Лиганд (биохимия) - Ligand (biochemistry)

Эта статья о лигандах в биохимии. О лигандах в неорганической химии см. Лиганд. Для использования в других целях см. Лиганд (значения).
Миоглобин (синий) со своим лигандом гем (оранжевый) переплет. На основе PDB: 1MBO​

В биохимия и фармакология, а лиганд это вещество что образует сложный с биомолекула служить биологической цели. При связывании белок-лиганд лиганд обычно представляет собой молекулу, которая производит сигнал к привязка к сайт на цель белок. Привязка обычно приводит к изменению конформационная изомерия (конформация) целевого белка. В исследованиях связывания ДНК с лигандом лиганд может быть небольшой молекулой, ионом,[1] или белок[2] который привязан к Двойная спираль ДНК. Отношения между лигандом и партнером по связыванию зависят от заряда, гидрофобности и молекулярной структуры. Пример связывания происходит в бесконечно малом диапазоне времени и пространства, поэтому константа скорости обычно является очень малым числом.

Связывание происходит межмолекулярные силы, Такие как ионные связи, водородные связи и Силы Ван-дер-Ваальса. Ассоциация или стыковка фактически обратим через диссоциацию. Неизмеримо необратимый ковалентный связь между лигандом и молекулой-мишенью нетипична в биологических системах. В отличие от определения лиганд в металлоорганический и неорганическая химия, в биохимии неясно, связывается ли лиганд в металл сайт, как и в гемоглобин. В общем, интерпретация лиганда зависит от контекста, в зависимости от того, какой тип связывания наблюдается. Этимология происходит от сигарета, что означает «связывать».

Связывание лиганда с рецепторный белок изменяет конформацию, влияя на ориентацию трехмерной формы. Конформация рецепторного белка составляет функциональное состояние. Лиганды включают субстраты, ингибиторы, активаторы, сигнальные липиды, и нейротрансмиттеры. Скорость связывания называется близость, и это измерение характеризует тенденцию или силу эффекта. Сродство связывания актуализируется не только хозяин Гость взаимодействия, но также и эффекты растворителя, которые могут играть доминирующую роль, стерический роль, которая движет нековалентное связывание в растворе.[3] Растворитель обеспечивает химическую среду для адаптации лиганда и рецептора и, таким образом, принимать или отвергать друг друга как партнеров.

Радиолиганды находятся радиоизотоп меченые используемые соединения in vivo в качестве трассеры в ДОМАШНИЙ ПИТОМЕЦ исследования и для in vitro исследования связывания.

Аффинность связывания рецептора / лиганда

Взаимодействие лигандов с их сайтами связывания можно охарактеризовать с точки зрения аффинности связывания. В общем, связывание лиганда с высоким сродством является результатом большей силы притяжения между лигандом и его рецептором, тогда как связывание лиганда с низким сродством включает меньшую силу притяжения. Как правило, связывание с высоким сродством приводит к более высокой занятости рецептора его лигандом, чем в случае связывания с низким сродством; в Время жительства (время жизни комплекса рецептор-лиганд) не коррелирует. Связывание лигандов с рецепторами с высоким сродством часто является физиологически важным, когда некоторая часть энергии связывания может быть использована для того, чтобы вызвать конформационное изменение рецептора, приводящее к изменению поведения, например, ассоциированного ионный канал или же фермент.

Лиганд, который может связываться с рецептором и изменять его функцию, вызывающую физиологический ответ, называется рецептором. агонист. Лиганды, которые связываются с рецептором, но не могут активировать физиологический ответ, являются рецепторными. антагонисты.

Два агониста с одинаковой аффинностью связывания

Связывание агониста с рецептором можно охарактеризовать как с точки зрения того, сколько физиологической реакции может быть вызвано (то есть эффективность ) и с точки зрения концентрация агониста, необходимого для получения физиологического ответа (часто измеряется как EC50, концентрация, необходимая для получения полумаксимального ответа). Связывание лиганда с высоким сродством подразумевает, что относительно низкая концентрация лиганда достаточна для того, чтобы максимально занять лиганд-связывающий сайт и вызвать физиологический ответ. Сродство к рецепторам измеряется константой ингибирования или Kя значение, концентрация, необходимая для занятия 50% рецептора. Лигандное сродство чаще всего измеряется косвенно как IC50 значение из эксперимента по конкурентному связыванию, в котором определяется концентрация лиганда, необходимая для замещения 50% фиксированной концентрации эталонного лиганда. Kя значение можно оценить с помощью IC50 сквозь Уравнение Ченга Прусова. Лигандное сродство также можно измерить непосредственно как константа диссоциации (Kd) с использованием таких методов, как тушение флуоресценции, калориметрия изотермического титрования или же поверхностный плазмонный резонанс.[4]

Низкоаффинное связывание (высокий Kя уровень) означает, что требуется относительно высокая концентрация лиганда, прежде чем сайт связывания будет максимально занят и будет достигнут максимальный физиологический ответ на лиганд. В примере, показанном справа, два разных лиганда связываются с одним и тем же сайтом связывания рецептора. Только один из показанных агонистов может максимально стимулировать рецептор и, таким образом, может быть определен как полный агонист. Агонист, который может лишь частично активировать физиологический ответ, называется частичный агонист. В этом примере концентрация, при которой полный агонист (красная кривая) может наполовину максимально активировать рецептор, составляет примерно 5 × 10−9 Молярный (нМ = наномолярный ).

Два лиганда с разным сродством связывания с рецептором.

Аффинность связывания чаще всего определяется с использованием радиоактивно меченый лиганд, известный как меченый лиганд. Гомологичные эксперименты по конкурентному связыванию вовлекают конкуренцию связывания между меченым лигандом и немаркированным лигандом.[5]Методы, основанные на реальном времени, которые часто не содержат меток, например поверхностный плазмонный резонанс, двухполяризационная интерферометрия и многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс (MP-SPR) может не только количественно оценить сродство с помощью анализов на основе концентрации; но также из кинетики ассоциации и диссоциации, а в более поздних случаях конформационного изменения, индуцированного при связывании. MP-SPR также позволяет проводить измерения в буферах диссоциации с высоким содержанием физиологического раствора благодаря уникальной оптической настройке. Микромасштабный термофорез (MST), метод без иммобилизации[6] был развит. Этот метод позволяет определять аффинность связывания без ограничения молекулярной массы лиганда.[7]

Для использования статистическая механика о количественном исследовании аффинности связывания лиганд-рецептор см. подробную статью[8]по конфигурации функция распределения.

Эффективность лекарственного средства и сродство к связыванию

Сами по себе данные о сродстве связывания не определяют общую эффективность лекарственного средства. Эффективность является результатом сложного взаимодействия как сродства связывания, так и эффективности лиганда. Эффективность лиганда относится к способности лиганда вызывать биологический ответ при связывании с рецептором-мишенью и количественной величине этого ответа. Этот ответ может быть как агонист, антагонист, или же обратный агонист в зависимости от производимой физиологической реакции.[9]

Селективный и неизбирательный

Основная статья: Селективность связывания

Селективные лиганды имеют тенденцию связываться с очень ограниченными типами рецепторов, тогда как неселективные лиганды связываются с несколькими типами рецепторов. Это играет важную роль в фармакология, куда наркотики неизбирательные, как правило, имеют больше побочные эффекты, потому что они связываются с несколькими другими рецепторами в дополнение к рецептору, вызывающему желаемый эффект.

Гидрофобные лиганды

Для гидрофобных лигандов (например, PIP2) в комплексе с гидрофобным белком (например, липидно-зависимые ионные каналы ) определение сродства осложняется неспецифическими гидрофобными взаимодействиями. Неспецифические гидрофобные взаимодействия можно преодолеть, если сродство лиганда высокое.[10] Например, PIP2 связывается с высоким сродством с ионными каналами, управляемыми PIP2.

Двухвалентный лиганд

Двухвалентные лиганды состоят из двух лекарственных молекул (фармакофоров или лигандов), соединенных инертным линкером. Существуют различные виды двухвалентных лигандов, и их часто классифицируют в зависимости от того, на что нацелены фармакофоры. Гомобивалентные лиганды нацелены на два рецептора одного и того же типа. Гетеробивалентные лиганды нацелены на два разных типа рецепторов.[11] Битопические лиганды нацелены на ортостерические сайты связывания и аллостерические сайты связывания на одном и том же рецепторе.[12]

В научных исследованиях двухвалентные лиганды использовались для изучения димеры рецепторов и исследовать их свойства. Этот класс лигандов был впервые предложен Филип С. Портогезе и коллеги при изучении системы опиоидных рецепторов.[13][14][15] О двухвалентных лигандах для рецептора гонадотропин-рилизинг-гормона также сообщали ранее Майкл Конн и его коллеги.[16][17] Со времени этих ранних сообщений было опубликовано множество двухвалентных лигандов для различных Рецептор, связанный с G-белком (GPCR) системы, включая каннабиноид,[18] серотонин,[19][20] окситоцин,[21] и рецепторные системы меланокортина,[22][23][24] и для GPCR -LIC системы (D2 и рецепторы nACh ).[11]

Двухвалентные лиганды обычно больше, чем их одновалентные аналоги, и поэтому не «подобны лекарствам». (См. Липинского правило пяти.) Многие считают, что это ограничивает их применимость в клинических условиях.[25][26] Несмотря на эти убеждения, было много лигандов, которые сообщили об успешных доклинических исследованиях на животных.[23][24][21][27][28][29] Учитывая, что некоторые двухвалентные лиганды могут иметь много преимуществ по сравнению с их моновалентными аналогами (например, тканевая селективность, повышенная аффинность связывания и повышенная активность или эффективность), биваленты также могут иметь некоторые клинические преимущества.

Моно- и полидесмические лиганды

Лиганды белков можно охарактеризовать также по количеству связываемых ими белковых цепей. «Монодесмические» лиганды (μόνος: одиночные, δεσμός: связывающие) представляют собой лиганды, которые связывают одну белковую цепь, в то время как «полидесмические» лиганды (πολοί: многие) [30] часто встречаются в белковых комплексах и представляют собой лиганды, которые связывают более одной белковой цепи, обычно на границах раздела белков или рядом с ними. Недавние исследования показывают, что тип лигандов и структура сайта связывания имеют глубокие последствия для эволюции, функции, аллостерии и фолдинга белковых комплексов.[31][32]

Привилегированный эшафот

Привилегированный эшафот[33] представляет собой молекулярный каркас или химический фрагмент, который статистически повторяется среди известных лекарств или среди определенного набора биологически активных соединений. Эти привилегированные элементы[34] могут быть использованы в качестве основы для разработки новых активных биологических соединений или библиотек соединений.

Методы, используемые для изучения связывания

Основными методами изучения взаимодействий белок-лиганд являются основные гидродинамические и калориметрические методы, а также основные спектроскопические и структурные методы, такие как

Другие методы включают: интенсивность флуоресценции, бимолекулярную комплементацию флуоресценции, FRET (флуоресцентный резонансный перенос энергии) / FRET гашение поверхностного плазмонного резонанса,биослойная интерферометрия, Коиммунопреципитация, непрямой ИФА, равновесный диализ, гель-электрофорез, дальний вестерн-блот, анизотропия поляризации флуоресценции, электронный парамагнитный резонанс,микромасштабный термофорез

Резко возросшая вычислительная мощность суперкомпьютеров и персональных компьютеров позволила изучать взаимодействия белок-лиганд также с помощью вычислительная химия. Например, в рамках проекта для исследований рака использовалась всемирная сеть из более чем миллиона обычных ПК. grid.org, который закончился в апреле 2007 года. На смену Grid.org пришли аналогичные проекты, такие как Сетка мирового сообщества, Проект сворачивания протеома человека, Вычислить против рака и Складной @ Home.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Тейф В.Б. (октябрь 2005 г.). «Лиганд-индуцированная конденсация ДНК: выбор модели». Биофизический журнал. 89 (4): 2574–87. Bibcode:2005BpJ .... 89,2574T. Дои:10.1529 / biophysj.105.063909. ЧВК  1366757. PMID  16085765.
  2. ^ Тейф В.Б., Риппе К. (октябрь 2010 г.). «Статистико-механические решетчатые модели связывания белок-ДНК в хроматине». Журнал физики: конденсированное вещество. 22 (41): 414105. arXiv:1004.5514. Bibcode:2010JPCM ... 22O4105T. Дои:10.1088/0953-8984/22/41/414105. PMID  21386588. S2CID  103345.
  3. ^ Барон Р., Сетни П., Маккаммон Дж. А. (сентябрь 2010 г.). «Вода в полости - распознавание лиганда». Журнал Американского химического общества. 132 (34): 12091–7. Дои:10.1021 / ja1050082. ЧВК  2933114. PMID  20695475.
  4. ^ "Разница между Kя, Кd, IC50, и EC50 значения". Научная улитка. 31 декабря 2019.
  5. ^ ВидетьКривые гомологичного конкурентного связывания В архиве 2007-12-19 на Wayback Machine, Полное руководство по нелинейной регрессии, curvefit.com.
  6. ^ Baaske P, Wienken CJ, Reineck P, Duhr S, Braun D (март 2010 г.). «Оптический термофорез для количественной оценки буферной зависимости связывания аптамера». Angewandte Chemie. 49 (12): 2238–41. Дои:10.1002 / anie.200903998. PMID  20186894. Сложить резюме – Phsy.org (24 февраля 2010 г.).
  7. ^ Винкен CJ, Baaske P, Rothbauer U, Braun D, ​​Duhr S (октябрь 2010 г.). «Анализы связывания белков в биологических жидкостях с использованием термофореза на микроуровне». Nature Communications. 1 (7): 100. Bibcode:2010 НатКо ... 1..100 Вт. Дои:10.1038 / ncomms1093. PMID  20981028.
  8. ^ Ву-Куок, Л., Интеграл конфигурации (статистическая механика), 2008. этот вики-сайт не работает; видеть эта статья в веб-архиве от 28 апреля 2012 г..
  9. ^ Кенакин Т.П. (ноябрь 2006 г.). Учебник по фармакологии: теория, приложения и методы. Академическая пресса. п. 79. ISBN  978-0-12-370599-0.
  10. ^ Cabanos, C; Ван, М; Хан, X; Хансен, SB (8 августа 2017 г.). «Анализ растворимого флуоресцентного связывания выявляет PIP2 Антагонизм каналов ТРЕК-1 ». Отчеты по ячейкам. 20 (6): 1287–1294. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.07.034. ЧВК  5586213. PMID  28793254.
  11. ^ а б Матера, Карло; Пуччи, Лука; Фиорентини, Кьяра; Фучиле, Серджио; Миссейл, Кристина; Грациозо, Джованни; Клементи, Франческо; Золи, Микеле; Де Амичи, Марко (28 августа 2015 г.). «Бифункциональные соединения, нацеленные как на D2, так и на не-α7 nACh рецепторы: дизайн, синтез и фармакологическая характеристика». Европейский журнал медицинской химии. 101: 367–383. Дои:10.1016 / j.ejmech.2015.06.039. PMID  26164842.
  12. ^ Матера, Карло; Фламмини, Лиза; Куадри, Марта; Виво, Валентина; Баллабени, Виджилио; Хольцграбе, Ульрике; Мор, Клаус; Де Амичи, Марко; Барочелли, Элизабетта (21 марта 2014 г.). «Бис (аммонио) алкановые агонисты мускариновых рецепторов ацетилхолина: синтез, функциональная характеристика in vitro и оценка их анальгетической активности in vivo». Европейский журнал медицинской химии. 75: 222–232. Дои:10.1016 / j.ejmech.2014.01.032. PMID  24534538.
  13. ^ Эрез М., Такемори А.Е., Портогезе PS (июль 1982 г.). «Наркотическая антагонистическая сила двухвалентных лигандов, содержащих бета-налтрексамин. Доказательства образования мостиков между проксимальными сайтами узнавания». Журнал медицинской химии. 25 (7): 847–9. Дои:10.1021 / jm00349a016. PMID  7108900.
  14. ^ Портогезе PS, Ronsisvalle G, Larson DL, Yim CB, Sayre LM, Takemori AE (1982). «Опиоидные агонисты и антагонисты двухвалентных лигандов в качестве рецепторных зондов». Науки о жизни. 31 (12–13): 1283–6. Дои:10.1016/0024-3205(82)90362-9. PMID  6292615.
  15. ^ Портогезе П.С., Акгюн Э., Лунцер М.М. (январь 2017 г.). "Индукция гетеромера: подход к уникальной фармакологии?". ACS Chemical Neuroscience. 8 (3): 426–428. Дои:10.1021 / acschemneuro.7b00002. PMID  28139906.
  16. ^ Блюм Дж. Дж., Конн ПМ (декабрь 1982 г.). «Стимуляция высвобождения лютеинизирующего гормона гонадотропин-рилизинг-гормоном: модель лиганд-рецептор-эффектор». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 79 (23): 7307–11. Bibcode:1982PNAS ... 79.7307B. Дои:10.1073 / пнас.79.23.7307. JSTOR  13076. ЧВК  347328. PMID  6296828.
  17. ^ Конн ПМ, Роджерс, округ Колумбия, Стюарт Дж. М., Нидель Дж., Шеффилд Т. (апрель 1982 г.). «Превращение антагониста гонадотропин-рилизинг-гормона в агонист». Природа. 296 (5858): 653–5. Bibcode:1982Натура.296..653C. Дои:10.1038 / 296653a0. PMID  6280058. S2CID  4303982.
  18. ^ Нимчик М., Пемп Д., Даррас Ф. Х., Чен Х, Хейлманн Дж., Деккер М. (август 2014 г.). «Синтез и биологическая оценка лигандов двухвалентных каннабиноидных рецепторов на основе бензимидазолов, селективных к hCB₂R, обнаруживают неожиданные внутренние свойства». Биоорганическая и медицинская химия. 22 (15): 3938–46. Дои:10.1016 / j.bmc.2014.06.008. PMID  24984935.
  19. ^ Руссо О., Бертуз М., Гинер М., Сулье Дж. Л., Ривейл Л., Сиксик С., Лезуальч Ф., Джокерс Р., Берк-Бестель I. (сентябрь 2007 г.). «Синтез специфических двухвалентных зондов, которые функционально взаимодействуют с димерами 5-HT (4) рецептора». Журнал медицинской химии. 50 (18): 4482–92. Дои:10.1021 / jm070552t. PMID  17676726.
  20. ^ Сулье Дж. Л., Руссо О., Гинер М., Ривейл Л., Бертуз М., Онгери С., Мегре Б., Фишмайстер Р., Лезуальч Ф., Сиксик С., Берк-Бестель I. (октябрь 2005 г.). «Дизайн и синтез специфических зондов для исследований димеризации человеческого рецептора 5-HT4». Журнал медицинской химии. 48 (20): 6220–8. Дои:10.1021 / jm050234z. PMID  16190749.
  21. ^ а б Busnelli M, Kleinau G, Muttenthaler M, Stoev S, Manning M, Bibic L, Howell LA, McCormick PJ, Di Lascio S, Braida D, Sala M, Rovati GE, Bellini T, Chini B (август 2016 г.). «Дизайн и характеристика суперпотентных бивалентных лигандов, нацеленных на димеры рецептора окситоцина через канально-подобную структуру». Журнал медицинской химии. 59 (15): 7152–66. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.6b00564. PMID  27420737.
  22. ^ Lensing CJ, Adank DN, Wilber SL, Freeman KT, Schnell SM, Speth RC, Zarth AT, Haskell-Luevano C (февраль 2017 г.). "Прямое сравнение in vivo моновалентного агониста меланокортина Ac-His-DPhe-Arg-Trp-NH2 с двухвалентным агонистом Ac-His-DPhe-Arg-Trp-PEDG20-His-DPhe-Arg-Trp-NH2: двухвалентный Преимущество". ACS Chemical Neuroscience. 8 (6): 1262–1278. Дои:10.1021 / acschemneuro.6b00399. ЧВК  5679024. PMID  28128928.
  23. ^ а б Xu L, Josan JS, Vagner J, Caplan MR, Hruby VJ, Mash EA, Lynch RM, Morse DL, Gillies RJ (декабрь 2012 г.). «Гетеробивалентные лиганды нацелены на комбинации рецепторов клеточной поверхности in vivo». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (52): 21295–300. Bibcode:2012PNAS..10921295X. Дои:10.1073 / pnas.1211762109. JSTOR  42553664. ЧВК  3535626. PMID  23236171.
  24. ^ а б Lensing CJ, Freeman KT, Schnell SM, Adank DN, Speth RC, Haskell-Luevano C (апрель 2016 г.). «Исследование in vitro и in vivo бивалентных лигандов, которые демонстрируют преимущественное связывание и функциональную активность для различных гомодимеров рецептора меланокортина». Журнал медицинской химии. 59 (7): 3112–28. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.5b01894. ЧВК  5679017. PMID  26959173.
  25. ^ Шонберг Дж., Скаммеллс П. Дж., Капуано Б. (июнь 2011 г.). «Стратегии дизайна для двухвалентных лигандов, нацеленных на GPCR». ChemMedChem. 6 (6): 963–74. Дои:10.1002 / cmdc.201100101. PMID  21520422. S2CID  10561038.
  26. ^ Берк-Бестель I, Лезуальч Ф., Джокерс Р. (декабрь 2008 г.). «Бивалентные лиганды как специфические фармакологические инструменты для димеров рецепторов, связанных с G-белком». Современные технологии открытия лекарств. 5 (4): 312–8. Дои:10.2174/157016308786733591. PMID  19075611.
  27. ^ Акгюн Э., Джавед М.И., Лунцер М.М., Пауэрс М.Д., Шам Й.Й., Ватанабе Й., Портогезе П.С. (ноябрь 2015 г.). «Ингибирование воспалительной и нейропатической боли путем нацеливания на опиоидный рецептор Mu / гетеромер хемокинового рецептора5 (MOR-CCR5)». Журнал медицинской химии. 58 (21): 8647–57. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.5b01245. ЧВК  5055304. PMID  26451468.
  28. ^ Дэниэлс DJ, Ленард Н.Р., Этьен С.Л., Ло П.Й., Рериг С.К., Портогезе П.С. (декабрь 2005 г.). «Индуцированная опиоидами толерантность и зависимость у мышей модулируется расстоянием между фармакофорами в серии двухвалентных лигандов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (52): 19208–13. Bibcode:2005PNAS..10219208D. Дои:10.1073 / pnas.0506627102. JSTOR  4152590. ЧВК  1323165. PMID  16365317.
  29. ^ Смейстер Б.А., Лунцер М.М., Акгюн Э., Бейтц А.Дж., Портогезе П.С. (ноябрь 2014 г.). «Нацеливание на предполагаемые гетеромеры мю-опиоидного / метаботропного рецептора глутамата-5 приводит к сильной антиноцицепции в модели хронического рака костей у мышей». Европейский журнал фармакологии. 743: 48–52. Дои:10.1016 / j.ejphar.2014.09.008. ЧВК  4259840. PMID  25239072.
  30. ^ Абрусан Г., Марш Дж. А. (2019). «Структура сайта связывания лиганда формирует складывание, сборку и деградацию гомомерных белковых комплексов». Журнал молекулярной биологии. 431 (19): 3871–3888. Дои:10.1016 / j.jmb.2019.07.014. ЧВК  6739599. PMID  31306664.
  31. ^ Абрусан Г., Марш Дж. А. (2018). «Структура сайта связывания лиганда влияет на эволюцию функции и топологии белкового комплекса». Отчеты по ячейкам. 22 (12): 3265–3276. Дои:10.1016 / j.celrep.2018.02.085. ЧВК  5873459. PMID  29562182.
  32. ^ Абрусан Г., Марш Дж. А. (2019). «Структура сайта связывания лиганда формирует передачу аллостерического сигнала и эволюцию аллостерии в белковых комплексах». Молекулярная биология и эволюция. 36 (8): 1711–1727. Дои:10.1093 / molbev / msz093. ЧВК  6657754. PMID  31004156.
  33. ^ Welsch ME, Snyder SA, Stockwell BR (июнь 2010 г.). «Привилегированные платформы для разработки библиотек и открытия лекарств». Современное мнение в области химической биологии. 14 (3): 347–61. Дои:10.1016 / j.cbpa.2010.02.018. ЧВК  2908274. PMID  20303320.
  34. ^ Комбаров Р., Алтиери А., Генис Д., Кирпиченок М., Кочубей В., Ракитина Н., Титаренко З. (февраль 2010 г.). «BioCores: идентификация привилегированного структурного мотива на основе лекарственного средства / натурального продукта для открытия низкомолекулярного свинца». Молекулярное разнообразие. 14 (1): 193–200. Дои:10.1007 / s11030-009-9157-5. PMID  19468851. S2CID  23331540.

внешняя ссылка

  • BindingDB, общедоступная база данных измеренных аффинностей связывания белок-лиганд.
  • БиоЛиП, обширная база данных о взаимодействиях лиганд-белок.