Семейство гликозидгидролаз 9 - Glycoside hydrolase family 9

Семейство гликозилгидролаз 9
Идентификаторы
СимволGlyco_hydro_9
PfamPF00759
Pfam кланCL0059
PROSITEPDOC00511
SCOP21clc / Объем / СУПФАМ
CAZyGH9
Мембранома1017

В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 9 это семья из гликозидгидролазы.

Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]

Семейство гликозидгидролаз 9 CAZY GH_9 содержит ферменты с несколькими известными активностями, включая эндоглюканаза (EC 3.2.1.4 ) и целлобиогидролаза (EC 3.2.1.91 ). Эти ферменты ранее были известны как семейство целлюлаз E. Целлюлазы (эндоглюканазы). EC 3.2.1.4 катализируют эндогидролиз 1,4-бета-D-глюкозидных связей в целлюлозе. Члены семейства GH9 также были обнаружены в зеленых микроводорослях (Chlamydomonas, Gonium и Volvox), которые демонстрируют наивысшую идентичность последовательности эндогенным целлюлазам GH9 от многоклеточных беспозвоночных. [8]https://prosite.expasy.org/PDOC00511.

Рекомендации

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
  5. ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Семейство гликозидгидролаз 9». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов». Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID  29040563.
  8. ^ Герриеро Г. Сержант К. Легай С. Хаусман Ж.-Ф. Cauchie H.-M. Ахмад И. Сиддики К.С. Int. J. Mol. Sci. 2018, 19, 1782