Синтетаза AIR (циклаза FGAM) - AIR synthetase (FGAM cyclase)

фосфорибозилформилглицинамидинцикло-лигаза
Идентификаторы
Номер ЕС6.3.3.1
Количество CAS9023-53-4
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

Синтетаза AIR пятый фермент в de novo синтез пурин нуклеотиды. Катализирует реакцию с образованием 5-аминоимидазол риботид (AIR) из формилглицинамидин-рибонуклеотид FGAM. Эта реакция замыкает кольцо и дает 5-членное имидазольное кольцо пуринового ядра (AIR):

AIR Synthetase.svg

АТФ + 2- (формамидо) -N1- (5-фосфо-β-D-рибозил) ацетамидин АДФ + 5-амино-1- (5-фосфо-β-D-рибозил) имидазол + фосфат + ЧАС+

Синтетаза AIR катализирует перенос кислорода формильной группы в фосфат. Это последовательный механизм, при котором АТФ сначала связывается с ферментом, а АДФ высвобождается последним. Этот фермент гидролизует АТФ, чтобы активировать кислород амида, чтобы осуществить нуклеофильную атаку азотом. У людей и многих других животных этот фермент содержится в трифункциональный пуриновый биосинтетический белок аденозин-3 полипептид.

Номенклатура

В систематическое название к этому классу ферментов относится 2- (формамидо) -N1- (5-фосфорибозил) ацетамидинцикло-лигаза (АДФ-образующая). Другие широко используемые имена включают:

  • Синтетаза AIR,
  • 5'-аминоимидазол-рибонуклеотидсинтетаза,
  • 2- (формамидо) -1-N- (5-фосфорибозил) ацетамидинцикло-лигаза (АДФ-образующая),
  • фосфорибозиламиноимидазолсинтетаза и
  • фосфорибозилформилглицинамидинцикло-лигаза.

Синтез пурина

Пурины - это один из двух типов азотистых гетероциклических оснований, которые являются одним из трех компонентов нуклеотидов, составляющих нуклеиновые кислоты. Синтез может быть de novo или вторым - синтетаза AIR является компонентом de novo путь. Первый обязательный этап пути de novo начинается с фосфорибозилпирофосфата (PRPP), а конечным продуктом является монофосфат инозина (IMP). IMP в конечном итоге превращается в пурины AMP или GMP. Структура пуринового кольца состоит из присоединения 1-2 атомов к сахару рибозы. В de novo Этот путь обычно сохраняется у большинства организмов.

Синтетаза коровьего гороха AIR

Синтетаза AIR содержится в обоих митохондрии и пластиды; митохондриальная форма содержит на 5 аминокислот больше, чем пластидная форма.[1] Этот фермент кодируется одним геном у коровьего гороха, несмотря на то, что он существует в различных формах в пластидах и митохондриях. Это говорит о том, что разные версии могут быть получены из одной расшифровки. Одно исследование предполагает, что существует жесткий транскрипционный контроль pur5, гена, кодирующего синтетазу AIR.[2]

Рекомендации

  1. ^ Гоггин Д.Е., Липскомб Р., Федорова Е., Миллар А.Х., Манн А., Аткинс К.А., Смит П.М. (март 2003 г.). «Двойная внутриклеточная локализация и нацеливание аминоимидазол-рибонуклеотид-синтетазы в коровьем горохе». Физиология растений. 131 (3): 1033–41. Дои:10.1104 / стр.102.015081. ЧВК  166869. PMID  12644656.
  2. ^ Смит П.М., Манн А.Дж., Гоггин Д.Е., Аткинс Калифорния (апрель 1998 г.). «Синтетаза AIR в клубеньках коровьего гороха: продукт одного гена, направленный на две органеллы?». Завод Мол. Биол. 36 (6): 811–20. Дои:10.1023 / А: 1005969830314. PMID  9520274.

дальнейшее чтение

  • Левенберг Б., Бьюкенен Дж. М. (1957). «Биосинтез пуринов. XII. Структура, ферментативный синтез и метаболизм 5-аминоимидазол риботида». J. Biol. Chem. 224 (2): 1005–18. PMID  13405929.
  • Левенберг Б., Бьюкенен Дж. М. (1957). «Биосинтез пуринов. XIII. Структура, ферментативный синтез и метаболизм (альфа-N-формил) -глицинамидин риботида». J. Biol. Chem. 224 (2): 1019–27. PMID  13405930.
  • Ли С., Каппок Т.Дж., Стуббе Дж., Уивер Т.М., Иалик С.Е. (1999). «Рентгеновская кристаллическая структура аминоимидазолрибонуклеотидсинтетазы (PurM) из пути биосинтеза пуринов Escherichia coli с разрешением 2,5 A». Структура. 7 (9): 1155–66. Дои:10.1016 / S0969-2126 (99) 80182-8. PMID  10508786.

внешняя ссылка