ACADVL - ACADVL

ACADVL
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2UXW, 3B96
Идентификаторы
Псевдонимы	ACADVL, ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь, ACAD6, LCACD, VLCAD, ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь
Внешние идентификаторы	OMIM: 609575 MGI: 895149 ГомолоГен: 5 Генные карты: ACADVL
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	7,225,266 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	70,015,411 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• оксидоредуктазная активность, действующая на группу доноров CH-CH; • активность ацил-КоА дегидрогеназы; • оксидоредуктазная активность; • связывание флавинаденин динуклеотидов; • активность длинноцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы; • связывание жирных ацил-КоА; • активность ацил-КоА дегидрогеназы с очень длинной цепью;
Сотовый компонент	• мембрана; • митохондриальный матрикс; • ядрышко; • митохондрия; • митохондриальная внутренняя мембрана; • митохондриальный нуклеоид; • ядро клетки; • цитозоль; • митохондриальные мембраны;
Биологический процесс	• дифференцировка эпителиальных клеток; • отрицательная регуляция процесса биосинтеза жирных кислот; • липидный обмен; • отрицательное регулирование окисления жирных кислот; • получение энергии путем окисления органических соединений; • метаболический процесс жирных кислот; • регулирование процесса обмена холестерина; • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка; • бета-окисление жирных кислот; • температурный гомеостаз; • окислительно-восстановительный процесс; • катаболический процесс жирных кислот; • реакция на холод; • бета-окисление жирных кислот с использованием ацил-КоА дегидрогеназы;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	37
	11370
	ENSG00000072778
	ENSMUSG00000018574
	P49748
	P50544
	NM_000018; NM_001033859; NM_001270447; NM_001270448
	NM_017366
	NP_000009; NP_001029031; NP_001257376; NP_001257377
	NP_059062
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА-дегидрогеназа с очень длинной цепью, митохондриальная (VLCAD) - это фермент, который у человека кодируется ACADVL ген.

Мутации в ACADVL связаны с дефицит дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью. В белок кодируемый этим геном, нацелен на внутренняя митохондриальная мембрана, где он катализирует первую стадию пути бета-окисления митохондриальных жирных кислот. Этот ацил-коэнзим А дегидрогеназа специфичен для длинноцепочечных и очень длинноцепочечных жирных кислот. Дефицит этого генного продукта снижает бета-окисление жирных кислот миокарда и связан с кардиомиопатия. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[5]

Структура

Ген ACADVL содержит 20 экзоны,^[6] и имеет длину около 5,4 КБ.^[7] VLCAD имеет интересную структуру генов у людей, поскольку он расположен в структуре «голова к голове» с DLG4 ген на Хромосома 17, и что транскрибируемые области этих генов перекрываются. Было показано, что лечение DEHP приводит к активации минимальным промотором.^[8] Хотя DLG4 и VLCAD имеют общие регуляторные элементы, каждый из них имеет отдельные и отличные тканеспецифичные элементы, которые обеспечивают их функцию. У мышей эти два гена расположены «голова к голове», но не перекрываются.^[7]

Функция

Фермент VLCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот, образуя транс-двойную связь C2-C3 в жирной кислоте. VLCAD специфичен для жирных кислот с очень длинной цепью, обычно C16-acylCoA и более длинных.^[9] У мышей с дефицитом VLCAD гиперацетилирование белка в печени практически отсутствует; это означает, что белок VLCAD также необходим для ацетилирование белков в этой биологической системе.^[10]

Клиническое значение

ACADVL связан с дефицит дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью (VLCADD), который имеет множество симптомов и обычно представляет собой один из трех фенотипы. Первый - тяжелый, с ранним началом и высокой смертностью; наиболее частым симптомом является эта форма кардиомиопатия. Вторая форма - это поздняя детская форма с более легкими симптомами, которые чаще всего проявляются в виде гипокетотической гипогликемии. Окончательная форма проявляется в зрелом возрасте и представляет собой изолированное поражение скелетных мышц, рабдомиолиз, и миоглобинурия, который запускается упражнениями или голоданием.^[11] Заболевание обычно диагностируется при первом выполнении тандемная масс-спектрометрия на образце крови пациента в период стресса, а затем проводят молекулярно-генетическое тестирование на наличие гена ACADVL. Дефицит лечится систематически, но при определенных условиях, таких как голодание, раздражение миокарда, обезвоживание, и следует избегать диет с высоким содержанием жиров, чтобы предотвратить вторичные осложнения.^[12]

Взаимодействия

ACADVL имеет 75 двоичных белок-белковые взаимодействия в том числе 73 сопряженных взаимодействия. ACADVL, похоже, взаимодействует с RPSA и GPHN.^[13]

Смотрите также

Ацил-КоА-дегидрогеназа

дальнейшее чтение

Коста К.Г., Дорланд Л., де Алмейда ИТ, Якобс К., Дюран М., Poll-The BT (июнь 1998 г.). «Влияние голодания, нагрузки длинноцепочечных триглицеридов и нагрузки карнитина на уровни длинноцепочечного ацилкарнитина в плазме при дефиците митохондриальной очень длинноцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 21 (4): 391–9. Дои:10.1023 / А: 1005354624735. PMID 9700596. S2CID 2198523.

внешняя ссылка

GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о дефиците дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью
Человек ACADVL расположение генома и ACADVL страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072778 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018574 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь».

[6] Штраус А.В., Пауэлл К.К., Хейл Д.Е., Андерсон М.М., Ахуджа А., Брэкетт Дж. К., Sims HF (ноябрь 1995 г.). «Молекулярная основа дефицита ацил-КоА дегидрогеназы митохондрий человека с очень длинной цепью, вызывающего кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (23): 10496–500. Дои:10.1073 / пнас.92.23.10496. ЧВК 40638. PMID 7479827.

[Zhou_2003-7] а ^б Чжоу С., Блумберг Б. (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура человеческого VLCAD и DLG4». Ген. 305 (2): 161–6. Дои:10.1016 / s0378-1119 (02) 01235-0. PMID 12609736.

[8] Чжан Л.Ф., Дин Дж.Х., Ян Б.З., Хе ГК, Роу С. (декабрь 2003 г.). «Характеристика области двунаправленного промотора между человеческими генами, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика. 82 (6): 660–8. Дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00211-8. PMID 14611808.

[9] Аояма Т., Сури М., Ушикубо С., Камиджо Т., Ямагути С., Келли Р.И., Рхед В.Дж., Утаке К., Танака К., Хашимото Т. (июнь 1995 г.). «Очистка человеческой дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью и характеристика ее дефицита у семи пациентов». Журнал клинических исследований. 95 (6): 2465–73. Дои:10.1172 / JCI117947. ЧВК 295925. PMID 7769092.

[10] Пуговкина О., Те Бринке Х., Офман Р., ван Крухтен А.Г., Кулик В., Вандерс Р.Дж., Хаутен С.М., де Бур В.К. (июль 2014 г.). «Ацетилирование митохондриального белка вызывается ацетил-КоА в результате окисления жирных кислот». Молекулярная генетика человека. 23 (13): 3513–22. Дои:10.1093 / hmg / ddu059. PMID 24516071.

[11] Андресен Б.С., Олпин С., Поортуис Б.Дж., Шольте Х.Р., Виани-Сабан К., Вандерс Р., Ийлст Л., Моррис А., Пурфарзам М., Бартлетт К., Баумгартнер Е. Бросс П., Болунд Л., Грегерсен Н. (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания при дефиците ацил-КоА дегидрогеназы с очень длинной цепью». Американский журнал генетики человека. 64 (2): 479–94. Дои:10.1086/302261. ЧВК 1377757. PMID 9973285.

[12] Лесли, Н. Д .; Валенсия, К. А .; Штраус, А. В .; Zhang, K .; Adam, M. P .; Ardinger, H.H .; Pagon, R.A .; Wallace, S.E .; Bean LJH; Стивенс, К .; Амемия, А. (1993). «Дефицит ацил-кофермента дегидрогеназы с очень длинной цепью». PMID 20301763. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)

[13] «75 бинарных взаимодействий найдено по поисковому запросу ACADVL». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-24.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]