KCNA4 - KCNA4

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

Калиевый канал Kv1.4 тандемный домен инактивации
	структура раствора тандемного домена инактивации (остатки 1-75) калиевого канала rck4 (kv1.4)
Идентификаторы
Символ	K_channel_TID
Pfam	PF07941
ИнтерПро	IPR012897
SCOP2	1kn7 / Объем / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

KCNA4
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNA4, HBK4, HK1, HPCN2, HUKII, KCNA4L, KCNA8, KV1.4, PCN2, калиевый потенциалзависимый канал, член подсемейства A 4, MCIDDS
Внешние идентификаторы	OMIM: 176266 MGI: 96661 ГомолоГен: 20514 Генные карты: KCNA4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	30,017,030 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	107,298,502 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность калиевого канала; • связывание ионов калия; • активность потенциалзависимого ионного канала; • активность ионного канала; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность потенциалзависимого калиевого канала; • задержка активности калиевого канала выпрямителя;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • проекция клетки; • мембрана; • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов; • клеточная мембрана; • аксон; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • дендритный позвоночник;
Биологический процесс	• регуляция трансмембранного транспорта ионов; • ионный транспорт; • транспорт ионов калия; • трансмембранный транспорт; • трансмембранный транспорт ионов калия; • гомоолигомеризация белков;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3739
	16492
	ENSG00000182255
	ENSMUSG00000042604
	P22459
	Q61423
	NM_002233
	NM_021275
	NP_002224
	NP_067250
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Калий потенциалзависимый канал подсемейства A член 4 также известен как K_v1.4 это белок что у людей кодируется KCNA4 ген.^[5]^[6]^[7] Это способствует кардиальный транзиторный выходящий калиевый ток (Я_to1), основной ток, вносящий вклад в переполяризация фаза 1 сердечного потенциала действия.^[8]

Описание

Калиевые каналы представляют собой наиболее сложный класс потенциалзависимых ионных каналов как с функциональной, так и с структурной точки зрения. Их разнообразные функции включают регулирование высвобождения нейромедиаторов, частоты сердечных сокращений, секреции инсулина, возбудимости нейронов, транспорта электролитов эпителия, сокращения гладких мышц и объема клеток. Четыре связанных с последовательностью гена калиевых каналов - shaker, shaw, shab и shal - были идентифицированы у дрозофилы, и было показано, что каждый имеет гомолог (ы) человека. Этот ген кодирует член подсемейства, зависимого от напряжения, связанного с шейкерной системой, калиевого канала. Этот член содержит шесть трансмембранных доменов с повтором шейкерного типа в четвертом сегменте. Он принадлежит к классу калиевого тока А-типа, члены которого могут играть важную роль в регуляции быстрой реполяризующей фазы потенциалов действия в сердце и, таким образом, могут влиять на продолжительность сердечного потенциала действия. Кодирующая область этого гена не имеет интронов, и этот ген сгруппирован с генами KCNA3 и KCNA10 на хромосоме 1 у человека.^[7]

KCNA4 (Kv1.4) содержит тандемный домен инактивации в N конечная. Он состоит из двух поддоменов. Домен инактивации 1 (ID1, остатки 1-38) состоит из гибкого N-конца, закрепленного на 5-витке. спираль, и считается, что он работает, перекрывая путь иона, как в случае с классическим шаровым доменом. Домен инактивации 2 (ID2, остатки 40-50) представляет собой спираль на 2,5 витка с высокой долей гидрофобных остатков, которые, вероятно, служат для присоединения ID1 к цитоплазматический лицо канала. Таким образом, он может способствовать быстрому доступу ID1 к рецепторному участку в открытом канале. ID1 и ID2 функционируют вместе, чтобы вызвать быструю инактивацию канала Kv1.4, что важно для роли канала в краткосрочной пластичности.^[9]

Взаимодействия

KCNA4 показал взаимодействовать с участием DLG4,^[10]^[11]^[12]^[13] KCNA2^[14] и DLG1.^[10]^[12]^[15]

Смотрите также

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182255 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042604 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Philipson LH, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Steiner DF (декабрь 1990 г.). «Последовательность кДНК калиевого канала скелетных мышц плода человека, родственная RCK4». Исследования нуклеиновых кислот. 18 (23): 7160. Дои:10.1093 / nar / 18.23.7160. ЧВК 332806. PMID 2263489.
^ Гутман Г.А., Чанди К.Г., Гриссмер С., Лаздунски М., Маккиннон Д., Пардо Л.А. и др. (Декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные отношения потенциалзависимых калиевых каналов". Фармакологические обзоры. 57 (4): 473–508. Дои:10.1124 / пр.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.
^ ^а ^б «Ген Entrez: потенциал-зависимый канал KCNA4, связанное с шейкером подсемейство, член 4».
^ Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного выходящего калиевого тока (I (to)) в нормальном и больном миокарде». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 33 (5): 851–72. Дои:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.
^ Виссманн Р., Бильдл В., Оливер Д., Бейерманн М., Калбицер Х.Р., Бентроп Д., Факлер Б. (май 2003 г.). «Структура раствора и функция« тандемного домена инактивации »нейронального калиевого канала A-типа Kv1.4». Журнал биологической химии. 278 (18): 16142–50. Дои:10.1074 / jbc.M210191200. PMID 12590144.
^ ^а ^б Инанобе А., Фудзита А., Ито М., Томоике Х., Инагеда К., Курачи Ю. (июнь 2002 г.). «Внутренний выпрямительный K + канал Kir2.3 локализован на постсинаптической мембране возбуждающих синапсов». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология. 282 (6): C1396-403. Дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.
^ Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 693–707. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID 9581762. S2CID 16068361.
^ ^а ^б Ким Э, Шэн М. (1996). «Дифференциальная кластерная активность K + каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембран-ассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. Дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID 8938729. S2CID 23755452.
^ Элдстром Дж., Дёрксен К.В., Стил Д.Ф., Федида Д. (ноябрь 2002 г.). «N-концевой PDZ-связывающий домен в калиевых каналах Kv1». Письма FEBS. 531 (3): 529–37. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03572-X. PMID 12435606. S2CID 40689829.
^ Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж. О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека». Журнал нейрохимии. 73 (2): 849–58. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084. S2CID 20632070.
^ Элдстром Дж, Чой В.С., Стил Д.Ф., Федида Д. (июль 2003 г.). «SAP97 увеличивает токи Kv1,5 посредством непрямого N-терминального механизма». Письма FEBS. 547 (1–3): 205–11. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00668-9. PMID 12860415. S2CID 34857270.

дальнейшее чтение

Скотт Х. С., Литдженс Т., Хопвуд Дж. Дж., Моррис С. П. (ноябрь 1992 г.). «Обнаружение ПЦР двух RFLP в экзоне I гена альфа-L-идуронидазы (IDUA)». Генетика человека. 90 (3): 327. Дои:10.1007 / bf00220095. PMID 1362562. S2CID 22700269.
Гесслер М., Группа А, Гжещик К.Х., Понгс О. (ноябрь 1992 г.). «Ген калиевого канала HK1 отображается на хромосоме 11p14.1 человека, близкой к гену FSHB». Генетика человека. 90 (3): 319–21. Дои:10.1007 / bf00220091. PMID 1487251. S2CID 10237322.
Philipson LH, Hice RE, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Nelson DJ, Steiner DF (январь 1991 г.). «Последовательность и функциональная экспрессия в ооцитах Xenopus инсулиномы человека и островковых калиевых каналах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (1): 53–7. Bibcode:1991ПНАС ... 88 ... 53П. Дои:10.1073 / pnas.88.1.53. ЧВК 50746. PMID 1986382.
Тамкун М.М., Кнот К.М., Уолбридж Д.А., Кремер Х., Роден Д.М., Гловер Д.М. (март 1991 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика двух потенциал-зависимых кДНК K + канала из человеческого желудочка». Журнал FASEB. 5 (3): 331–7. Дои:10.1096 / fasebj.5.3.2001794. PMID 2001794. S2CID 23737559.
Ким Е., Нитхаммер М., Ротшильд А., Ян Ю.Н., Шенг М. (ноябрь 1995 г.). «Кластеризация K + каналов шейкерного типа путем взаимодействия с семейством мембраносвязанных гуанилаткиназ». Природа. 378 (6552): 85–8. Bibcode:1995 Натур.378 ... 85K. Дои:10.1038 / 378085a0. PMID 7477295. S2CID 4362906.
Клоке Р., Робердс С.Л., Тамкун М.М., Гронемайер М., Огюстен А., Альбрехт Б. и др. (Декабрь 1993 г.). «Хромосомное картирование у мыши восьми генов K (+) - канала, представляющих четыре Shaker-подобных подсемейства Shaker, Shab, Shaw и Shal». Геномика. 18 (3): 568–74. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80358-1. PMID 7905852.
Филипсон Л. Х., Эдди Р. Л., Показывает ТБ, Белл Г. И. (февраль 1993 г.). «Отнесение гена калиевого канала человека KCNA4 (Kv1.4, PCN2) к хромосоме 11q13.4 -> q14.1». Геномика. 15 (2): 463–4. Дои:10.1006 / geno.1993.1094. PMID 8449523.
Niethammer M, Kim E, Sheng M (апрель 1996). «Взаимодействие между С-концом субъединиц рецептора NMDA и множеством членов семейства PSD-95 мембраносвязанных гуанилаткиназ». Журнал неврологии. 16 (7): 2157–63. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-07-02157.1996. ЧВК 6578538. PMID 8601796.
Ким Э, Шэн М. (1997). «Дифференциальная кластерная активность K + каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембран-ассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. Дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID 8938729. S2CID 23755452.
Ким Э., Нейсбитт С., Сюэ Ю.П., Рао А., Ротшильд А., Крейг А.М., Шэн М. (февраль 1997 г.). «GKAP, новый синаптический белок, который взаимодействует с гуанилаткиназоподобным доменом семейства PSD-95 / SAP90 канальных кластерных молекул». Журнал клеточной биологии. 136 (3): 669–78. Дои:10.1083 / jcb.136.3.669. ЧВК 2134290. PMID 9024696.
Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 693–707. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID 9581762. S2CID 16068361.
Brenman JE, Topinka JR, Cooper EC, McGee AW, Rosen J, Milroy T. и др. (Ноябрь 1998 г.). «Локализация постсинаптической плотности-93 в дендритных микротрубочках и взаимодействие с белком 1A, связанным с микротрубочками». Журнал неврологии. 18 (21): 8805–13. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-21-08805.1998. ЧВК 6793550. PMID 9786987.
Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж. О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека». Журнал нейрохимии. 73 (2): 849–58. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084. S2CID 20632070.
D'Adamo MC, Imbrici P, Sponcichetti F, Pessia M (август 1999). «Мутации в гене KCNA1, связанные с синдромом эпизодической атаксии типа 1, нарушают функцию гетеромерного потенциалзависимого канала K (+)». Журнал FASEB. 13 (11): 1335–45. Дои:10.1096 / fasebj.13.11.1335. PMID 10428758. S2CID 12876970.
Hogan A, Shepherd L, Chabot J, Quenneville S, Prescott SM, Topham MK, Gee SH (июль 2001 г.). «Взаимодействие гамма-1-синтрофина с диацилглицерин киназой-дзета. Регуляция ядерной локализации посредством взаимодействий PDZ». Журнал биологической химии. 276 (28): 26526–33. Дои:10.1074 / jbc.M104156200. PMID 11352924.
Чукович Д., Лу Г. В., Вибл Б., Стил Д. Ф., Федида Д. (июнь 2001 г.). «Дискретный аминоконцевой домен калиевых каналов Kv1.5 и Kv1.4 взаимодействует со спектриновыми повторами альфа-актинина-2». Письма FEBS. 498 (1): 87–92. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02505-4. PMID 11389904. S2CID 20622483.
Имамура Ф., Маэда С., Дои Т., Фудзиёси Й. (февраль 2002 г.). «Связывание лиганда второго домена PDZ регулирует кластеризацию PSD-95 с калиевым каналом Kv1.4». Журнал биологической химии. 277 (5): 3640–6. Дои:10.1074 / jbc.M106940200. PMID 11723117.
Piserchio A, Pellegrini M, Mehta S, Blackman SM, Garcia EP, Marshall J, Mierke DF (март 2002 г.). «Домен PDZ1 SAP90. Характеристика структуры и связывания». Журнал биологической химии. 277 (9): 6967–73. Дои:10.1074 / jbc.M109453200. PMID 11744724.

внешние ссылки

Kv1.4 + Калий + Канал в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
KCNA4 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P15385 (Крыса, калиевый потенциалзависимый канал подсемейства А член 4) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR012897

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182255 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042604 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid2263489-5] Philipson LH, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Steiner DF (декабрь 1990 г.). «Последовательность кДНК калиевого канала скелетных мышц плода человека, родственная RCK4». Исследования нуклеиновых кислот. 18 (23): 7160. Дои:10.1093 / nar / 18.23.7160. ЧВК 332806. PMID 2263489.

[pmid16382104-6] Гутман Г.А., Чанди К.Г., Гриссмер С., Лаздунски М., Маккиннон Д., Пардо Л.А. и др. (Декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные отношения потенциалзависимых калиевых каналов". Фармакологические обзоры. 57 (4): 473–508. Дои:10.1124 / пр.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: потенциал-зависимый канал KCNA4, связанное с шейкером подсемейство, член 4».

[oudit-8] Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного выходящего калиевого тока (I (to)) в нормальном и больном миокарде». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 33 (5): 851–72. Дои:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.

[pmid12590144-9] Виссманн Р., Бильдл В., Оливер Д., Бейерманн М., Калбицер Х.Р., Бентроп Д., Факлер Б. (май 2003 г.). «Структура раствора и функция« тандемного домена инактивации »нейронального калиевого канала A-типа Kv1.4». Журнал биологической химии. 278 (18): 16142–50. Дои:10.1074 / jbc.M210191200. PMID 12590144.

[pmid11997254-10] а ^б Инанобе А., Фудзита А., Ито М., Томоике Х., Инагеда К., Курачи Ю. (июнь 2002 г.). «Внутренний выпрямительный K + канал Kir2.3 локализован на постсинаптической мембране возбуждающих синапсов». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология. 282 (6): C1396-403. Дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.

[pmid9581762-11] Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 693–707. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID 9581762. S2CID 16068361.

[pmid8938729-12] а ^б Ким Э, Шэн М. (1996). «Дифференциальная кластерная активность K + каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембран-ассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. Дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID 8938729. S2CID 23755452.

[pmid12435606-13] Элдстром Дж., Дёрксен К.В., Стил Д.Ф., Федида Д. (ноябрь 2002 г.). «N-концевой PDZ-связывающий домен в калиевых каналах Kv1». Письма FEBS. 531 (3): 529–37. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03572-X. PMID 12435606. S2CID 40689829.

[pmid10428084-14] Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж. О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека». Журнал нейрохимии. 73 (2): 849–58. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084. S2CID 20632070.

[pmid12860415-15] Элдстром Дж, Чой В.С., Стил Д.Ф., Федида Д. (июль 2003 г.). «SAP97 увеличивает токи Kv1,5 посредством непрямого N-терминального механизма». Письма FEBS. 547 (1–3): 205–11. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00668-9. PMID 12860415. S2CID 34857270.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]