APOBEC4 - APOBEC4

APOBEC4
Идентификаторы
ПсевдонимыAPOBEC4, C1orf169, фермент редактирования мРНК аполипопротеина B каталитический полипептид, подобный 4
Внешние идентификаторыOMIM: 609908 MGI: 1918531 ГомолоГен: 52415 Генные карты: APOBEC4
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение APOBEC4
Геномное расположение APOBEC4
Группа1q25.3Начинать183,646,275 бп[1]
Конец183,653,316 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_203454

NM_001081197

RefSeq (белок)

NP_982279

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 183.65 - 183.65 МбChr 1: 152,75 - 152,76 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

C-> U-редактирующий фермент APOBEC-4, также известный как Фермент, редактирующий мРНК аполипопротеина B, каталитический полипептид-подобный 4, это белок что у людей кодируется APOBEC4 ген. Он в первую очередь экспрессируется в семенниках и обнаруживается у млекопитающих, кур, но не у рыб.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует член AID / АПОБЕК семейство полинуклеотидов (дезокси)цитидин дезаминазы, которые конвертируют цитидин к уридин. Другие члены семейства AID / APOBEC участвуют в редактировании мРНК, соматической гипермутации и рекомбинации генов иммуноглобулинов, а также в врожденном иммунитете к ретровирусной инфекции.[6]

Недавнее исследование APOBEC4 (A4) показало интересное открытие, что A4 усиливает репликацию ВИЧ-1 за счет усиления промоторной активности, а также увеличивает экспрессию другого соответствующего промотора, опосредованного повышенной экспрессией белка. Биохимический анализ A4 показал отсутствие активности цитидиндезаминазы на одноцепочечной ДНК, и он довольно слабо связывает ДНК.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173627 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055547 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Рогозин И.Б., Басу М.К., Иордания И.К., Павлов Ю.И., Кунин Е.В. (сентябрь 2005 г.). «APOBEC4, новый член семейства полинуклеотидных (дезокси) цитидиндезаминаз AID / APOBEC, предсказанный с помощью компьютерного анализа». Клеточный цикл. 4 (9): 1281–5. Дои:10.4161 / cc.4.9.1994. PMID  16082223.
  6. ^ а б "Entrez Gene: фермент редактирования мРНК аполипопротеина B".
  7. ^ Марино Д., Перкович М., Хайн А., Ягува Васудеван А.А., Хофманн Х., Ханшманн К.М., Мюлебах М.Д., Шуман Г.Г., Кениг Р., Цичутек К., Хойссингер Д., Мюнк С. (2016). «APOBEC4 усиливает репликацию ВИЧ-1». PLoS One. 11 (6): e0155422. Дои:10.1371 / journal.pone.0155422. ЧВК  4889046. PMID  27249646.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

  • Prochnow C, Bransteitter R, Chen XS (октябрь 2009 г.). «Дезаминазы-мутазы APOBEC с защитными функциями для иммунитета». Наука в Китае Серия C: Науки о жизни. 52 (10): 893–902. Дои:10.1007 / s11427-009-0133-1. PMID  19911124.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.