные аллели SNP rs7646 в 3 'UTR MTHFD1L по-разному регулируются микроРНК, влияющими на экспрессию MTHFD1L.[10]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции MTHFD1L. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Mthfd1ltm1a (EUCOMM) Wtsi[15][16] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[17][18][19]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[13][20] Было проведено 26 испытаний мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[13] В гомозиготный мутант эмбрионы, идентифицированные во время беременности, имели экзэнцефалия. Никто не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантных взрослых мышей и никаких дальнейших отклонений не наблюдалось.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120254 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040675 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Прасаннан П., Пайк С., Пэн К., Шейн Б., Appling DR (октябрь 2003 г.). «Митохондриальная C1-тетрагидрофолатсинтаза человека: структура гена, распределение мРНК в тканях и иммунолокализация в криках яичников китайского хомячка». J. Biol. Chem. 278 (44): 43178–87. Дои:10.1074 / jbc.M304319200. ЧВК  1457088. PMID  12937168.
  6. ^ Кристенсен К.Е., Маккензи Р.Э. (2008). «Митохондриальная метилентетрагидрофолатдегидрогеназа, метенилтетрагидрофолатциклогидролаза и формилтетрагидрофолатсинтетазы». Витам. Horm. 79: 393–410. Дои:10.1016 / S0083-6729 (08) 00414-7. PMID  18804703.
  7. ^ а б «Ген Entrez: метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (НАДФ + зависимая) 1-подобная».
  8. ^ Кристенсен К.Э., Патель Х., Кузманов У., Мехиа Н.Р., Маккензи Р.Э. (март 2005 г.). «Нарушение гена mthfd1 выявляет монофункциональную 10-формилтетрагидрофолат синтетазу в митохондриях млекопитающих». J. Biol. Chem. 280 (9): 7597–602. Дои:10.1074 / jbc.M409380200. PMID  15611115.
  9. ^ Парл-Макдермотт А., Пангилинан Ф., О'Брайен К.К., Миллс Дж. Л., Маги А. М., Трэндл Дж., Саттон М., Скотт Дж. М., Кирк П. Н., Моллой А. М., Броди Л.С. (декабрь 2009 г.). «Распространенный вариант MTHFD1L связан с дефектами нервной трубки и эффективностью сплайсинга мРНК». Гм. Мутат. 30 (12): 1650–6. Дои:10.1002 / humu.21109. ЧВК  2787683. PMID  19777576.
  10. ^ Мингуцци, Стефано; Сельчуклу, С. Дуйгу; Спиллейн, Чарльз; Парле-Макдермотт, Энн (18 декабря 2013 г.). «Связанный с NTD полиморфизм в 3'-UTR MTHFD1L может влиять на риск заболевания путем изменения связывания miRNA». Человеческая мутация. 35 (1): 96–104. Дои:10.1002 / humu.22459. ISSN  1059-7794. PMID  24123340. S2CID  6583361.
  11. ^ "Сальмонелла данные о заражении Mthfd1l ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ "Citrobacter данные о заражении Mthfd1l ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  13. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  14. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  15. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  16. ^ "Информатика генома мыши".
  17. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  18. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  19. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  20. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.