IKZF1 - IKZF1

IKZF1
Идентификаторы
ПсевдонимыIKZF1, Hs.54452, IK1, IKAROS, LYF1, LyF-1, PPP1R92, PRO0758, ZNFN1A1, CVID13, цинковый палец семейства IKAROS 1
Внешние идентификаторыOMIM: 603023 MGI: 1342540 ГомолоГен: 55948 Генные карты: IKZF1
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение IKZF1
Геномное расположение IKZF1
Группа7п12.2Начните50,304,068 бп[1]
Конец50,405,101 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE IKZF1 216901 s в формате fs.png

PBB GE IKZF1 205039 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 7: 50,3 - 50,41 МбChr 11: 11.69 - 11.77 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-связывающий белок Икарос также известен как Цинк-пальцевый протеин 1 семейства Икарос это белок что у людей кодируется IKZF1 ген.[5][6][7]

Икарос - фактор транскрипции

Икарос - это фактор транскрипции, который кодируется IKZF гены семейства Икарос цинковый палец группа. Цинковый палец - это небольшой структурный мотив белка, который позволяет белку связываться с молекулой ДНК или РНК, которая характеризуется координацией одного или нескольких ионов цинка (Zn2+), чтобы стабилизировать складку.

Икарос отображает важные функции в кроветворный системы и является известным регулятором иммунные клетки развитие, в основном в начале В-клетки, CD4 + Т-клетки. Его дисфункция связана с развитием хронического лимфолейкоза.[8] [9] В частности, в последние годы было обнаружено, что Икарос является основным супрессором опухолей, участвующим в остром лимфобластном лейкозе В-клеток человека. [8] и что он также участвует в дифференциации и функции отдельных Т помощник клетки. [10]

Икарос также играет роль на более поздних стадиях развития В-клеток во время VDJ рекомбинация в классе выключателей антитело изотипы и выражение Рецептор В-клеток. [11]

У мышей с нокаутом Ikaros Т-клетки, но не В-клетки, образуются на поздних стадиях развития мышей из-за поздней компенсаторной экспрессии родственного гена Aiolos (IKZF3).[12] Мыши с точечными мутантами Ikaros являются эмбриональными летальными из-за анемии; у них есть серьезные дефекты дифференцировки терминальных эритроцитов и гранулоцитов, а также чрезмерное образование макрофагов.[13] SNP, расположенные около 3 'области IKZF1 у людей, были связаны с восприимчивостью в детстве острый лимфобластный лейкоз (ОЛЛ) [14] а также диабет 1 типа. [15] Эти два эффекта, по-видимому, направлены в противоположные стороны, при этом чувствительность маркирования аллелей к ВСЕ защита от T1D и наоборот.[15]

Гены группы семейства цинковых пальцев Икароса

Семейство Ikaros Zinc Finger (IkZF) факторы транскрипции являются известными регуляторами развития гемопоэтических клеток и многих иммунных клеток, включая клетки CD4.+ Т-клетки.

Семейство IkZF состоит из пяти членов: Ikaros (кодируется геном Ikzf1), Гелиос (Ikzf2 ), Айолос (Ikzf3 ), Эос (Ikzf4 ) и Пегас (Ikzf5 ). Эти факторы содержат N-концевые домены цинковых пальцев (ZF), которые ответственны за опосредование прямых взаимодействий с ДНК, и C-концевые ZF, которые способствуют гомо- и гетеродимеризации между членами семейства IkZF. [16]

IKZF1 активируется в гранулоцитах, В-клетках, CD4 и CD8 Т-клетках и NK-клетках и подавляется в эритробластах, мегакариоцитах и ​​моноцитах.[17]

Дефицит Икароса

Мутация в IKZF1 ген может вызывать дисфункцию фактора транскрипции Икароса. Дисфункция влияет на выражение в В-клетки это может привести к нарушению регуляции передачи сигналов BCR во время развития В-клеток и связано с трансформацией В-клеток. Отмена регулирования может привести к снижению распространение скорость и увеличился апоптоз B-клеток. Дерегулирование может быть связано с лимфопролиферативные расстройства и различные формы лейкемия. [18]

Взаимодействия

IKZF1 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185811 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000018654 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Георгопулос К., Мур Д.Д., Дерфлер Б. (октябрь 1992 г.). «Икарос, ранний лимфоид-специфический фактор транскрипции и предполагаемый медиатор для приверженности Т-лимфоцитам». Наука. 258 (5083): 808–12. Дои:10.1126 / science.1439790. PMID  1439790.
  6. ^ Хам К., Эрнст П., Ло К., Ким Г.С., Терк С., Смейл С.Т. (ноябрь 1994 г.). «Фактор лимфоидной транскрипции LyF-1 кодируется специфическими, альтернативно сплайсированными мРНК, происходящими из гена Ikaros». Молекулярная и клеточная биология. 14 (11): 7111–23. Дои:10.1128 / mcb.14.11.7111. ЧВК  359245. PMID  7935426.
  7. ^ "Entrez Gene: IKZF1 Цинковый палец 1 семейства IKAROS (Ikaros)".
  8. ^ а б Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Роль Икароса в Т-клеточном остром лимфобластном лейкозе». Всемирный журнал биологической химии. 2 (6): 108–14. Дои:10.4331 / wjbc.v2.i6.108. ЧВК  3135856. PMID  21765975.
  9. ^ Oliveira VC, Lacerda MP, Moraes BB, Gomes CP, Maricato JT, Souza OF, et al. (Июль 2019). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые взгляды на злокачественную трансформацию в хронический лимфолейкоз». Журнал биологии лейкоцитов. 106 (3): 581–594. Дои:10.1002 / JLB.MA1118-454R. PMID  31299112. S2CID  196350761.
  10. ^ Пауэлл, доктор медицины, Рид К.А., Срикумар Б.К., Острайх К.Дж. (2019). «+ Дифференцировка Т-хелперных клеток». Границы иммунологии. 10: 1299. Дои:10.3389 / fimmu.2019.01299. ЧВК  6563078. PMID  31244845.
  11. ^ Селларс М., Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Икарос в развитии и функционировании В-клеток». Всемирный журнал биологической химии. 2 (6): 132–9. Дои:10.4331 / wjbc.v2.i6.132. ЧВК  3135860. PMID  21765979.
  12. ^ Георгопулос К., Винанди С., Авиталь Н. (1997). «Роль гена Ikaros в развитии лимфоцитов и гомеостазе». Ежегодный обзор иммунологии. 15: 155–76. Дои:10.1146 / annurev.immunol.15.1.155. PMID  9143685.
  13. ^ Папатанасиу П., Перкинс А.С., Кобб Б.С., Феррини Р., Шридхаран Р., Хойн Г.Ф. и др. (Июль 2003 г.). «Широко распространенная недостаточность дифференцировки гематолимфоидов, вызванная рецессивным аллелем заполнения ниши фактора транскрипции Ikaros». Иммунитет. 19 (1): 131–44. Дои:10.1016 / с1074-7613 (03) 00168-7. PMID  12871645.
  14. ^ Папаэммануил Э., Хоскинг Ф.Дж., Виджаякришнан Дж., Прайс А, Олвер Б., Шеридан Э и др. (Сентябрь 2009 г.). «Локусы на 7p12.2, 10q21.2 и 14q11.2 связаны с риском развития острого лимфобластного лейкоза у детей». Природа Генетика. 41 (9): 1006–10. Дои:10,1038 / нг.430. ЧВК  4915548. PMID  19684604.
  15. ^ а б Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C, Smyth DJ, Schuilenburg H, et al. (Март 2011 г.). «Аллель IKZF1 (Ikaros), отвечающий за предрасположенность к детскому острому лимфобластному лейкозу, защищает от диабета 1 типа». Сахарный диабет. 60 (3): 1041–4. Дои:10.2337 / db10-0446. ЧВК  3046822. PMID  21270240.
  16. ^ Пауэлл, доктор медицины, Рид К.А., Срикумар Б.К., Острайх К.Дж. (06.06.2019). «+ Дифференцировка Т-хелперных клеток». Границы иммунологии. 10: 1299. Дои:10.3389 / fimmu.2019.01299. ЧВК  6563078. PMID  31244845.
  17. ^ Уоткинс Н.А., Гуснанто А., де Боно Б., Де С., Миранда-Сааведра Д., Харди Д.Л. и др. (Май 2009 г.). «HaemAtlas: характеристика экспрессии генов в дифференцированных клетках крови человека». Кровь. 113 (19): e1-9. Дои:10.1182 / кровь-2008-06-162958. ЧВК  2680378. PMID  19228925.
  18. ^ Oliveira VC, Lacerda MP, Moraes BB, Gomes CP, Maricato JT, Souza OF, et al. (Июль 2019). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые взгляды на злокачественную трансформацию в хронический лимфолейкоз». Журнал биологии лейкоцитов. 106 (3): 581–594. Дои:10.1002 / JLB.MA1118-454R. PMID  31299112. S2CID  196350761.
  19. ^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы». Журнал биологической химии. 275 (26): 19594–602. Дои:10.1074 / jbc.M000254200. PMID  10766745.
  20. ^ а б c d Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы». Журнал EMBO. 18 (11): 3090–100. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3090. ЧВК  1171390. PMID  10357820.
  21. ^ а б c d е Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). "Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса". Журнал биологической химии. 277 (31): 27697–705. Дои:10.1074 / jbc.M201694200. PMID  12015313.
  22. ^ Келли С.М., Икеда Т., Койпалли Дж., Авитал Н., Ву Л., Георгопулос К., Морган Б.А. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер Ikaros по димеризации, экспрессируемый в самых ранних гемопоэтических предшественниках». Текущая биология. 8 (9): 508–15. Дои:10.1016 / s0960-9822 (98) 70202-7. PMID  9560339. S2CID  17835058.
  23. ^ Морган Б., Сан Л., Авитал Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Е. и др. (Апрель 1997 г.). «Aiolos, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидом, который взаимодействует с Ikaros, чтобы регулировать дифференцировку лимфоцитов». Журнал EMBO. 16 (8): 2004–13. Дои:10.1093 / emboj / 16.8.2004. ЧВК  1169803. PMID  9155026.
  24. ^ Ким Дж., Сиф С., Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж., Хеллер Е. и др. (Март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах». Иммунитет. 10 (3): 345–55. Дои:10.1016 / с1074-7613 (00) 80034-5. PMID  10204490.
  25. ^ Хонма Ю., Киёсава Х., Мори Т., Огури А., Никайдо Т., Канадзава К. и др. (Март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе». Письма FEBS. 447 (1): 76–80. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 00265-3. PMID  10218586. S2CID  28898354.
  26. ^ Пердомо Дж, Холмс М., Чонг Б., Кроссли М. (декабрь 2000 г.). «Eos и pegasus, два члена семейства белков Ikaros с различными ДНК-связывающими активностями». Журнал биологической химии. 275 (49): 38347–54. Дои:10.1074 / jbc.M005457200. PMID  10978333.
  27. ^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2002 г.). «Взаимодействия Ikaros-CtIP не требуют C-концевого связывающего белка и участвуют в деацетилазонезависимом режиме репрессии». Журнал биологической химии. 277 (26): 23143–9. Дои:10.1074 / jbc.M202079200. PMID  11959865.
  28. ^ Кацумура К. Р., Бресник Э. Х. (апрель 2017 г.). «Революция фактора GATA в гематологии». Кровь. 129 (15): 2092–2102. Дои:10.1182 / кровь-2016-09-687871. ЧВК  5391619. PMID  28179282.

дальнейшее чтение

внешние ссылки