HEXB - HEXB

HEXB
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1НОУ, 1 СЕЙЧАС, 1NP0, 1O7A, 2GJX, 2ГК1, 3LMY, 5BRO
Идентификаторы
Псевдонимы	HEXB, ENC-1AS, HEL-248, HEL-S-111, субъединица гексозаминидазы бета
Внешние идентификаторы	OMIM: 606873 MGI: 96074 ГомолоГен: 437 Генные карты: HEXB
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 5 (человек)
Конец	74,722,647 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	97,198,357 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность ацетилглюкозаминилтрансферазы; • гидролазная активность, гидролизующие О-гликозильные соединения; • активность гомодимеризации белков; • гидролазная активность, действующая на гликозильные связи; • активность бета-N-ацетилгексозаминидазы; • активность гетеродимеризации белков; • гидролазная активность; • Активность N-ацетил-бета-D-галактозаминидазы; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• мембрана; • азурофильная гранула; • Акросома; • просвет лизосомы; • лизосома; • внеклеточная экзосома; • внеклеточная область; • внеклеточный; • просвет азурофильных гранул;
Биологический процесс	• развитие скелетной системы; • метаболический процесс клеточного белка; • катаболический процесс гиалуроновой кислоты; • половое размножение; • метаболический процесс гликосфинголипидов; • двигательное поведение; • нервно-мышечный процесс, контролирующий баланс; • миграция клеток астроцитов; • хранение липидов; • клеточный гомеостаз ионов кальция; • чувственное восприятие звука; • регулирование клеточного метаболического процесса; • однократное оплодотворение; • оогенез; • нервно-мышечный процесс; • ухаживание самцов; • катаболический процесс кератансульфата; • регулировка формы клеток; • процесс биосинтеза фосфолипидов; • катаболический процесс хондроитинсульфата; • миелинизация; • катаболический процесс олигосахаридов; • метаболизм; • лизосомная организация; • проникновение в блестящую оболочку; • катаболический процесс ганглиозидов; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • метаболический процесс гликозаминогликанов; • дегрануляция нейтрофилов; • углеводный обмен;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3074
	15212
	ENSG00000049860
	ENSMUSG00000021665
	P07686
	P20060
	NM_001292004; NM_000521
	NM_010422
	NP_000512; NP_001278933
	NP_034552
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Бета-гексозаминидаза субъединица бета является фермент что у людей кодируется HEXB ген.^[5]^[6]^[7]

Гексозаминидаза B представляет собой бета-субъединицу лизосомального фермента бета-гексозаминидазы, которая вместе с кофактором GM2 активаторным белком катализирует деградацию ганглиозида GM2 и других молекул, содержащих концевые N-ацетилгексозамины. Бета-гексозаминидаза состоит из двух субъединиц, альфа и бета, которые кодируются отдельными генами. Альфа- и бета-субъединицы бета-гексозаминидазы являются членами 20-го семейства гликозилгидролаз. Мутации в генах альфа- или бета-субъединиц приводят к накоплению ганглиозида GM2 в нейронах и нейродегенеративным нарушениям, называемым ганглиозидозами GM2. Мутации гена субъединицы бета приводят к Болезнь Сандхоффа (GM2-ганглиозидоз II типа).^[7]

Структура

Ген

В HEXB ген лежит на хромосома расположение 5q13.3 и состоит из 15 экзоны, охватывающий 35-40Кб.

Протеин

HEXB состоит из 556 аминокислота остатков и весит 63111Да.

Функция

HEXB - одна из двух субъединиц, образующих β-гексозаминидаза который функционирует как гликозилгидролаза которые удаляют β-связанный невосстанавливающий концевой GalNAc или GlcNAc остатки в лизосома.^[8] Неспособность HEXB приведет к дефекту β-гексозаминидазы и приведет к группе рецессивных заболеваний, называемых GM2. ганглиозидозы, характеризующийся накоплением GM2 ганглиозид.^[9]

Клиническое значение

Генетические дефекты в HEXB может привести к накоплению ганглиозида GM2 в нервных тканях и двум из трех лизосомных болезней накопления, известных под общим названием ганглиозидоз GM2, из которых Болезнь Сандхоффа (дефекты в β субъединица) является наиболее изученной.^[8] Пациенты обращаются с нейросоматическими проявлениями. Терапевтические эффекты трансдукции гена субъединицы Hex изучали на модельных мышах с болезнью Сандхоффа.^[10] Внутрицеребровентрикулярное введение модифицированной β-гексозаминидазы B мышам в режиме Sandhoff восстановило активность β-гексозаминидазы в головном мозге и уменьшило накопление ганглиозидов GM2 в паренхиме.^[11]

Взаимодействия

HEXB взаимодействует с HEXA^[12] и ганглиозид.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000049860 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021665 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ О'Дауд Б.Ф., Куан Ф., Уиллард Х.Ф., Ламхонва А.М., Корнелюк Р.Г., Лоуден Дж.А., Гравел Р.А., Махуран Д.Д. (февраль 1985 г.). «Выделение клонов кДНК, кодирующих бета-субъединицу бета-гексозаминидазы человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 82 (4): 1184–8. Дои:10.1073 / pnas.82.4.1184. ЧВК 397219. PMID 2579389.
^ Korneluk RG, Mahuran DJ, Neote K, Klavins MH, O'Dowd BF, Tropak M, Willard HF, Anderson MJ, Lowden JA, Gravel RA (июнь 1986). «Выделение клонов кДНК, кодирующих альфа-субъединицу бета-гексозаминидазы человека. Обширная гомология между альфа- и бета-субъединицами и исследования болезни Тея – Сакса». Журнал биологической химии. 261 (18): 8407–13. PMID 3013851.
^ ^а ^б «Ген Entrez: гексозаминидаза B HEXB (бета-полипептид)».
^ ^а ^б Bateman KS, Cherney MM, Mahuran DJ, Tropak M, James MN (март 2011 г.). «Кристаллическая структура β-гексозаминидазы B в комплексе с пириметамином, потенциальным фармакологическим шапероном». Журнал медицинской химии. 54 (5): 1421–9. Дои:10.1021 / jm101443u. ЧВК 3201983. PMID 21265544.
^ Соннино С, Чигорно В (сентябрь 2000 г.). «Молекулярные виды ганглиозидов, содержащие С18- и С20-сфингозин в нервных тканях млекопитающих и культурах нейрональных клеток». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Обзоры биомембран. 1469 (2): 63–77. Дои:10.1016 / с0005-2736 (00) 00210-8. PMID 10998569.
^ ^а ^б Итакура Т., Куроки А., Ишибаши Ю., Цудзи Д., Кавасита Е., Хигашин И., Сакураба Х., Яманака С., Ито К. (август 2006 г.). «Неэффективность элиминации ганглиозидов GM2 путем переноса гена бета-субъединицы бета-гексозаминидазы лизосом человека в линию фибробластных клеток, полученную от мышей модели болезни Сандхоффа». Биологический и фармацевтический бюллетень. 29 (8): 1564–9. Дои:10.1248 / bpb.29.1564. PMID 16880605.
^ Мацуока К., Тамура Т., Цудзи Д., Додзоно Ю., Китакадзе К., Оно К., Сайто С., Сакураба Х., Ито К. (июнь 2011 г.). «Терапевтический потенциал интрацеребровентрикулярной замены модифицированной β-гексозаминидазы человека B при ганглиозидозе GM2». Молекулярная терапия. 19 (6): 1017–24. Дои:10.1038 / мт.2011.27. ЧВК 3129794. PMID 21487393.
^ Горт Л., де Олано Н., Масиас-Видаль Дж, Колл. Массачусетс (сентябрь 2012 г.). «Ганглиозидозы GM2 в Испании: анализ генов HEXA и HEXB у 34 пациентов Tay-Sachs и 14 пациентов Sandhoff». Ген. 506 (1): 25–30. Дои:10.1016 / j.gene.2012.06.080. PMID 22789865.

дальнейшее чтение

Махуран DJ (февраль 1991 г.). «Биохимия мутаций генов HEXA и HEXB, вызывающих ганглиозидоз GM2». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1096 (2): 87–94. Дои:10.1016 / 0925-4439 (91) 90044-А. PMID 1825792.
Махуран DJ (октябрь 1999 г.). «Биохимические последствия мутаций, вызывающих ганглиозидозы GM2». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1455 (2–3): 105–38. Дои:10.1016 / S0925-4439 (99) 00074-5. PMID 10571007.
Гилберт Ф., Кучерлапати Р., Криган Р.П., Мурнэйн М.Дж., Дарлингтон Дж.Дж., Раддл Ф.Х. (январь 1975 г.). «Болезни Тея-Сакса и Сандхоффа: отнесение генов гексозаминидазы А и В к отдельным хромосомам человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 72 (1): 263–7. Дои:10.1073 / pnas.72.1.263. ЧВК 432284. PMID 1054503.
Макиннес Б., Потье М., Вакамацу Н., Меланкон С. Б., Клавинс М. Х., Цуджи С., Махуран Д. Д. (август 1992 г.). «Необычная мутация сплайсинга в гене HEXB связана с совершенно разными фенотипами у пациентов из разных расовых групп». Журнал клинических исследований. 90 (2): 306–14. Дои:10.1172 / JCI115863. ЧВК 443103. PMID 1386607.
Bolhuis PA, Bikker H (ноябрь 1992 г.). «Делеция 5'-области в одном или двух аллелях HEXB у 15 из 30 пациентов с болезнью Сандхоффа». Генетика человека. 90 (3): 328–9. Дои:10.1007 / bf00220096. PMID 1487253. S2CID 219692.
Вакамацу Н., Кобаяси Х, Миятаке Т., Цудзи С. (февраль 1992 г.). «Новая мутация экзона в гене бета-субъединицы бета-гексозаминидазы человека влияет на выбор 3'-сайта сплайсинга». Журнал биологической химии. 267 (4): 2406–13. PMID 1531140.
Банерджи П., Сицилиано Л., Оливери Д., МакКейб Н. Р., Бойерс М. Дж., Хорвиц А. Л., Ли С. К., Доусон Г. (ноябрь 1991 г.). «Молекулярная основа взрослой формы дефицита бета-гексозаминидазы B с заболеванием двигательных нейронов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 181 (1): 108–15. Дои:10.1016 / S0006-291X (05) 81388-9. PMID 1720305.
Boose JA, Tifft CJ, Proia RL, Myerowitz R (ноябрь 1990 г.). «Синтез лизосомального фермента человека, бета-гексозаминидазы B, с использованием системы экспрессии бакуловируса». Экспрессия и очистка белков. 1 (2): 111–20. Дои:10.1016 / 1046-5928 (90) 90003-Н. PMID 1967020.
Махуран ди-джей (апрель 1990 г.). «Характеристика человеческой плацентарной бета-гексозаминидазы I2. Протеолитические промежуточные продукты обработки гексозаминидазы А». Журнал биологической химии. 265 (12): 6794–9. PMID 2139028.
Neote K, McInnes B, Mahuran DJ, Gravel RA (ноябрь 1990 г.). «Структура и распространение делеционной мутации Alu-типа при болезни Сандхоффа». Журнал клинических исследований. 86 (5): 1524–31. Дои:10.1172 / JCI114871. ЧВК 296899. PMID 2147027.
Neote K, Brown CA, Mahuran DJ, Gravel RA (декабрь 1990 г.). «Инициирование трансляции в гене HEXB, кодирующем бета-субъединицу бета-гексозаминидазы человека». Журнал биологической химии. 265 (34): 20799–806. PMID 2147427.
Длотт Б., д'Аццо А., Куон Д.В., Нойфельд Е.Ф. (октябрь 1990 г.). «Две мутации вызывают вставку интрона в мРНК и удлиненную бета-субъединицу бета-гексозаминидазы человека». Журнал биологической химии. 265 (29): 17921–7. PMID 2170400.
Накано Т., Сузуки К. (март 1989 г.). «Генетическая причина ювенильной формы болезни Сандхоффа. Аномальное сплайсинг транскрипта бета-цепи бета-гексозаминидазы из-за точечной мутации в интроне 12». Журнал биологической химии. 264 (9): 5155–8. PMID 2522450.
Хаббс М., Каллахан Дж., Гравел Р., Махуран Д. (июнь 1989 г.). «Аминоконцевые последовательности в про-альфа- и -бета-полипептидах лизосомальных бета-гексозаминидаз человека А и В сохраняются в зрелых изоферментах». Письма FEBS. 249 (2): 316–20. Дои:10.1016/0014-5793(89)80649-0. PMID 2525487. S2CID 83872800.
Биккер Х., Ван ден Берг Ф.М., Вольтерман Р.А., де Вейлдер Дж.Дж., Болхуис, Пенсильвания (февраль 1989 г.). «Демонстрация ассоциированной с болезнью Сандхоффа аутосомной делеции 50 kb с помощью гель-электрофореза с инверсией поля». Генетика человека. 81 (3): 287–8. Дои:10.1007 / BF00279006. PMID 2921040. S2CID 39411971.
Bolhuis PA, Oonk JG, Kamp PE, Ris AJ, Michalski JC, Overdijk B, Reuser AJ (январь 1987 г.). «Хранение ганглиозидов, лабильность гексозаминидазы и олигосахариды в моче при болезни Сандхоффа у взрослых». Неврология. 37 (1): 75–81. Дои:10.1212 / wnl.37.1.75. PMID 2948136. S2CID 20622020.
Proia RL (март 1988 г.). «Ген, кодирующий бета-цепь бета-гексозаминидазы человека: обширная гомология размещения интронов в генах альфа- и бета-цепей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 85 (6): 1883–7. Дои:10.1073 / pnas.85.6.1883. ЧВК 279885. PMID 2964638.
Махуран Д. Д., Неоте К., Клавинс М. Х., Леунг А., Гравий Р. А. (апрель 1988 г.). «Протеолитический процессинг про-альфа и про-бета предшественников бета-гексозаминидазы человека. Генерация зрелых альфа- и бета-бета-субъединиц». Журнал биологической химии. 263 (10): 4612–8. PMID 2965147.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000049860 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021665 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid2579389-5] О'Дауд Б.Ф., Куан Ф., Уиллард Х.Ф., Ламхонва А.М., Корнелюк Р.Г., Лоуден Дж.А., Гравел Р.А., Махуран Д.Д. (февраль 1985 г.). «Выделение клонов кДНК, кодирующих бета-субъединицу бета-гексозаминидазы человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 82 (4): 1184–8. Дои:10.1073 / pnas.82.4.1184. ЧВК 397219. PMID 2579389.

[pmid3013851-6] Korneluk RG, Mahuran DJ, Neote K, Klavins MH, O'Dowd BF, Tropak M, Willard HF, Anderson MJ, Lowden JA, Gravel RA (июнь 1986). «Выделение клонов кДНК, кодирующих альфа-субъединицу бета-гексозаминидазы человека. Обширная гомология между альфа- и бета-субъединицами и исследования болезни Тея – Сакса». Журнал биологической химии. 261 (18): 8407–13. PMID 3013851.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: гексозаминидаза B HEXB (бета-полипептид)».

[Bateman_2011-8] а ^б Bateman KS, Cherney MM, Mahuran DJ, Tropak M, James MN (март 2011 г.). «Кристаллическая структура β-гексозаминидазы B в комплексе с пириметамином, потенциальным фармакологическим шапероном». Журнал медицинской химии. 54 (5): 1421–9. Дои:10.1021 / jm101443u. ЧВК 3201983. PMID 21265544.

[9] Соннино С, Чигорно В (сентябрь 2000 г.). «Молекулярные виды ганглиозидов, содержащие С18- и С20-сфингозин в нервных тканях млекопитающих и культурах нейрональных клеток». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Обзоры биомембран. 1469 (2): 63–77. Дои:10.1016 / с0005-2736 (00) 00210-8. PMID 10998569.

[Itakura_2006-10] а ^б Итакура Т., Куроки А., Ишибаши Ю., Цудзи Д., Кавасита Е., Хигашин И., Сакураба Х., Яманака С., Ито К. (август 2006 г.). «Неэффективность элиминации ганглиозидов GM2 путем переноса гена бета-субъединицы бета-гексозаминидазы лизосом человека в линию фибробластных клеток, полученную от мышей модели болезни Сандхоффа». Биологический и фармацевтический бюллетень. 29 (8): 1564–9. Дои:10.1248 / bpb.29.1564. PMID 16880605.

[11] Мацуока К., Тамура Т., Цудзи Д., Додзоно Ю., Китакадзе К., Оно К., Сайто С., Сакураба Х., Ито К. (июнь 2011 г.). «Терапевтический потенциал интрацеребровентрикулярной замены модифицированной β-гексозаминидазы человека B при ганглиозидозе GM2». Молекулярная терапия. 19 (6): 1017–24. Дои:10.1038 / мт.2011.27. ЧВК 3129794. PMID 21487393.

[12] Горт Л., де Олано Н., Масиас-Видаль Дж, Колл. Массачусетс (сентябрь 2012 г.). «Ганглиозидозы GM2 в Испании: анализ генов HEXA и HEXB у 34 пациентов Tay-Sachs и 14 пациентов Sandhoff». Ген. 506 (1): 25–30. Дои:10.1016 / j.gene.2012.06.080. PMID 22789865.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]