Протопорфириногеноксидаза - Protoporphyrinogen oxidase
| протопорфириногеноксидаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Синтез гема - обратите внимание, что некоторые реакции происходят в цитоплазма и некоторые в митохондрия (желтый) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.3.3.4 | ||||||||
| Количество CAS | 53986-32-6 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Протопорфириногеноксидаза является фермент что у людей кодируется PPOX ген.[5][6][7]
Протопорфириногеноксидаза отвечает за седьмой этап биосинтеза протопорфирин IX. Этот порфирин является предшественником гемоглобин, то кислород переносчик в животных и хлорофилл, краситель в растениях. Фермент катализирует дегидрирование (удаление водород атомов) протопорфириногена IX (продукт шестой стадии производства гема) с образованием протопорфирина IX. Еще один фермент должен модифицировать протопорфирин IX, прежде чем он станет гемом. Ингибирование этого фермента - стратегия, используемая в некоторых гербициды.
Ген
Ген PPOX расположен на длинном (q) плече хромосома 1 в позиции 22, от базовая пара 157 949 266 к базовой паре 157 954 082.
Функция
Этот ген кодирует предпоследний фермент биосинтеза гема, который катализирует 6-электронное окисление протопорфириноген IX формировать протопорфирин IX. Этот белок представляет собой флавопротеин связанные с внешней поверхностью внутренняя митохондриальная мембрана.[7]
Путь биосинтеза гема
Следующие гены кодируют ферменты, которые катализируют различные стадии гема. биосинтетический путь:
- ALAD: аминолевулинат, дельта-, дегидратаза
- ALAS1: аминолевулинат, дельта-, синтаза 1
- ALAS2: аминолевулинат, дельта-, синтаза 2 (сидеробластная / гипохромная анемия)
- CPOX: копропорфириногеноксидаза
- FECH: феррохелатаза (протопорфирия)
- HMBS: гидроксиметилбилансинтаза
- PPOX: протопорфириногеноксидаза
- UROD: уропорфириноген декарбоксилаза
- UROS: синтаза уропорфириноген III (врожденная эритропоэтическая порфирия)
Клиническое значение
Разнообразная порфирия вызвано мутациями в гене PPOX. В гене PPOX идентифицировано более 100 мутаций, которые могут вызывать пеструю порфирию. Одна мутация, замена аминокислота триптофан за аргинин в позиции 59 (также обозначаемой как Arg59Trp или R59W) встречается примерно в 95 процентах Южноафриканский семьи с пестролистной порфирией. Мутации в гене PPOX снижают активность фермента, вырабатываемого этим геном, позволяя побочным продуктам производства гема накапливаться в организме. Это накопление в сочетании с негенетическими факторами (такими как некоторые лекарства, алкоголь и диета), вызывает этот тип порфирии.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143224 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062729 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Такетани С., Инадзава Дж., Абэ Т., Фурукава Т., Коно Х., Токунага Р., Нисимура К., Инокучи Х. (октябрь 1995 г.). «Ген протопорфириногеноксидазы человека (PPOX): организация и расположение в хромосоме 1». Геномика. 29 (3): 698–703. Дои:10.1006 / geno.1995.9949. PMID 8575762.
- ^ Фрэнк Дж., МакГрат Дж. А., По-Фитцпатрик МБ, Хок Дж. Л., Кристиано А. М. (июль 1999 г.). «Мутации в кодоне инициации трансляции гена протопорфириногеноксидазы лежат в основе разнообразной порфирии». Клиническая и экспериментальная дерматология. 24 (4): 296–301. Дои:10.1046 / j.1365-2230.1999.00484.x. PMID 10457135.
- ^ а б «Ген Entrez: протопорфириногеноксидаза PPOX».
дальнейшее чтение
- Старейшина Г.Х. (1998). «Генетические дефекты порфирий: типы и значение». Клиники дерматологии. 16 (2): 225–33. Дои:10.1016 / S0738-081X (97) 00202-2. PMID 9554235.
- Манели М.Х., Корригалл А.В., Кламп Х.Х., Дэвидс Л.М., Кирш Р.Э., Мейснер П.Н. (август 2003 г.). «Кинетическая и физическая характеристика рекомбинантных дикого типа и мутантных протопорфириногеноксидаз человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика. 1650 (1–2): 10–21. Дои:10.1016 / с1570-9639 (03) 00186-9. PMID 12922165.
- Морган Р.Р., Эррингтон Р., старейшина Г.Х. (январь 2004 г.). «Идентификация последовательностей, необходимых для импорта протопорфириногеноксидазы человека в митохондрии». Биохимический журнал. 377 (Чт 2): 281–7. Дои:10.1042 / BJ20030978. ЧВК 1223874. PMID 14535846.
- Sassa S, Kappas A (февраль 2000 г.). «Молекулярные аспекты наследственных порфирий». Журнал внутренней медицины. 247 (2): 169–78. Дои:10.1046 / j.1365-2796.2000.00618.x. PMID 10692079.
- Нисимура К., Такетани С., Инокучи Х. (апрель 1995 г.). «Клонирование человеческой кДНК для протопорфириногеноксидазы путем комплементации in vivo мутанта hemG Escherichia coli». Журнал биологической химии. 270 (14): 8076–80. Дои:10.1074 / jbc.270.14.8076. PMID 7713909.
- Дейли Т.А., Мейснер П., Дейли А.А. (январь 1994 г.). «Экспрессия клонированной протопорфириногеноксидазы». Журнал биологической химии. 269 (2): 813–5. PMID 8288631.
- Дейли Т.А., Дейли Х.А., Мейснер П., Прасад АР (декабрь 1995 г.). «Клонирование, последовательность и экспрессия протопорфириногеноксидазы мыши». Архивы биохимии и биофизики. 324 (2): 379–84. Дои:10.1006 / abbi.1995.0051. PMID 8554330.
- Meissner PN, Dailey TA, Hift RJ, Ziman M, Corrigall AV, Roberts AG, Meissner DM, Kirsch RE, Dailey HA (май 1996). «Мутация R59W в протопорфириногеноксидазе человека приводит к снижению ферментативной активности и распространена у южноафриканцев с пестрой порфирией». Природа Генетика. 13 (1): 95–7. Дои:10.1038 / ng0596-95. PMID 8673113.
- Дейли Т.А., Дейли Х.А. (январь 1996 г.). «Протопорфириногеноксидаза человека: экспрессия, очистка и характеристика клонированного фермента». Белковая наука. 5 (1): 98–105. Дои:10.1002 / pro.5560050112. ЧВК 2143237. PMID 8771201.
- Пюи Х., Робро А.М., Росипал Р., Нордманн Ю., Дейбах Дж. С. (сентябрь 1996 г.). «Протопорфириногеноксидаза: полная геномная последовательность и полиморфизмы в гене человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 226 (1): 226–30. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1337. PMID 8806618.
- Deybach JC, Puy H, Robréau AM, Lamoril J, Da Silva V, Grandchamp B, Nordmann Y (март 1996). «Мутации в гене протопорфириногеноксидазы у пациентов с пестрой порфирией». Молекулярная генетика человека. 5 (3): 407–10. Дои:10.1093 / hmg / 5.3.407. PMID 8852667.
- Лам Х., Драган Л., Цоу Х.С., Мерк Х., Пикок М., Герц Г., Сасса С., По-Фитцпатрик М., Бикерс Д.Р., Кристиано А.М. (январь 1997 г.). «Молекулярная основа пестрой порфирии: мутация вставки de novo в гене протопорфириногеноксидазы». Генетика человека. 99 (1): 126–9. Дои:10.1007 / s004390050325. PMID 9003509.
- Дейли Х.А., Дейли Т.А. (февраль 1997 г.). «Характеристики протопорфириногеноксидазы человека в контроле и пестрые порфирии». Клеточная и молекулярная биология. 43 (1): 67–73. PMID 9074790.
- Франк Дж., По-Фитцпатрик МБ, Кинг Л. Е., Кристиано А. М. (август 1998 г.). «Генетическая основа пестрой порфирии« Scarsdale Gourmet Diet »: миссенс-мутация в гене протопорфириногеноксидазы». Архив дерматологических исследований. 290 (8): 441–5. Дои:10.1007 / s004030050333. PMID 9763307.
- Робертс А.Г., Пуй Х., Дейли Т.А., Морган Р.Р., Ватли С.Д., Дейли Х.А., Мартасек П., Нордманн Ю., Дейбах Дж. К., старейшина Г. Х. (ноябрь 1998 г.). «Молекулярная характеристика гомозиготной пестрой порфирии». Молекулярная генетика человека. 7 (12): 1921–5. Дои:10.1093 / hmg / 7.12.1921. PMID 9811936.
- Ватли С.Д., Пуй Х., Морган Р.Р., Робро А.М., Робертс А.Г., Нордманн Ю., старейшина Г.Х., Дейбах Дж.С. (октябрь 1999 г.). «Разнообразная порфирия в Западной Европе: выявление мутаций гена PPOX в 104 семьях, степень аллельной гетерогенности и отсутствие корреляции между фенотипом и типом мутации». Американский журнал генетики человека. 65 (4): 984–94. Дои:10.1086/302586. ЧВК 1288269. PMID 10486317.
- Сузуки Ю., Исихара Д., Сасаки М., Накагава Х., Хата Х, Цунода Т., Ватанабэ М., Комацу Т., Ота Т., Исогай Т., Суяма А., Сугано С. (март 2000 г.). «Статистический анализ 5'-нетранслируемой области мРНК человека с использованием библиотек кДНК« олиго-кэпированных »». Геномика. 64 (3): 286–97. Дои:10.1006 / geno.2000.6076. PMID 10756096.
- Корригалл А.В., Хифт Р.Дж., Дэвидс Л.М., Хэнкок В., Мейснер Д., Кирш Р.Э., Мейснер П.Н. (апрель 2000 г.). «Гомозиготная пестролистная порфирия в Южной Африке: генотипический анализ в двух случаях». Молекулярная генетика и метаболизм. 69 (4): 323–30. Дои:10.1006 / мг.2000.2975. PMID 10870850.
- Кауппинен Р., Тимонен К., фон унд цу Фраунберг М., Лайтинен Э., Ахола Х., Тенхунен Р., Такетани С., Мустайоки П. (апрель 2001 г.). «Гомозиготная пестрая порфирия: наблюдение через 20 лет и характеристика молекулярного дефекта». Журнал следственной дерматологии. 116 (4): 610–3. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2001.01293.x. PMID 11286631.
- Палмер Р.А., старейшина Г.Х., Барретт Д.Ф., Кеохан С.Г. (апрель 2001 г.). «Гомозиготная пестрая порфирия: сложная гетерозигота с новыми мутациями в гене протопорфириногеноксидазы». Британский журнал дерматологии. 144 (4): 866–9. Дои:10.1046 / j.1365-2133.2001.04147.x. PMID 11298551.
- Корригалл А.В., Хифт Р.Дж., Дэвидс Л.М., Хэнкок В., Мейснер Д., Кирш Р.Э., Майснер П.Н. (май 2001 г.). «Идентификация первой мутации пестрой порфирии у коренных чернокожих южноафриканцев и дальнейшее доказательство гетерогенности пестрой порфирии». Молекулярная генетика и метаболизм. 73 (1): 91–6. Дои:10.1006 / mgme.2001.3163. PMID 11350188.
- Доннелли Дж. Г., Детомб С., Хиндмарш Дж. Т. (2002). «Одноцепочечный конформационный полиморфизм и денатурирующий градиентный гель-электрофорез в скрининге на разнообразную порфирию: идентификация двух новых мутаций». Анналы клинической и лабораторной науки. 32 (2): 107–13. PMID 12017191.
внешняя ссылка
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для протопорфириногеноксидазы человека
