Эфрин В2 - Ephrin B2

EFNB2
Белок EFNB2 PDB 1iko.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEFNB2, EPLG5, HTKL, Htk-L, LERK5, эфрин B2
Внешние идентификаторыOMIM: 600527 MGI: 105097 ГомолоГен: 3019 Генные карты: EFNB2
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человек)[1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение EFNB2
Геномное расположение EFNB2
Группа13q33.3Начинать106,489,745 бп[1]
Конец106,535,662 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE EFNB2 202669 s в формате fs.png

PBB GE EFNB2 202668 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004093
NM_001372056
NM_001372057
NM_001372058

NM_010111
NM_001368299

RefSeq (белок)

NP_004084
NP_001358985
NP_001358986
NP_001358987

NP_034241
NP_001355228

Расположение (UCSC)Chr 13: 106,49 - 106,54 МбChr 8: 8.62 - 8.66 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эфрин-В2 это белок что у людей кодируется EFNB2 ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует член эфрин (EPH) семья. Эфрины и рецепторы, связанные с EPH, составляют самое большое подсемейство рецепторных протеин-тирозинкиназ и участвуют в опосредовании событий развития, особенно в нервной системе и в организме. эритропоэз. Основываясь на их структуре и взаимосвязи последовательностей, эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), который прикреплен к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитовой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Этот ген кодирует эфрин класса EFNB, который связывается с EPHB4 и EPHA3 рецепторы.[6]

Рак

Ген EFNB2 прогрессивно подавляется в Вирус папилломы человека -положительный опухолевые кератиноциты происходит из шейки матки предопухолевые поражения на разных уровнях злокачественности.[7] По этой причине EFNB2, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером шейки матки. предопухолевые поражения прогрессия.[7]

Взаимодействия

EFNB2 был показан взаимодействовать с EPHA3[8][9] и EPHB1 в зрительный перекрест разработка.[10]

EFNB2 также может служить рецептором для Вирус Хендры и вирус Нипах, посредничество Вход в клетку при заражении.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125266 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001300 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Bonaldo MF, Yu MT, Jelenc P, Brown S, Su L, Lawton L, Deaven L, Efstratiadis A, Warburton D, Soares MB (сентябрь 1994 г.). «Отбор кДНК с использованием геномных клонов, специфичных для хромосом: приложение к хромосоме 13 человека». Молекулярная генетика человека. 3 (9): 1663–73. Дои:10,1093 / hmg / 3.9.1663. PMID  7833926.
  6. ^ «Энтрез Ген: EFNB2, эфрин-B2».
  7. ^ а б Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. Дои:10.1002 / jcp.24808. PMID  25205602.
  8. ^ Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Е., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда eph-родственных рецепторных тирозинкиназ». Молекулярная иммунология. 32 (16): 1197–205. Дои:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID  8559144.
  9. ^ Лакманн М., Манн Р.Дж., Кравец Л., Смит Ф.М., Буччи Т.А., Максвелл К.Ф., Хоулетт Г.Дж., Олссон Дж. Э., Ванден Бос Т., Черретти Д.П., Бойд А.В. (июнь 1997 г.). «Лиганд для киназы, родственной EPH (LERK) 7, является предпочтительным лигандом с высоким сродством для рецептора HEK». Журнал биологической химии. 272 (26): 16521–30. Дои:10.1074 / jbc.272.26.16521. PMID  9195962.
  10. ^ Уильямс С.Е., Манн Ф., Эрскин Л., Сакураи Т., Вей С., Росси Д.Д., Гейл Н.В., Холт К.Э., Мейсон Калифорния, Хенкемайер М. (сентябрь 2003 г.). «Эфрин-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки при перекресте зрительных нервов». Нейрон. 39 (6): 919–35. Дои:10.1016 / j.neuron.2003.08.017. PMID  12971893.
  11. ^ Бонапарт М.И., Димитров А.С., Боссарт К.Н., Крамери Г., Мунгалл Б.А., Бишоп К.А., Чоудри В., Димитров Д.С., Ван Л.Ф., Итон Б.Т., Бродер С.К. (июль 2005 г.). «Лиганд эфрина-B2 является функциональным рецептором вируса Хендра и вируса Нипах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (30): 10652–7. Дои:10.1073 / pnas.0504887102. ЧВК  1169237. PMID  15998730.

дальнейшее чтение