Рецептор витамина D - Vitamin D receptor

VDR
PDB 2hb8 EBI.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыVDR, NR1I1, PPP1R163, рецептор витамина D (1,25-дигидроксивитамин D3), рецептор витамина D
Внешние идентификаторыOMIM: 601769 MGI: 103076 ГомолоГен: 37297 Генные карты: VDR
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение VDR
Геномное расположение VDR
Группа12q13.11Начните47,841,537 бп[1]
Конец47,943,048 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE VDR 204255 s в формате fs.png

PBB GE VDR 204254 s в формате fs.png

PBB GE VDR 204253 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_009504

RefSeq (белок)

NP_033530

Расположение (UCSC)Chr 12: 47,84 - 47,94 МбChr 15: 97,85 - 97,91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В рецептор витамина D (VDR), также известный как рецептор кальцитриола и в качестве NR1I1 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа I, член 1), является членом ядерный рецептор семья факторы транскрипции.[5] Кальцитриол, активная форма Витамин Д, связывается с VDR, который затем образует гетеродимер с рецептор ретиноида-X. Затем это привязывается к элементы гормонального ответа на ДНК в результате чего выражение или трансрепрессия конкретных генные продукты. VDR не только регулирует транскрипционные ответы, но также участвует в микроРНК -направленные посттранскрипционные механизмы.[6] У человека рецептор витамина D кодируется VDR ген.[7]

Глюкокортикоиды известно, что они снижают экспрессию VDR, которая экспрессируется в большинстве тканей тела и регулирует кишечный транспортировка кальций, утюг и другие минералы.[8]

Функция

Ген VDR кодирует рецептор ядерного гормона для Витамин Д3. Этот рецептор также функционирует как рецептор вторичного желчная кислота литохолевая кислота. Рецептор принадлежит к семейству транс-действующих факторов регуляции транскрипции и обнаруживает сходство последовательности с рецепторами стероидных гормонов и гормонов щитовидной железы.[9]

Нижестоящие мишени этого ядерного рецептора гормона участвуют в основном в минеральном метаболизме, хотя рецептор регулирует множество других метаболических путей, таких как те, которые участвуют в иммунном ответе и раке.[10]

Мутации в этом гене связаны с устойчивостью к витамину D типа II. рахит. Однонуклеотидный полиморфизм в кодоне инициации приводит к альтернативному сайту старта трансляции на три кодона ниже. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих один и тот же белок.[11] Варианты гена VDR, по-видимому, влияют на многие биологические конечные точки, в том числе связанные с остеопорозом. [12]

Рецептор витамина D играет важную роль в регулировании цикла волос. Потеря VDR связана с выпадением волос у экспериментальных животных.[13]Экспериментальные исследования показали, что нелигандированные VDR взаимодействуют с регуляторными участками cWnt (wnt сигнальный путь ) и звуковой еж гены-мишени и требуется для индукции этих путей во время постнатального цикла волос.[14]Эти исследования выявили новые действия VDR без ограничения по регуляции пост-морфогенного цикла волос.

Взаимодействия

Было показано, что рецептор витамина D взаимодействовать с участием

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

[[Файл:
ВитаминDSynthesis_WP1531К статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеперейти к статье
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
ВитаминDSynthesis_WP1531К статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеК статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеК статьеперейти к статьеК статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеК статьеперейти к статье
| {{{bSize}}} px | alt = Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать )]]
Путь синтеза витамина D (Посмотреть / редактировать )
  1. ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «VitaminDSynthesis_WP1531».

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111424 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022479 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Мур Д. Д., Като С., Се В., Мангельсдорф Д. Д., Шмидт Д. Р., Сяо Р., Кливер С. А. (декабрь 2006 г.). "Международный союз фармакологии. LXII. Рецепторы NR1H и NR1I: конститутивный рецептор андростана, рецептор прегнена X, рецептор фарнезоида X альфа, рецептор фарнезоида X бета, рецептор X печени альфа, рецептор X печени бета и рецептор витамина D". Pharmacol. Rev. 58 (4): 742–59. Дои:10.1124 / пр.58.4.6. PMID  17132852. S2CID  85996383.
  6. ^ Лиссе Т.С., Чун Р.Ф., Ригер С., Адамс Дж. С., Хьюисон М. (июнь 2013 г.). «Активация витамином D функционально различных регуляторных miRNA в первичных остеобластах человека». J Bone Miner Res. 28 (6): 1478–14788. Дои:10.1002 / jbmr.1882. ЧВК  3663893. PMID  23362149.
  7. ^ Szpirer J, Szpirer C, Riviere M, Levan G, Marynen P, Cassiman JJ, Wiese R, DeLuca HF (сентябрь 1991 г.). «Ген фактора транскрипции Sp1 (SP1) и ген рецептора 1,25-дигидроксивитамина D3 (VDR) совместно локализованы на плече хромосомы человека 12q и хромосоме 7 крысы». Геномика. 11 (1): 168–73. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90114-Т. PMID  1662663.
  8. ^ Fleet JC, Schoch RD (август 2010 г.). «Молекулярные механизмы регуляции всасывания кальция в кишечнике витамином D и другими факторами». Критик Rev Clin Lab Sci. 47 (4): 181–195. Дои:10.3109/10408363.2010.536429. ЧВК  3235806. PMID  21182397.
  9. ^ Germain P, Staels B, Dacquet C, Spedding M, Laudet V (декабрь 2006 г.). «Обзор номенклатуры ядерных рецепторов». Pharmacol. Rev. 58 (4): 685–704. Дои:10.1124 / пр.58.4.2. PMID  17132848. S2CID  1190488.
  10. ^ Адорини Л., Даниэль К.С., Пенна Г. (2006). «Агонисты рецепторов витамина D, рак и иммунная система: сложные отношения». Curr Top Med Chem. 6 (12): 1297–301. Дои:10.2174/156802606777864890. PMID  16848743.
  11. ^ «Ген Entrez: рецептор витамина D VDR (1,25-дигидроксивитамина D3)».
  12. ^ Абузид М, Каразневич-Лада М, Гловка Ф (2018-10-19). «Генетические детерминанты заболеваний, связанных с витамином D; внимание к рецепторам витамина D». Текущий метаболизм лекарств. 19 (12): 1042–1052. Дои:10.2174/1389200219666180723143552. PMID  30039758.
  13. ^ Людерер HF, Demay MB (июль 2010 г.). «Рецептор витамина D, кожа и стволовые клетки». J. Steroid Biochem. Мол. Биол. 121 (1–2): 314–6. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2010.01.015. PMID  20138991. S2CID  23876206.
  14. ^ Лиссе Т.С., Сайни В., Чжао Х., Людерер Х.Ф., Гори Ф., Демай МБ (сентябрь 2014 г.). «Рецептор витамина D необходим для активации cWnt и передачи сигналов Hedgehog в кератиноцитах». Мол. Эндокринол. 28 (10): 1698–1706. Дои:10.1210 / мне.2014-1043. ЧВК  4179637. PMID  25180455.
  15. ^ Гузей М., Такаяма С., Рид Дж. С. (декабрь 2000 г.). «BAG1L усиливает функцию трансактивации рецептора витамина D». J. Biol. Chem. 275 (52): 40749–56. Дои:10.1074 / jbc.M004977200. PMID  10967105.
  16. ^ а б c d е Китагава Х, Фудзики Р., Йошимура К., Мезаки И, Уэмацу Й, Мацуи Д., Огава С., Унно К., Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими И, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Июнь 2003 г.). «Комплекс WINAC, ремоделирующий хроматин, нацеливается на ядерный рецептор на промоторы и нарушается при синдроме Вильямса». Ячейка. 113 (7): 905–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID  12837248.
  17. ^ Чжао Г., Симпсон РУ (2010). «Мембранная локализация, ассоциация кавеолина-3 и быстрые действия рецептора витамина D в сердечных миоцитах». Стероиды. 75 (8–9): 555–9. Дои:10.1016 / j.steroids.2009.12.001. ЧВК  2885558. PMID  20015453.
  18. ^ а б c Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Икс, Цинь Дж., Редер Р.Г. (март 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Ячейка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
  19. ^ а б Тагами Т., Лутц У.Х., Кумар Р., Джеймсон Дж. Л. (декабрь 1998 г.). «Взаимодействие рецептора витамина D с корепрессорами и коактиваторами ядерного рецептора». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 253 (2): 358–63. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9799. PMID  9878542.
  20. ^ а б c d Пуччетти Э., Обрадович Д., Бейсерт Т., Бьянкини А., Уошберн Б., Кьярадонна Ф., Берер С., Хельцер Д., Оттманн О.Г., Пеличчи П.Г., Нерви С., Рутхардт М. (декабрь 2002 г.). «Продукты транслокации, связанные с AML, блокируют дифференцировку, вызванную витамином D (3), за счет секвестрации рецептора витамина D (3)». Рак Res. 62 (23): 7050–8. PMID  12460926.
  21. ^ Хердик М., Штайнмейер А., Карлберг С. (июнь 2000 г.). «Антагонистическое действие аналога сложного эфира 25-карбоновой кислоты 1альфа, 25-дигидроксивитамина D3 опосредовано отсутствием лиганд-индуцированного взаимодействия рецептора витамина D с коактиваторами». J. Biol. Chem. 275 (22): 16506–12. Дои:10.1074 / jbc.M910000199. PMID  10748178.
  22. ^ а б c Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (ноябрь 2001 г.). «Тернарные комплексы и совместное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D». J. Biol. Chem. 276 (44): 40614–20. Дои:10.1074 / jbc.M106263200. PMID  11514567.
  23. ^ Он Б., Уилсон Э.М. (март 2003 г.). "Электростатическая модуляция в рекрутировании стероидных рецепторов мотивов LXXLL и FXXLF". Мол. Cell. Биол. 23 (6): 2135–50. Дои:10.1128 / MCB.23.6.2135-2150.2003. ЧВК  149467. PMID  12612084.
  24. ^ а б Баудино Т.А., Крайчели Д.М., Джефкоат С.К., Винчестер СК, Партридж Северная Каролина, Макдональд П.Н. (июнь 1998 г.). «Выделение и характеристика нового белка-коактиватора NCoA-62, участвующего в опосредованной витамином D транскрипции». J. Biol. Chem. 273 (26): 16434–41. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16434. PMID  9632709.
  25. ^ Видаль М., Рамана CV, Дуссо А.С. (апрель 2002 г.). «Взаимодействия рецептора Stat1-витамина D противодействуют транскрипционной активности 1,25-дигидроксивитамина D и усиливают Stat1-опосредованную транскрипцию». Мол. Cell. Биол. 22 (8): 2777–87. Дои:10.1128 / MCB.22.8.2777-2787.2002. ЧВК  133712. PMID  11909970.
  26. ^ Уорд Дж. О., Макконнелл М. Дж., Карлайл Г. В., Пандольфи П. П., Лихт Дж. Д., Фридман Л. П. (декабрь 2001 г.). «Белок, связанный с острым промиелоцитарным лейкозом, цинковый палец промиелоцитарного лейкоза, регулирует индуцированную 1,25-дигидроксивитамином D (3) моноцитарную дифференцировку клеток U937 посредством физического взаимодействия с рецептором витамина D (3)». Кровь. 98 (12): 3290–300. Дои:10.1182 / кровь.V98.12.3290. PMID  11719366.

дальнейшее чтение

внешние ссылки


Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.