XCL1 - XCL1

XCL1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыXCL1, ATAC, LPTN, LTN, SCM-1, SCM-1a, SCM1, SCM1A, SCYC1, хемокиновый лиганд 1 мотива X-C
Внешние идентификаторыOMIM: 600250 MGI: 104593 ГомолоГен: 2250 Генные карты: XCL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение XCL1
Геномное расположение XCL1
Группа1q24.2Начинать168,576,605 бп[1]
Конец168,582,069 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002995

NM_008510

RefSeq (белок)

NP_002986

NP_032536

Расположение (UCSC)Chr 1: 168,58 - 168,58 МбChr 1: 164.93 - 164.94 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Хемокиновый (мотив C) лиганд (XCL1) - небольшой цитокин принадлежащий C хемокин семья, которая также известна как лимфотактин. Хемокины известны своей функцией при воспалительных и иммунологических ответах. Эти хемокины семейства C отличаются по структуре и функциям от большинства хемокинов.[5][6] В этом семействе всего два хемокина, и что отличает их от других хемокинов, так это то, что они содержат только два цистеина; один N-концевой цистеин и один цистеин ниже по течению. Оба они называются лимфотактином в альфа- и бета-формах и обладают особыми характеристиками, которые встречаются только между ними двумя. Лимфотактины могут претерпевать обратимые конформационные изменения, которые меняют сдвиги связывания.[7]

В нормальных тканях XCL1 обнаруживается в больших количествах в селезенка, вилочковая железа, тонкий кишечник и периферическая кровь лейкоциты, а на более низких уровнях в легкое, простата и яичник. Секреция XCL1 ответственна за увеличение внутриклеточного кальция в лимфоцитах периферической крови.[8] Клеточные источники XCL1 включают активированный тимус и CD8 + периферической крови. Т-клетки.[9][10][11] NK-клетки также секретируют XCL1 вместе с другими хемокинами на ранних стадиях инфекций.[12] XCR1, выражающий дендритные клетки (DC) являются основной целью XCL1.[12]

У людей XCL1 тесно связан с другим хемокином, называемым XCL2, чей ген находится в том же локус на хромосома 1.[11] Оба эти хемокина имеют много генетических и функциональных сходств; однако известно, что XCL2 наблюдается только у людей, но не у мышей.[12] XCL1 индуцирует хемотаксическую функцию, связываясь с хемокиновый рецептор называется XCR1.[13] XCL1 экспрессируется на макрофаги, фибробласты, и конкретные лимфоциты.[6]

LTN находится в двух состояниях: мономер при 10 ° C, LTN10, и димер при 40 ° C, LTN40.[14]

Геномика

Ген XCL1 находится на длинном плече хромосомы 1, расположенном на цитогенетической полосе q24.2, как видно в информационном окне. Кодирующий ген состоит из 6017 оснований ДНК для кодирования белка XCL1.[15] Этот ген содержит три экзона и два интрона, а также несколько сайтов инициации транскрипции.[8] Этот ген кодирует белок из 114 аминокислот, называемый XCL1, который похож на другие хемокины, за исключением того, что у него отсутствуют первые и третьи характеристики цистеина. Это означает, что XCL1 содержит только один цистеин, образующий дисульфидную связь, вместо двух или трех, как другие хемокины.[5]

Генетические различия между XCL1 и XCL2 очень маленькие. Оба белка принадлежат к одному семейству, содержащему структуру мотива C, содержащего одну дисульфидную связь, и имеют почти идентичные третичные структуры.[8] Эти хемокины C также имеют одинаковые фланкирующие области, то есть области гена, включая промоутер и другие места переедания белков, которые не вносят вклад в ген, транскрибируемый РНК.[8] Генное картирование этого семейства хемокинов показывает сходство в их интрон и экзон локации с одним явным отличием. XCL1 имеет только одно отличие в своем первом интроне, который кодирует большой рибосомальный субъединица называется L7a. В XCL2 обрезана область, кодирующая L7a.[8] Единственное другое генетическое различие между двумя зрелыми белками - это разные аминокислоты в положениях 7 и 8.[8][12] Эта разница в аминокислотах может объяснить некоторые биологические различия. Некоторые трудности при сравнении этих двух хемокинов заключаются в том, что XCL2 никогда не наблюдался у мышей.[12]

Структура

Одна вещь, которая отличает XCL1 от других цитокины это его структура.[7] В то время как большинство хемокинов имеют две дисульфидные связи, которые соединяют N-конец с ядром структуры, XCL1 имеет только одну.[5] Это простое различие в дисульфидных связях изменяет общую третичную структуру XCL1 от других хемокинов. Есть две части белка лимфотактина, структуры Ltn10 и Ltn40, которые складываются друг в друга, что делает его биологически активный.[7] Это конформационное изменение изменяет связывающие структуры хемокина. Такое понимание взаимосвязи дает больше основы для понимания лимфотактин кинетика.[7]

Биологическое значение

Большая часть секретируемого XCL1 поступает из определенного вида дендритных клеток, которые участвуют в антигенах. перекрестное представление.[12] Это означает, что XCL1 участвует в активации цитотоксических Т-клеток дендритными клетками. XCL1 также может секретироваться NK-клетки вместе с другими хемокинами в начале инфекции. Это было связано с защитой Т-хелперных клеток 1 типа.[12] Эта секреция также способствует взаимодействию NK-клеток с DC, содержащим XCR1 на своей поверхности. Таким же образом секреция XCL1 побуждает цитотоксические Т-клетки также связываться с DC, содержащими SCR1.[12]

Пара XCL1 и XCR1 как известно, участвуют в перекрестное представление, захват антигена и индукция врожденного, а также адаптивного цитотоксического иммунитета.[12]

Также известно, что XCL1 увеличивает количество Т-лимфоцитов в суставах, на которые воздействуют ревматоидный артрит.[6] Они также экспрессируются на синовиальных лимфоцитах RA.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143184 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026573 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c Ван X, Sharp JS, Handel TM, Prestegard JH (2013). «Олигомеризация хемокинов в передаче сигналов и миграции клеток». В Giraldo J, Ciruela F (ред.). Прогресс в молекулярной биологии и переводческой науке. 117. С. 531–578. Дои:10.1016 / B978-0-12-386931-9.00020-9. ISBN  978-0-12-386931-9. ЧВК  3937849. PMID  23663982.
  6. ^ а б c d Секанец З., Кох А.Е. (2017). «Набор клеток и ангиогенез». В Firestein GS, Budd RC, Gabriel SE, McInnes IB, O'Dell JR (ред.). Учебник ревматологии Келли и Файрстайна. Эльзевир. С. 384–395. Дои:10.1016 / B978-0-323-31696-5.00025-5. ISBN  978-0-323-31696-5.
  7. ^ а б c d Хундейкер М (2009). «[Клиническая картина воздействия радиации на кожу]». Strahlenschutz in Forschung Und Praxis. 28: 160–4. Дои:10.1016 / S0076-6879 (09) 05403-2. ЧВК  3686570. PMID  19480914.
  8. ^ а б c d е ж Ёсида Т., Имаи Т., Такаги С., Нисимура М., Исикава И., Яой Т., Ёси О (14 октября 1996 г.). «Структура и экспрессия двух очень родственных генов, кодирующих SCM-1 / лимфотактин человека». Письма FEBS. 395 (1): 82–88. Дои:10.1016/0014-5793(96)01004-6. PMID  8849694.
  9. ^ Келнер Г.С., Кеннеди Дж., Бэкон К.Б., Клейенстойбер С., Ларгаэспада Д.А., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г., Базан Дж.Ф., Мур К.В., Шалл Т.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Лимфотактин: цитокин, представляющий новый класс хемокинов». Наука. 266 (5189): 1395–9. Дои:10.1126 / science.7973732. PMID  7973732.
  10. ^ Кеннеди Дж., Кельнер Г.С., Клейенштайбер С., Шалл Т.Дж., Вайс М.С., Иссел Х., Шнайдер П.В., Кокс Б.Г., Бэкон К.Б., Злотник А. (июль 1995 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика лимфотактина человека». Журнал иммунологии. 155 (1): 203–9. PMID  7602097.
  11. ^ а б Ёсида Т., Имаи Т., Такаги С., Нисимура М., Исикава И., Яой Т., Ёси О (октябрь 1996 г.). «Структура и экспрессия двух очень родственных генов, кодирующих SCM-1 / лимфотактин человека». Письма FEBS. 395 (1): 82–8. Дои:10.1016/0014-5793(96)01004-6. PMID  8849694.
  12. ^ а б c d е ж грамм час я Крочек Р.А., Хенн В. (10 февраля 2012 г.). «Роль XCR1 и его лиганда XCL1 в перекрестной презентации антигена дендритными клетками мыши и человека». Передний. Иммунол. 3 (14). Дои:10.3389 / fimmu.2012.00014. ЧВК  3342032. PMID  22566900.
  13. ^ Ёсида Т., Имаи Т., Какидзаки М., Нисимура М., Такаги С., Ёси О (июнь 1998 г.). «Идентификация одиночного C-мотива-1 / рецептора лимфотактина XCR1». Журнал биологической химии. 273 (26): 16551–4. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16551. PMID  9632725.
  14. ^ Тайлер Р.К., Мюррей, штат Нью-Джерси, Петерсон, Фолькман, Б.Ф. (август 2011 г.). «Взаимопревращение метаморфического белка в естественном состоянии требует глобального развертывания». Биохимия. 50 (33): 7077–9. Дои:10.1021 / bi200750k. ЧВК  3160782. PMID  21776971.
  15. ^ «Ген XCL1 (кодирование белка)». База данных генов человека GeneCards.