ASPH - ASPH

ASPH
3rcq.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыASPH, AAH, BAH, CASQ2BP1, FDLAB, HAAH, JCTN, юнктин, аспартат-бета-гидроксилаза
Внешние идентификаторыOMIM: 600582 MGI: 1914186 ГомолоГен: 20910 Генные карты: ASPH
Номер ЕС1.14.11.16
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение ASPH
Геномное расположение ASPH
Группа8q12.3Начните61,500,556 бп[1]
Конец61,714,640 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ASPH 210896 s в формате fs.png

PBB GE ASPH 209135 в формате fs.png

PBB GE ASPH 207284 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)
Расположение (UCSC)Chr 8: 61,5 - 61,71 МбChr 4: 9.45 - 9.67 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Аспартил / аспарагинил бета-гидроксилаза (Ха-ха) является фермент что у людей кодируется ASPH ген.[5][6][7] ASPH - это альфа-кетоглутарат-зависимая гидроксилаза, суперсемейство негемных железосодержащих белков.

Функция

Считается, что этот ген играет важную роль в кальций гомеостаз. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к пяти вариантам транскрипта, которые различаются по трансляции белка, кодированию каталитических доменов и тканевой экспрессии. Различия между этими транскриптами влияют на их функции, которые включают роль в процессе хранения и высвобождения кальция в эндоплазматическом и саркоплазматическом ретикулуме, а также гидроксилирование аспарагиновой кислоты и аспарагина в доменах различных белков, подобных эпидермальному фактору роста.[7]

Клиническое значение

Еще в 1996 году чрезмерное выражение Ха-ха был признан индикатором рака у человека. Дальнейшие исследования выявили повышенную Ха-ха уровни (по-разному в пораженной ткани или сыворотка крови ) с гепатоцеллюлярным (печень ) карцинома[8][9] аденокарцинома (панкреатический рак ),[10] колоректальный рак,[11] рак простаты.[9] и рак легких.[12] Исследование поджелудочной железы[10] показал повышенный Ха-ха только в пораженной ткани, но не в соседней нормальной и воспаленной ткани.

Мутации в ASPH причина Синдром Трабулси.[13]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198363 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028207 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кориот Ф., Гифферс С., Фрей Дж. (Декабрь 1994 г.). «Клонирование и характеристика человеческого гена, кодирующего аспартил бета-гидроксилазу». Ген. 150 (2): 395–9. Дои:10.1016 / 0378-1119 (94) 90460-Х. PMID  7821814.
  6. ^ Lim KY, Hong CS, Kim DH (сентябрь 2000 г.). «Клонирование кДНК и характеристика человеческого сердечного юнктина». Ген. 255 (1): 35–42. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00299-7. PMID  10974562.
  7. ^ а б «Ген Entrez: аспартат-гидроксилаза ASPH».
  8. ^ Инс Н., де ла Монте С.М., Жезлы Дж. Р. (март 2000 г.). «Сверхэкспрессия человеческой аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы связана со злокачественной трансформацией». Исследования рака. 60 (5): 1261–6. PMID  10728685.
  9. ^ а б Сюэ Т., Сюэ XP, Хуан QS, Вэй Л., Сунь К., Сюэ Т. (август 2009 г.). «Моноклональные антитела против аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазы человека, полученные путем иммунизации ДНК». Гибридома. 28 (4): 251–7. Дои:10.1089 / hyb.2009.0017. PMID  19663697.
  10. ^ а б Palumbo KS, Wands JR, Safran H, King T, Carlson RI, de la Monte SM (июль 2002 г.). «Человеческие моноклональные антитела к аспартил (аспарагинил) бета-гидроксилазе: потенциальные биомаркеры карциномы поджелудочной железы». Поджелудочная железа. 25 (1): 39–44. Дои:10.1097/00006676-200207000-00010. PMID  12131769. S2CID  2098747.
  11. ^ «CC Detect - Доступен сывороточный диагностический тест на рак толстой кишки».
  12. ^ Хэмптон Т. (ноябрь 2007 г.). «Новые методы скрининга показывают потенциал для раннего выявления рака легких». JAMA. 298 (17): 1997. Дои:10.1001 / jama.298.17.1997. PMID  17986689.
  13. ^ Пател Н., Хан А.О., Мансур А., Мохамед Дж.Й., Аль-Ассири А., Хаддад Р. и др. (Май 2014 г.). «Мутации в ASPH вызывают лицевой дисморфизм, дислокацию хрусталика, аномалии переднего сегмента и спонтанную фильтрацию пузырьков, или синдром Трабулси». Американский журнал генетики человека. 94 (5): 755–9. Дои:10.1016 / j.ajhg.2014.04.002. ЧВК  4067561. PMID  24768550.

внешние ссылки

  • Человек ASPH расположение генома и ASPH страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q12797 (Аспартил / аспарагинил бета-гидроксилаза) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение