Номенклатура нуклеиновых кислот - Википедия - Nucleic acid nomenclature

Смотрите также: Направленность (молекулярная биология)
Пронумерованный рибоза углерод на цитидин.

Молекулярные биологи используйте несколько сокращенных терминов при упоминании нуклеиновая кислота молекулы, такие как ДНК и РНК, вместе именуемые номенклатура нуклеиновых кислот.

Самым распространенным является представление пар оснований как буквы - аденин нуклеотид сокращенно А, гуанин в качестве грамм, цитозин в качестве C, тимин в качестве Т, а в РНК урацил в качестве U.

Кроме того, позиции угли в рибоза сахара, которые образуют основу цепи нуклеиновой кислоты, пронумерованы и используются для указания направления нуклеиновых кислот (5 '-> 3' против 3 '-> 5'). Это называется направленность.

Расширенный буквенный код

В дополнение к обычным символам GATC существует расширенный буквенный код для обозначения позиции в последовательности, которая может быть гибкой при определении последовательностей.

ПисьмоВключенный нуклеотид (ы)
АА
ТТ
граммграмм
CC
UU
рG или A
YТ или С
MА или С
KG или T
SG или C
WА или Т
ЧАСA или C или T
BG или T или C
VG или C или A
DG или T или A
NG или T или A или C

Например, если известно, что последовательности, связывающие белок X, представляют собой AAAAAAGAAA, AAAAAACAAA, AAAAAATAAA и AAAAAAAAAA, это можно выразить как AAAAAANAAA.

Базовое соединение Triple Helix

Пары оснований Watson и Crick обозначаются знаком «•», «-» или «». (пример: A • T или поли (rC) • 2poly (rC)).

Hoogsteen тройная спираль пары оснований обозначаются знаком «*» или «:» (например: C • G * G +, или T • A * T, или C • G * G, или T • A * A).

Смотрите также