ACOT13 - ACOT13

ACOT13
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыACOT13, PNAS-27, THEM2, HT012, ацил-КоА тиоэстераза 13
Внешние идентификаторыOMIM: 615652 MGI: 1914084 ГомолоГен: 41273 Генные карты: ACOT13
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение ACOT13
Геномное расположение ACOT13
Группа6p22.3Начинать24,667,035 бп[1]
Конец24,705,065 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_018473
NM_001160094

NM_025790

RefSeq (белок)

NP_001153566
NP_060943

NP_080066

Расположение (UCSC)Chr 6: 24,67 - 24,71 МбChr 13: 24,82 - 24,83 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА тиоэстераза 13 это белок что у человека кодируется ACOT13 ген.[5] Этот ген кодирует член тиоэстераза надсемейство. У человека белок совмещен с микротрубочки и необходим для устойчивого распространение клеток.[5]

Структура

Ортологичный белок мыши образует гомотетрамер и связан с митохондрии. Белок мыши функционирует как тиоэстераза ацил-КоА со средней и длинной цепью. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[5]

Функция

Белок, кодируемый геном ACOT13, является частью семейства Ацил-КоА тиоэстеразы, которые катализируют гидролиз различных Коэнзим А сложные эфиры различных молекул к свободной кислоте плюс КоА. Эти ферменты также упоминаются в литературе как гидролазы ацил-КоА, гидролазы тиоэфиров ацил-КоА и гидролазы пальмитоил-КоА. Реакция, проводимая этими ферменты как следует:

CoA эфир + H2О → свободная кислота + кофермент А

Эти ферменты используют одинаковые субстраты как длинноцепочечные ацил-КоА-синтетазы, но имеют уникальное назначение, так как они генерируют свободную кислоту и КоА, в отличие от длинноцепочечных ацил-КоА-синтетаз, которые связывают жирные кислоты с КоА, с образованием сложного эфира КоА.[6] Роль ферментов семейства ACOT не совсем понятна; однако было высказано предположение, что они играют решающую роль в регулировании внутриклеточных уровней сложных эфиров КоА, кофермента А и свободных жирных кислот. Недавние исследования показали, что сложные эфиры ацил-КоА имеют гораздо больше функций, чем просто источник энергии. Эти функции включают аллостерическая регуляция ферментов, таких как ацетил-КоА карбоксилаза,[7] гексокиназа IV,[8] и фермент, конденсирующий цитрат. Длинноцепочечные ацил-КоА также регулируют открытие АТФ-чувствительные калиевые каналы и активация Кальциевые АТФазы, тем самым регулируя инсулин секреция.[9] Ряд других клеточных событий также опосредуется через ацил-КоА, например, передача сигнала через протеинкиназа C, ингибирование ретиноевая кислота -индуцированный апоптоз и участие в почковании и слиянии эндомембранная система.[10][11][12] Ацил-КоА также опосредуют нацеливание белков на различные мембраны и регуляцию G протеин субъединицы α, поскольку они являются субстратами для ацилирования белков.[13] в митохондрии, сложные эфиры ацил-КоА участвуют в ацилировании митохондриальных НАД + -зависимых дегидрогеназы; потому что эти ферменты отвечают за катаболизм аминокислот, это ацилирование делает весь процесс неактивным. Этот механизм может обеспечивать метаболические перекрестные помехи и регулировать НАДН / НАД + для поддержания оптимального митохондриального бета-окисление жирных кислот.[14] Роль эфиров КоА в липидный обмен и многие другие внутриклеточные процессы хорошо определены, и, таким образом, предполагается, что ферменты ACOT играют роль в модуляции процессов, в которых участвуют эти метаболиты.[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112304 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006717 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c «Энтрез Ген: Ацил-КоА тиоэстераза 13».
  6. ^ Mashek DG, Bornfeldt KE, Coleman RA, Berger J, Bernlohr DA, Black P, DiRusso CC, Farber SA, Guo W, Hashimoto N, Khodiyar V, Kuypers FA, Maltais LJ, Nebert DW, Renieri A, Schaffer JE, Stahl A , Уоткинс П.А., Василиу В., Ямамото Т.Т. (октябрь 2004 г.). «Пересмотренная номенклатура семейства генов длинноцепочечной ацил-КоА синтетазы млекопитающих». Журнал липидных исследований. 45 (10): 1958–61. Дои:10.1194 / мл. E400002-JLR200. PMID  15292367.
  7. ^ Огивара Х., Танабэ Т., Никава Дж., Нума С. (август 1978 г.). «Ингибирование ацетил-кофермент-карбоксилазы печени крысы с помощью пальмитоил-кофермента А. Формирование эквимолярного комплекса фермент-ингибитор». Европейский журнал биохимии / FEBS. 89 (1): 33–41. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1978.tb20893.x. PMID  29756.
  8. ^ Srere PA (декабрь 1965 г.). «Пальмитил-коэнзим А ингибирование цитрат-конденсирующего фермента». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - липиды и липидный метаболизм. 106 (3): 445–55. Дои:10.1016/0005-2760(65)90061-5. PMID  5881327.
  9. ^ Гриббл FM, Прокс П., Корки Б. Е., Эшкрофт FM (октябрь 1998 г.). «Механизм активации клонированного АТФ-чувствительного калиевого канала олеоил-КоА». Журнал биологической химии. 273 (41): 26383–7. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26383. PMID  9756869.
  10. ^ Nishizuka Y (апрель 1995 г.). «Протеинкиназа С и передача сигналов липидов для устойчивых клеточных ответов». Журнал FASEB. 9 (7): 484–96. Дои:10.1096 / fasebj.9.7.7737456. PMID  7737456. S2CID  31065063.
  11. ^ Глик Б.С., Ротман Дж. Э. (март 1987 г.). «Возможная роль жирного ацил-кофермента А во внутриклеточном транспорте белка». Природа. 326 (6110): 309–12. Bibcode:1987Натура.326..309Г. Дои:10.1038 / 326309a0. PMID  3821906. S2CID  4306469.
  12. ^ Ван Й.Дж., Кай Й., Коуэн С., Маги Т.Р. (июнь 2000 г.). «Жирные ацил-КоА ингибируют апоптоз, вызванный ретиноевой кислотой в клетках Hep3B». Письма о раке. 154 (1): 19–27. Дои:10.1016 / s0304-3835 (00) 00341-4. PMID  10799735.
  13. ^ Дункан Дж. А., Гилман А. Г. (июнь 1998 г.). «Цитоплазматическая тиоэстераза ацил-протеина, которая удаляет пальмитат из альфа-субъединиц G-протеина и p21 (RAS)». Журнал биологической химии. 273 (25): 15830–7. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15830. PMID  9624183.
  14. ^ Berthiaume L, Deichaite I, Peseckis S, Resh MD (март 1994). «Регулирование ферментативной активности путем ацилирования жирных кислот в активном центре. Новая роль ацилирования белков с длинноцепочечными жирными кислотами». Журнал биологической химии. 269 (9): 6498–505. PMID  8120000.
  15. ^ Hunt MC, Alexson SE (март 2002 г.). «Роль ацил-КоА тиоэстеразы играет в посредничестве внутриклеточного липидного метаболизма». Прогресс в исследованиях липидов. 41 (2): 99–130. Дои:10.1016 / s0163-7827 (01) 00017-0. PMID  11755680.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.