POU2F1 - POU2F1

POU2F1
Белок POU2F1 PDB 1cqt.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPOU2F1, OCT1, OTF1, oct-1B, ПОУ класса 2 гомеобокс 1
Внешние идентификаторыOMIM: 164175 MGI: 101898 ГомолоГен: 37658 Генные карты: POU2F1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение POU2F1
Геномное расположение POU2F1
Группа1q24.2Начинать167,220,876 бп[1]
Конец167,427,345 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POU2F1 206789 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001198783
NM_001198786
NM_002697
NM_001365848
NM_001365849

NM_011137
NM_198932
NM_198933
NM_198934
NM_001368808

RefSeq (белок)

NP_001185712
NP_001185715
NP_002688
NP_001352777
NP_001352778

NP_035267
NP_945150
NP_945151
NP_945152
NP_001355737

Расположение (UCSC)Chr 1: 167.22 - 167.43 МбChr 1: 165.87 - 166 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Домен POU, класс 2, фактор транскрипции 1 это белок что у людей кодируется POU2F1 ген.[5][6]

Взаимодействия

POU2F1 показал взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143190 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000026565 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Робертс С.Б., Сегил Н., Хайнц Н. (октябрь 1991 г.). «Дифференциальное фосфорилирование фактора транскрипции Oct1 во время клеточного цикла». Наука. 253 (5023): 1022–6. Дои:10.1126 / science.1887216. PMID  1887216.
  6. ^ «Ген Entrez: домен POU2F1, POU, класс 2, фактор транскрипции 1».
  7. ^ Не Дж., Сакамото С., Сонг Д., Цюй З., Ота К., Танигучи Т. (март 1998 г.). «Взаимодействие Oct-1 и домена автомодификации поли (АДФ-рибоза) синтетазы». FEBS Lett. 424 (1–2): 27–32. Дои:10.1016 / s0014-5793 (98) 00131-8. PMID  9537509.
  8. ^ а б Префонтен Г.Г., Вальтер Р., Гиффин В., Лемье М.Э., Папа Л., Хаше Р.Дж. (сентябрь 1999 г.). «Селективное связывание рецепторов стероидных гормонов с факторами транскрипции октамера определяет транскрипционный синергизм на промоторе вируса опухоли молочной железы мыши». J. Biol. Chem. 274 (38): 26713–9. Дои:10.1074 / jbc.274.38.26713. PMID  10480874.
  9. ^ Ван Дж. М., Префонтэн Г. Г., Лемье М. Е., Папа Л., Акименко М. А., Хаше Р. Дж. (Октябрь 1999 г.). «Эффекты развития эктопической экспрессии ДНК-связывающего домена глюкокортикоидного рецептора смягчаются аминокислотной заменой, которая препятствует связыванию гомеодомена». Мол. Клетка. Биол. 19 (10): 7106–22. Дои:10.1128 / mcb.19.10.7106. ЧВК  84705. PMID  10490647.
  10. ^ Префонтен Г.Г., Лемье М.Э., Гиффин В., Шильд-Поултер С., Поуп Л., Лакасс Е., Уокер П., Хаше Р.Дж. (июнь 1998 г.). «Рекрутирование факторов транскрипции октамера в ДНК рецептором глюкокортикоидов». Мол. Клетка. Биол. 18 (6): 3416–30. Дои:10.1128 / mcb.18.6.3416. ЧВК  108923. PMID  9584182.
  11. ^ а б McKnight S (июль 2003 г.). «Переключение генов с помощью метаболических ферментов - как вы попали в список приглашенных?». Клетка. 114 (2): 150–2. Дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00563-4. PMID  12887915.
  12. ^ La Boissière S, Hughes T, O'Hare P (январь 1999 г.). «Зависящий от HCF ядерный импорт VP16». EMBO J. 18 (2): 480–9. Дои:10.1093 / emboj / 18.2.480. ЧВК  1171141. PMID  9889203.
  13. ^ Кристи TM, Sharp PA (март 1993 г.). «Очистка клеточного фактора С1, необходимого для стабильного распознавания гомеодомена Oct-1 фактором альфа-трансиндукции вируса простого герпеса (VP16)». J. Biol. Chem. 268 (9): 6525–34. PMID  8454622.
  14. ^ Шильд-Поултер С., Поуп Л., Гиффин В., Кочан Дж. К., Нгзее Дж. К., Трайкова-Андонова М., Хаче Р. Дж. (Май 2001 г.). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию ДНК-зависимой протеинкиназой». J. Biol. Chem. 276 (20): 16848–56. Дои:10.1074 / jbc.M100768200. PMID  11279128.
  15. ^ Матеос Д., Руис М. Т., Прайс Г. Б., Заннис-Хаджопулос М. (октябрь 2002 г.). «Ku-антиген, ориджин-специфический связывающий белок, который связывается с белками репликации, необходим для репликации ДНК млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1578 (1–3): 59–72. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00497-9. PMID  12393188.
  16. ^ Инамото С., Сегил Н., Пан З. К., Кимура М., Рёдер Р. Г. (ноябрь 1997 г.). «Фактор сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (САК), MAT1, нацелен на и усиливает активность САК на доменах POU факторов транскрипции октамера». J. Biol. Chem. 272 (47): 29852–8. Дои:10.1074 / jbc.272.47.29852. PMID  9368058.
  17. ^ Какидзава Т., Миямото Т., Итикава К., Такеда Т., Сузуки С., Мори Дж., Кумагай М., Ямасита К., Хашизуме К. (март 2001 г.). «Медиатор, подавляющий рецепторы ретиноидов и гормонов щитовидной железы, взаимодействует с октамерным фактором транскрипции-1 и действует как репрессор транскрипции». J. Biol. Chem. 276 (13): 9720–5. Дои:10.1074 / jbc.M008531200. PMID  11134019.
  18. ^ а б Вонг М.В., Генри Р.В., Ма Б., Кобаяши Р., Клагес Н., Маттиас П., Струбин М., Эрнандес Н. (январь 1998 г.). «Большая субъединица базального фактора транскрипции SNAPc представляет собой белок домена Myb, который взаимодействует с Oct-1». Мол. Клетка. Биол. 18 (1): 368–77. Дои:10.1128 / mcb.18.1.368. ЧВК  121507. PMID  9418884.
  19. ^ Chasman D, Cepek K, Sharp PA, Pabo CO (октябрь 1999 г.). «Кристаллическая структура пептида OCA-B, связанного с комплексом Oct-1 POU-домен / октамер ДНК: специфическое распознавание интерфейса белок-ДНК». Genes Dev. 13 (20): 2650–7. Дои:10.1101 / гад.13.20.2650. ЧВК  317104. PMID  10541551.
  20. ^ Ли Л., Столлар Е., Чанг Дж., Гроссманн Дж., О'Брайен Р., Лэдбери Дж., Карпентер Б., Робертс С., Луизи Б. (июнь 2001 г.). «Экспрессия фактора транскрипции Oct-1 и характеристика его взаимодействий с коактиватором Bob1». Биохимия. 40 (22): 6580–8. Дои:10.1021 / bi010095x. PMID  11380252.
  21. ^ ван Хил Д.А., Удалова И.А., Де Сильва А.П., Макговерн Д.П., Киноути Ю., Халл Дж., Ленч, Нью-Джерси, Кардон Л.Р., Кэри А.Х., Джуэлл Д.П., Квятковски Д. (май 2002 г.). «Воспалительное заболевание кишечника связано с полиморфизмом TNF, который влияет на взаимодействие между факторами транскрипции OCT1 и NF (-kappa) B». Гм. Мол. Genet. 11 (11): 1281–9. Дои:10.1093 / hmg / 11.11.1281. PMID  12019209.
  22. ^ Какидзава Т., Миямото Т., Итикава К., Канеко А., Судзуки С., Хара М., Нагасава Т., Такеда Т., Мори Джи, Кумагай М., Хашизуме К. (июль 1999 г.). «Функциональное взаимодействие между Oct-1 и рецептором ретиноида X». J. Biol. Chem. 274 (27): 19103–8. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19103. PMID  10383413.
  23. ^ Ховде С., Брукс А., Стронг К., Гейгер Дж. Х. (март 2002 г.). «Кристаллизация комплекса Oct-1 / SNAP190 пептид / ДНК». Acta Crystallogr. D. 58 (Пт 3): 511–2. Дои:10.1107 / s0907444901021461. PMID  11856838.
  24. ^ Ström AC, Forsberg M, Lillhager P, Westin G (июнь 1996 г.). «Факторы транскрипции Sp1 и Oct-1 физически взаимодействуют, регулируя экспрессию гена мяРНК U2 человека». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (11): 1981–6. Дои:10.1093 / nar / 24.11.1981. ЧВК  145891. PMID  8668525.
  25. ^ Gunther M, Laithier M, Brison O (июль 2000 г.). «Набор белков, взаимодействующих с фактором транскрипции Sp1, идентифицированный в результате двухгибридного скрининга». Мол. Клетка. Биохим. 210 (1–2): 131–42. Дои:10.1023 / А: 1007177623283. PMID  10976766.
  26. ^ Цвиллинг С., Аннвейлер А., Вирт Т. (май 1994 г.). «Домены POU транскрипционных факторов Oct1 и Oct2 опосредуют специфическое взаимодействие с TBP». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (9): 1655–62. Дои:10.1093 / nar / 22.9.1655. ЧВК  308045. PMID  8202368.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка