Транспептидаза для сортировки белков - Википедия - Protein-sorting transpeptidase

А протеин-сортирующая транспептидаза является фермент, такой как сортировка SrtA[1] из Золотистый стафилококк, который расщепляет один или несколько белков-мишеней, продуцируемых одной и той же клеткой, как часть специализированного пути нацеливание на белок. Типичная прокариотическая транспептидаза, сортирующая белок, характеризуется как протеаза, но не просто гидролизует пептидную связь. Вместо этого более крупная N-концевая часть расщепленного полипептида переносится на другую молекулу, такую ​​как предшественник пептидогликан клеточная стенка в Грамположительные бактерии.

Период, термин сортировка правильно зарезервирован для набора цистеиновая протеаза ферменты sortase A, sortase B, и члены дополнительных классов, все из которых имеют гомологию. Однако у прокариот описывается все большее количество дополнительных систем сортировки белков, включающих ферменты сортировки, которые не обладают какой-либо гомологией с сортировкой и которые, по-видимому, возникли отдельно благодаря конвергентная эволюция. Хотя сортазы являются наиболее хорошо описанными членами транспептидаз, сортирующих белок, работают над аналогичными ферментами. археосортаза[2], ромбосортаза[3], а фермент PorU типа IX системы секреции (T9SS)[4] накапливается.

сортирующий ферментмеханизмродственный сигнал сортировки
sortase Aцистеиновая протеазаLPXTG
sortase Bцистеиновая протеазаNPQTN
археосортаза Ацистеиновая протеазаPGF-CTERM
экзосортаза Ацистеиновая протеазаPEP-CTERM
ромбосортазасериновая протеазаGlyGly-CTERM
PorU как в Porphyromonas gingivalisсериновая протеазаT9SS C-терминальный бета-сэндвич-домен

Рекомендации

  1. ^ Zong Y, Bice TW, Ton-That H, Schneewind O, Narayana SV (2004). «Кристаллические структуры сортазы A Staphylococcus aureus и его субстратного комплекса». J Biol Chem. 279 (30): 31383–9. Дои:10.1074 / jbc.M401374200. PMID  15117963.
  2. ^ Абдул Халим М.Ф., Родригес Р., Штольцфус Д.Д., Дуггин И.Г., Полшредер М. (2018). «Сохраненные остатки имеют решающее значение для каталитической активности археосортазы Haloferax volcanii: последствия для конвергентной эволюции каталитических механизмов негомологичных сортаз из архей и бактерий». Мол Микробиол. 108 (3): 276–287. Дои:10,1111 / мми.13935. PMID  29465796.
  3. ^ Гадвал С., Джонсон Т.Л., Реммер Х., Сандквист М. (2018). «С-концевой процессинг GlyGly-CTERM-содержащих белков ромбосортазой в Vibrio cholerae». PLoS Pathog. 14 (10): e1007341. Дои:10.1371 / journal.ppat.1007341. ЧВК  6219818. PMID  30352106.
  4. ^ de Diego I, Ksiazek M, Mizgalska D, Koneru L, Golik P, Szmigielski B, et al. (2016). «Сигнал экспорта внешней мембраны системы секреции Porphyromonas gingivalis типа IX (T9SS) представляет собой консервативный С-концевой β-сэндвич-домен». Научный представитель. 6: 23123. Дои:10.1038 / srep23123. ЧВК  4804311. PMID  27005013.