PABPN1 - PABPN1

PABPN1
Белок PABPN1 PDB 3B4D.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPABPN1, OPMD, PAB2, PABII, PABP-2, PABP2, поли (A) связывающий белок ядерный 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602279 MGI: 1859158 ГомолоГен: 3412 Генные карты: PABPN1
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение PABPN1
Геномное расположение PABPN1
Группа14q11.2Начинать23,321,289 бп[1]
Конец23,326,185 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PABPN1 201544 x at fs.png

PBB GE PABPN1 201545 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004643
NM_001360551
NM_001360552

NM_019402

RefSeq (белок)

NP_004634
NP_001347480
NP_001347481

NP_062275

Расположение (UCSC)Chr 14: 23.32 - 23.33 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Полиаденилат-связывающий белок 2 (PABP-2) также известный как полиаденилат-связывающий ядерный белок 1 (PABPN1) - это белок что у людей кодируется PABPN1 ген.[4][5] PABN1 является членом большой семьи поли (A) -связывающие белки в геноме человека.

Функция

Этот ген кодирует обильный ядерный белок, который с высокой аффинностью связывается с формирующимися поли (А) хвостами. Белок необходим для прогрессивной и эффективной полимеризации поли (А) хвостов на 3'-концах эукариотических генов и контролирует размер поли (А) хвоста примерно до 250 нуклеотидов. В стационарном состоянии этот белок локализуется в ядре, тогда как другой связывающий поли (A) белок локализуется в цитоплазме. Расширение тринуклеотидного (GCN) повтора с нормальных 10 до 11-17 на 5'-конце кодирующей области этого гена приводит к аутосомно-доминантному окулофарингеальная мышечная дистрофия (OPMD) болезнь.[6] Было описано несколько вариантов сращивания, но их полноразмерная природа неизвестна. Один вариант сплайсинга включает интроны 1 и 6, но белок не образуется.[5]

Взаимодействия

PABPN1 был показан взаимодействовать с SNW1.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100836 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Brais B., Xie YG, Sanson M, Morgan K, Weissenbach J, Korczyn AD, Blumen SC, Fardeau M, Tomé FM, Bouchard JP (август 1995 г.). «Локус окулофарингеальной мышечной дистрофии картируется в области сердечных генов альфа- и бета-тяжелых цепей миозина на хромосоме 14q11.2-q13». Хум Мол Генет. 4 (3): 429–34. Дои:10,1093 / чмг / 4.3.429. PMID  7795598.
  5. ^ а б «Ген Entrez: поли (A) связывающий белок PABPN1, ядерный 1».
  6. ^ Brais B (январь 2009 г.). «Окулофарингеальная мышечная дистрофия: полиаланиновая миопатия». Текущие отчеты по неврологии и неврологии. 9 (1): 76–82. Дои:10.1007 / s11910-009-0012-у. PMID  19080757.
  7. ^ Ким Й.Дж., Ногучи С., Хаяси Ю.К., Цукахара Т., Симидзу Т., Арахата К. (май 2001 г.). «Продукт гена окулофарингеальной мышечной дистрофии, поли (A) -связывающий белок 2, взаимодействует с SKIP и стимулирует экспрессию гена, специфичного для мышц». Гм. Мол. Genet. Англия. 10 (11): 1129–39. Дои:10.1093 / hmg / 10.11.1129. ISSN  0964-6906. PMID  11371506.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка