ACADSB - ACADSB

ACADSB
2jif.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыACADSB, ацил-CoA дегидрогеназа, короткая / разветвленная цепь, 2-MEBCAD, ACAD7, SBCAD, ацил-CoA дегидрогеназа короткая / разветвленная цепь
Внешние идентификаторыOMIM: 600301 MGI: 1914135 ГомолоГен: 1216 Генные карты: ACADSB
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение ACADSB
Геномное расположение ACADSB
Группа10q26.13Начните123,008,979 бп[1]
Конец123,058,290 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001609
NM_001330174

NM_025826

RefSeq (белок)

NP_001317103
NP_001600

NP_080102

Расположение (UCSC)Chr 10: 123.01 - 123.06 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ACADSB человек ген что кодирует ацил-КоА-дегидрогеназа, специфичная для короткой / разветвленной цепи (SBCAD), фермент в ацил-КоА-дегидрогеназа семья.

Это может вызвать дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью.[4]

Структура

Ген ACADSB человека расположен на хромосома 10; его точная локализация была определена как 10q25-q26.[5] В открытая рамка чтения (ORF) кодирует белок-предшественник, содержащий 431 аминокислоты; посттрансляционный процессинг приводит к зрелому белку с 399 аминокислотами. КДНК значительно похожа на кДНК других членов семейства ацил-КоА дегидрогеназы; его структура наиболее близка к структуре ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой цепью.[6] Также была изучена структура каталитического кармана; положение 104 на дне кармана для связывания субстрата было идентифицировано как важное для определения длины первичной углеродной цепи, которая может быть размещена. Было показано, что изменение остатков в положениях 105 и 177 влияет на скорость дегидрирование реакции.[7]

Функция

Ацил-КоА-дегидрогеназа с короткой / разветвленной цепью (ACADSB) является членом семейства ферментов ацил-КоА-дегидрогеназы, которые катализируют дегидрирование производных ацил-КоА в метаболизм жирных кислот или аминокислоты с разветвленной цепью. Специфичность субстрата это основная характеристика, используемая для определения членов этого семейства генов. Продукт гена ACADSB обладает наибольшей активностью по отношению к производному ацил-КоА с короткой разветвленной цепью, (S) -2-метилбутирил-КоА, но также значительно реагирует с другими субстратами с 2-метиловыми разветвленными цепями и с короткоцепочечным ацил-CoAs.[8] Кодируемый белок также участвует в L-лейцин катаболизм.[9]

Клиническое значение

Мутации в гене ACADSB были связаны с Дефицит 2-метилбутирил-КоА дегидрогеназы (SBCADD, также известный как MBD), аутосомный рецессивный нарушение обмена веществ ослабленных изолейцин деградация.[10] Было идентифицировано множество мутаций в 10 экзонах гена, которые вызывают пропуск экзона и другие ошибки транскрипции и перевода. Расстройство может быть обнаружено с помощью стандартного скрининга новорожденных на основе МС / МС из-за повышенного присутствия 2-метилбутирилкарнитина в образцах тканей.[11][12] Заболевание также можно идентифицировать с помощью анализа мочи на органические кислоты, обнаружив присутствие 2-метилбутирила. глицинурия.[9] Хотя многие люди с мутацией в этом гене могут протекать бессимптомно, у некоторых пациентов симптомы появляются в раннем младенчестве. Младенцы могут испытывать апноэ эпизоды, обобщенные мышечная атрофия, гипотония, летаргия, припадки, и задержка моторного развития. Пациенты также могут испытывать метаболические симптомы, такие как: переохлаждение и гипогликемия.[13] Наконец, генетический полиморфизм гена ACADSB также может быть вовлечен в развитие гипертония в японском населении.[14]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196177 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руйтер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью: идентификация нового ферментативного дефекта, устранение его молекулярной основы и доказательства различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1095–103. Дои:10.1086/303105. ЧВК  1288551. PMID  11013134.
  5. ^ Арден К.С., Виарс С.С., Фу К., Розен Р. (февраль 1995 г.). «Локализация ацил-CoA дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью (ACADSB) на хромосоме 10 человека». Геномика. 25 (3): 743–5. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80023-ф. PMID  7759115.
  6. ^ Розен Р., Вокли Дж., Чжоу Л., Милош Р., Уиллард Дж., Фу К., Виканек С., Лоу-Нанг Л., Торбан Е., Фурнье Б. (ноябрь 1994 г.). «Выделение и экспрессия кДНК, кодирующей предшественник нового члена (ACADSB) семейства генов ацил-CoA дегидрогеназы». Геномика. 24 (2): 280–7. Дои:10.1006 / geno.1994.1617. PMID  7698750.
  7. ^ Он М., Бургхардт Т.П., Фокли Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Новый подход к характеристике субстратной специфичности ацил-CoA дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью». Журнал биологической химии. 278 (39): 37974–86. Дои:10.1074 / jbc.M306882200. PMID  12855692.
  8. ^ «Ген Entrez: ацил-КоА дегидрогеназа, короткая / разветвленная цепь».
  9. ^ а б Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руйтер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью: идентификация нового ферментативного дефекта, устранение его молекулярной основы и доказательства различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина». Американский журнал генетики человека. 67 (5): 1095–103. Дои:10.1086/303105. ЧВК  1288551. PMID  11013134.
  10. ^ Sass JO, Ensenauer R, Röschinger W., Reich H, Steuerwald U, Schirrmacher O, Engel K, Häberle J, Andresen BS, Mégarbané A, Lehnert W, Zschocke J (январь 2008 г.). «Дефицит дегидрогеназы 2-метилбутирил-коэнзима А: функциональные и молекулярные исследования дефекта катаболизма изолейцина». Молекулярная генетика и метаболизм. 93 (1): 30–5. Дои:10.1016 / j.ymgme.2007.09.002. PMID  17945527.
  11. ^ Мэдсен П.П., Кибак М., Рока X, Сачиданандам Р., Крайнер А.Р., Кристенсен Э., Штайнер Р.Д., Гибсон К.М., Коридон Т.Дж., Кнудсен И., Вандерс Р.Дж., Руйтер Дж. П., Грегерсен Н., Андресен Б.С. (февраль 2006 г.). «Дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой / разветвленной цепью из-за мутации IVS3 + 3A> G, которая вызывает пропуск экзона». Генетика человека. 118 (6): 680–90. Дои:10.1007 / s00439-005-0070-4. PMID  16317551. S2CID  22861705.
  12. ^ Альфардан Дж., Мохсен А.В., Коупленд С., Эллисон Дж., Кеппен-Дэвис Л., Рорбах М., Пауэлл Б. Р., Гиллис Дж., Матерн Д., Кант Дж., Фокли Дж. (Август 2010 г.). «Характеристика новых мутаций в последовательности гена ACADSB и клинических проявлений у пациентов с 2-метилбутирилглицинурией, выявленных при скрининге новорожденных». Молекулярная генетика и метаболизм. 100 (4): 333–8. Дои:10.1016 / j.ymgme.2010.04.014. ЧВК  2906669. PMID  20547083.
  13. ^ Gibson KM, Burlingame TG, Hogema B, Jakobs C, Schutgens RB, Millington D, Roe CR, Roe DS, Sweetman L, Steiner RD, Linck L, Pohowalla P, Sacks M, Kiss D, Rinaldo P, Vockley J (июнь 2000 г.) ). «Дефицит дегидрогеназы 2-метилбутирил-кофермента А: новая врожденная ошибка метаболизма L-изолейцина». Педиатрические исследования. 47 (6): 830–3. Дои:10.1203/00006450-200006000-00025. PMID  10832746.
  14. ^ Камиде К., Кокубо Ю., Ян Дж., Матайоши Т., Инамото Н., Такиучи С., Хорио Т., Мива Ю., Йошии М., Томоике Н., Танака К., Банно М., Окуда Т., Кавано И., Мията Т. (январь 2007 г.). «Ассоциация генетических полиморфизмов ACADSB и COMT с гипертонией человека». Журнал гипертонии. 25 (1): 103–10. Дои:10.1097 / HJH.0b013e3280103a40. PMID  17143180. S2CID  40885244.

внешние ссылки

  • Человек ACADSB расположение генома и ACADSB страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P45954 (Ацил-КоА-дегидрогеназа, специфическая для коротких / разветвленных цепей, митохондриальная) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.