ACADS - ACADS

ACADS
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыACADS, ацил-КоА дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3, ACAD3, SCAD, короткая цепь ацил-CoA дегидрогеназы
Внешние идентификаторыOMIM: 606885 MGI: 87868 ГомолоГен: 20057 Генные карты: ACADS
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение ACADS
Геномное расположение ACADS
Группа12q24.31Начинать120,725,774 бп[1]
Конец120,740,008 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

35

11409

Ансамбль

ENSG00000122971

ENSMUSG00000029545

UniProt

P16219

Q07417

RefSeq (мРНК)

NM_001302554
NM_000017

NM_007383

RefSeq (белок)

NP_000008
NP_001289483
NP_001289483.1

NP_031409

Расположение (UCSC)Chr 12: 120,73 - 120,74 МбChr 5: 115.11 - 115.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3 является фермент что у людей кодируется ACADS ген.[5] Этот ген кодирует тетрамерный митохондриальный флавопротеин, который является членом ацил-КоА дегидрогеназа семья. Этот фермент катализирует начальную стадию митохондриальный жирная кислота бета-окисление путь. Ген ACADS, связанный с дефицит короткоцепочечной ацил-кофермента А дегидрогеназы.[6][5]

Структура

Ген ACADS имеет длину около 13 т.п.н. и имеет 10 экзонов. Кодирующая последовательность этого гена составляет 1239 п.н.[7] Кодируемый белок содержит 412 аминокислот, а его размер составляет 44,3 кДа (человек) или 44,9 кДа (мышь).[8][9]

Функция

Фермент SCAD катализирует первую часть жирная кислота бета-окисление путем образования транс-двойной связи C2-C3 в жирной кислоте путем дегидрирования флавофермента. SCAD специфичен для короткоцепочечных жирных кислот, от C2 до C3-acylCoA. Конечным результатом бета-окисления является ацетил-КоА.[10] Когда есть дефекты, которые приводят к неправильной фальцовке SCAD, увеличивается производство активные формы кислорода (ROS); увеличение ROS заставляет митохондрии подвергаться делению, и митохондриальный ретикулум приобретает зерноподобную структуру.[11]

Клиническое значение

Мутации гена ACADS связаны с дефицит белка дегидрогеназы ацил-кофермента А с короткой цепью (SCADD); это также известно как дефицит бутирил-КоА дегидрогеназы. Многие мутации были идентифицированы в конкретных популяциях, и были проведены крупномасштабные исследования для определения аллельной и генотипической частоты дефектного гена.[12][13] Поскольку короткоцепочечная ацил-КоА-дегидрогеназа участвует в бета-окислении, дефицит этого фермента отмечен повышенным количеством жирных кислот. Этот дефицит характеризуется повышенным содержанием бутирилкарнитина (C4) в плазме крови и повышенными концентрациями этилмалоновой кислоты (EMA) в моче. Генотипы людей с этим дефицитом имеют его в результате мутации, варианта или их комбинации.[14] Среди одной популяции, страдающей этим заболеванием, были идентифицированы три подгруппы: одна группа имеет недостаточное развитие, проблемы с кормлением и гипотонию; у другой группы были припадки; наконец, у одной группы была гипотония и не было припадков.[15] Другие исследования показали, что дефицит может протекать бессимптомно у некоторых людей в нормальных условиях, а симптомы проявляются в условиях физиологического стресса, таких как голодание или болезнь.[16] Лечение этого дефицита иногда может быть неясным, потому что иногда оно может протекать бессимптомно. Лечение этого заболевания аналогично лечению других нарушений окисления жирных кислот, пытаясь восстановить биохимический и физиологический гомеостаз, способствуя анаболизму и обеспечивая альтернативные источники энергии. [14] Добавка флавинадениндинуклеотида также была определена в качестве терапии этого дефицита, потому что это важный кофактор для правильного функционирования SCAD.[17] Дефицит SCAD наследуется по аутосомно-рецессивному типу. Тестирование на носительство может проводиться для членов семьи из группы риска, также возможно пренатальное тестирование. [14]

Ген ACADS также участвует в отсрочке начала Синдром Прадера-Вилли, который характеризуется гипотонией, задержкой роста и задержкой нервного развития в первые годы жизни, а также гиперфагией и ожирением намного позже.[18]

В Исследования геномных ассоциаций (GWAS), SCAD был связан с пониженным высвобождением инсулина, что подтверждается пероральный тест на толерантность к глюкозе, или OGTT.[19]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122971 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029545 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: ацил-CoA дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3».
  6. ^ Tein I, Elpeleg O, Ben-Zeev B, Korman SH, Lossos A, Lev D, Lerman-Sagie T, Leshinsky-Silver E, Vockley J, Berry GT, Lamhonwah AM, Matern D, Roe CR, Gregersen N (февраль 2008 г.) ). «Мутация гена короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы (c.319C> T) имеет клиническую гетерогенность и является мутацией кандидата-основателя у лиц еврейского происхождения ашкенази». Молекулярная генетика и метаболизм. 93 (2): 179–89. Дои:10.1016 / j.ymgme.2007.09.021. PMID  18054510.
  7. ^ Коридон М.Дж., Андресен Б.С., Бросс П., Кьельдсен М., Андреасен П.Х., Эйберг Х., Кёльвраа С., Грегерсен Н. (декабрь 1997 г.). «Структурная организация гена короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы человека». Геном млекопитающих. 8 (12): 922–6. Дои:10.1007 / s003359900612. PMID  9383286. S2CID  9157185.
  8. ^ «Информация о белке: P16219». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал 14 августа 2016 г.. Получено 23 июля 2016.
  9. ^ «Информация о белке: Q07417». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал 14 августа 2016 г.. Получено 23 июля 2016.
  10. ^ Voet DJ, Voet JG, Pratt CW (2010). «Глава 18, Митохондриальный синтез АТФ». Принципы биохимии (4-е изд.). Вайли. п. 667. ISBN  978-0-470-23396-2.
  11. ^ Шмидт С.П., Коридон Т.Дж., Педерсен С.Б., Бросс П., Грегерсен Н. (июнь 2010 г.). «Неправильная укладка короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы приводит к делению митохондрий и окислительному стрессу». Молекулярная генетика и метаболизм. 100 (2): 155–62. Дои:10.1016 / j.ymgme.2010.03.009. PMID  20371198.
  12. ^ Джетва Р., Беннетт М.Дж., Фокли Дж. (Декабрь 2008 г.). «Недостаток короткоцепочечной ацил-кофермента А дегидрогеназы». Молекулярная генетика и метаболизм. 95 (4): 195–200. Дои:10.1016 / j.ymgme.2008.09.007. ЧВК  2720545. PMID  18977676.
  13. ^ Окуяз Ч., Эзгу Ф.С., Бибероглу Г., Зевиани М., Тиранти В., Йилгер Э. (июнь 2008 г.). «Тяжелая детская гипотония с этилмалоновой ацидурией: клинический случай». Журнал детской неврологии. 23 (6): 703–5. Дои:10.1177/0883073807313048. PMID  18539996. S2CID  46624539.
  14. ^ а б c Вулф Л., Джетва Р., Оглсби Д., Фокли Дж. (1993). «Дефицит короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы». PMID  21938826. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  15. ^ Pedersen CB, Kølvraa S, Kølvraa A, Stenbroen V, Kjeldsen M, Ensenauer R, Tein I, Matern D, Rinaldo P, Vianey-Saban C, Ribes A, Lehnert W, Christensen E, Corydon TJ, Andresen BS, Vang S, Болунд Л., Фокли Дж., Бросс П., Грегерсен Н. (август 2008 г.). «В спектре вариаций гена ACADS у 114 пациентов с дефицитом короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы (SCAD) преобладают бессмысленные вариации, приводящие к неправильной укладке белка на клеточном уровне». Генетика человека. 124 (1): 43–56. Дои:10.1007 / s00439-008-0521-9. PMID  18523805. S2CID  25491212.
  16. ^ Бок Л.А., Врекен П., Вейбург Ф.А., Вандерс Р.Дж., Грегерсен Н., Коридон М.Дж., Уотерхэм Х.Р., Дюран М. (ноябрь 2003 г.). «Дефицит короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы: исследования в большой семье усложняют заболевание». Педиатрия. 112 (5): 1152–5. Дои:10.1542 / педс.112.5.1152. PMID  14595061.
  17. ^ ван Мальдегем Б.Т., Дюран М., Вандерс Р.Дж., Уотерхэм Х.Р., Вейбург Ф.А. (март 2010 г.). «Статус флавинадениндинуклеотида и эффекты лечения высокими дозами рибофлавина при дефиците короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы». Педиатрические исследования. 67 (3): 304–8. Дои:10.1203 / PDR.0b013e3181cbd57b. PMID  19952864.
  18. ^ Джурджутиу Д.В., Эспиноза Л.М., Wood TC, DuPont BR, Holden KR (январь 2008 г.). «Устойчивое нарушение роста при синдроме Прадера-Вилли, связанное с вариантом гена ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой цепью». Журнал детской неврологии. 23 (1): 112–7. Дои:10.1177/0883073807307979. PMID  18184946. S2CID  31888136.
  19. ^ Хорнбак М., Банасик К., Юстесен Дж.М., Краруп Н.Т., Сандхольт С.Х., Андерссон А., Сандбек А., Лауритцен Т., Писингер С., Витте Д.Р., Соренсен Т.А., Педерсен О., Хансен Т. (6 января 2011 г.). «Минорный C-аллель rs2014355 в ACADS связан со сниженным высвобождением инсулина после пероральной глюкозной нагрузки». BMC Medical Genetics. 12: 4. Дои:10.1186/1471-2350-12-4. ЧВК  3022800. PMID  21211036.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.