Caspase 12 - Caspase 12

CASP12
Идентификаторы
ПсевдонимыCASP12, CASP-12, CASP12P1, каспаза 12 (ген / псевдоген)
Внешние идентификаторыOMIM: 608633 Генные карты: CASP12
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение CASP12
Геномное расположение CASP12
Группа11q22.3Начните104,885,718 бп[1]
Конец104,898,670 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001191016

н / д

RefSeq (белок)

NP_001177945

н / д

Расположение (UCSC)Chr 11: 104,89 - 104,9 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Caspase 12 это белок что у людей кодируется CASP12 ген. Белок принадлежит к семейству ферменты называется каспасы которые рассекают их субстраты в C-терминал аспарагиновая кислота остатки. Это тесно связано с каспаза 1 и другие члены семейства каспаз, известные как воспалительные каспазы, которые обрабатывают и активируют воспалительные цитокины такие как интерлейкин 1 и интерлейкин 18.

Ген

Он находится на хромосома 11 у людей в локус с другими воспалительными каспазами.[3]CASP12 ортологи[4] были идентифицированы во многих млекопитающие для которого доступны полные данные о геноме.

Клиническое значение

CASP12 ген подлежит полиморфизм, который может генерировать полноразмерный белок каспазы (Csp12L) или неактивную усеченную форму (Csp12S). Функциональная форма, кажется, ограничена людьми Африканский происхождение и связано с восприимчивостью к сепсис; люди, несущие функциональный ген, имеют пониженную реакцию на бактериальные молекулы, такие как липополисахарид (ЛПС).[5][6]

Исследование, проведенное в мае 2009 года Медицинским центром Университета Макгилла, показало, что эстроген может блокировать производство каспазы-12, что приводит к более сильной воспалительной реакции на бактериальные патогены. Испытания проводились на лабораторных мышах, которым был имплантирован ген каспазы-12 человека.[7][8][9]

Неактивная усеченная форма (Csp12S) CASP12 ген был распространен и почти зафиксирован среди неафриканского населения из-за положительный выбор возможно, начало 60–100 тысяч лет назад. Считается, что его селективным преимуществом является устойчивость к сепсису среди популяций, которые перенесли больше инфекционных заболеваний по мере увеличения численности и плотности населения.[10][11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000204403 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Фишер Х, Кениг У, Экхарт Л, Чахлер Э (2002). «Человеческая каспаза 12 приобрела вредные мутации». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 293 (2): 722–6. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00289-9. PMID  12054529.
  4. ^ «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP12».[постоянная мертвая ссылка ]
  5. ^ Салех М., Вайланкур Дж. П., Грэм Р. К., Хайк М., Сринивасула С. М., Алнемри Е. С., Штейнберг М. Х., Нолан В., Болдуин С. Т., Хотчкисс Р. С., Бухман Т. Г., Зенбауэр Б. А., Хайден М. Р., Фаррер Л. А., Рой С., Николсон Д. В. (2004) . «Дифференциальная модуляция реакции эндотоксина полиморфизмами человеческой каспазы-12». Природа. 429 (6987): 75–9. Дои:10.1038 / природа02451. PMID  15129283.
  6. ^ Салех, Майя Мэтисон; Джон К. Волински; Мелисса К. Бенсингер; Стив Дж. Фицджеральд; Патрик Дроин; Натали Улевич; Ричард Дж. Грин; Дуглас Р. Николсон; Дональд В. (2006). «Повышенный бактериальный клиренс и устойчивость к сепсису у мышей с дефицитом каспазы-12». Природа. 440 (7087): 1064–1068. Дои:10.1038 / природа04656. PMID  16625199. S2CID  4321520.
  7. ^ Еретссиан Дж., Дуарон К., Шао В., Ливитт Б. Р., Хайден М. Р., Николсон Д. В., Салех М. (май 2009 г.). «Гендерные различия в экспрессии длинного варианта каспазы-12 человека определяют восприимчивость к инфекции Listeria monocytogenes». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 106 (22): 9016–20. Дои:10.1073 / pnas.0813362106. ЧВК  2690057. PMID  19447924.
  8. ^ «Мужской грипп: реальность или миф?». Здоровье. NHS UK. 18 мая 2009 г.
  9. ^ «Женщины лучше борются с болезнями'". Здоровье. Новости BBC. 13 мая 2009 года. Получено 13 мая 2009.
  10. ^ Сюэ, Яли; Дэли, Аллан; Ингвадоттир, Бриндис; Лю, Мэннин; Куп, Грэм; Ким, Юсоб; Сабети, Пардис; Чен, юань; Сталкер, Джим; Хакл, Элизабет; Бертон, Джон; Леонард, Стивен; Роджерс, Джейн; Тайлер-Смит, Крис (2006). «Распространение неактивной формы каспазы-12 у людей связано с недавним положительным отбором». Американский журнал генетики человека. 78 (4): 659–670. Дои:10.1086/503116. ЧВК  1424700. PMID  16532395.
  11. ^ Ван, Сяося; Грус, Венди Э .; Чжан, Цзяньчжи (2006). «Потери генов при происхождении человека». PLOS Биология. 4 (3): e52. Дои:10.1371 / journal.pbio.0040052. ЧВК  1361800. PMID  16464126.

внешняя ссылка

  • В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: C14.013