Диацилглицерин киназа - Diacylglycerol kinase

Диацилглицерин киназа
Растворимая диацилглицеринкиназа DgkB из Staphylococcus aureus.png
DgkB, растворимый DAGK из Золотистый стафилококк. α-спирали - красным, β-тяжи - желтым, витки - зеленым.
Идентификаторы
Номер ЕС2.7.1.107
Количество CAS60382-71-0
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Прокариотическая диацилглицеринкиназа
Идентификаторы
СимволДАГК_прокар
PfamPF01219
ИнтерПроIPR000829
PROSITEPDOC00820
OPM суперсемейство196
Белок OPM4d2e
Каталитический домен диацилглицеринкиназы
Идентификаторы
СимволDAGK_cat
PfamPF00781
Pfam кланCL0240
ИнтерПроIPR001206
УМНАЯDAGKc
Дополнительный домен диацилглицеринкиназы
Идентификаторы
СимволDAGK_acc
PfamPF00609
ИнтерПроIPR000756
УМНАЯДАГКа

Диацилглицерин киназа (DGK или DAGK) - это семейство ферментов, катализирующих превращение диацилглицерин (DAG) на фосфатидная кислота (PA), используя АТФ как источник фосфата. В нестимулированных клетках активность DGK низкая, что позволяет использовать DAG для глицерофосфолипид биосинтез, но при активации рецептора фосфоинозитид пути, активность DGK увеличивается, вызывая превращение DAG в PA. Поскольку считается, что оба липида действуют как биоактивные липидная сигнализация молекулы с различными клеточными мишенями, DGK, следовательно, занимает важное положение, эффективно выступая в качестве переключателя, прекращая передачу сигналов одним липидом, одновременно активируя передачу сигналов другим.[1]

В бактерии, DGK очень маленький (от 13 до 15 кДа) мембранный белок который, кажется, содержит три трансмембранные домены.[2] Самый лучший консервированный регион - участок 12 остатки которые расположены в цитоплазматический петля между вторым и третьим трансмембранными доменами. Немного Грамположительные бактерии также кодируют растворимую диацилглицерин киназу, способную повторно вводить DAG в фосфолипид путь биосинтеза. ДАГ накапливается в грамположительных бактериях в результате переноса глицерин-1-фосфатных фрагментов из фосфатидилглицерин к липотехоновая кислота.[3]

Изоформы DGK млекопитающих

В настоящее время клонированы и идентифицированы девять членов семейства DGK. Хотя все члены семейства имеют консервативные каталитические домены и два цистеин богатые домены, их дополнительно классифицируют на пять групп в соответствии с наличием дополнительных функциональных доменов и субстратной специфичностью.[4] Это следующие:

  • Тип 1 - ДГК-α, ДГК-β, ДГК-γ - содержат EF-рука мотивы и домен гомологии восстановления
  • Тип 2 - ДГК-δ, ДГК-η - содержат гомология плекстрина домен
  • Тип 3 - ДГК-е - имеет специфичность для арахидонат -содержащий DAG
  • Тип 4 - ДГК-ζ, ДГК-ι - содержат ОТМЕТКИ область гомологии, анкирин повторяет, C-терминал сигнал ядерной локализации, а ПДЗ переплетный мотив.
  • Тип 5 - DGK-θ - содержит третий богатый цистеином домен, домен гомологии плекстрина и богатый пролином участок

Клиническое значение

Мутации в генах дезоксигуанозинкиназы вместе с миофосфорилаза были связаны с мышцами гликогеноз и митохондриальная гепатопатия. В дублирование в экзон 6 dGK, который приводит к усеченному белку и G456A PYGM мутация были связаны с дефицитом фосфорилазы в мышцах, цитохром с оксидаза недостаточность печени, тяжелая врожденная гипотония, гепатомегалия, и отказ печени. Это расширяет текущее понимание Болезнь Макардла и предполагает, что эта комбинация мутаций может привести к сложному заболеванию с тяжелым фенотипы.[5]

Рекомендации

  1. ^ Мерида I, Авила-Флорес А., Мерино Э. (январь 2008 г.). «Диацилглицерин киназы: в центре клеточной передачи сигналов». Биохимический журнал. 409 (1): 1–18. Дои:10.1042 / BJ20071040. PMID  18062770.
  2. ^ Смит Р.Л., О'Тул Дж. Ф., Магуайр М.Э., Сандерс С.Р. (сентябрь 1994 г.). «Мембранная топология диацилглицерин киназы Escherichia coli». Журнал бактериологии. 176 (17): 5459–65. Дои:10.1128 / jb.176.17.5459-5465.1994. ЧВК  196734. PMID  8071224.
  3. ^ Miller DJ, Jerga A, Rock CO, White SW (июль 2008 г.). «Анализ структуры Staphylococcus aureus DgkB показывает общий каталитический механизм для растворимых диацилглицерин киназ». Структура. 16 (7): 1036–46. Дои:10.1016 / j.str.2008.03.019. ЧВК  2847398. PMID  18611377.
  4. ^ ван Блиттерсвейк WJ, Houssa B (октябрь 2000 г.). «Свойства и функции диацилглицеринкиназ». Сотовая связь. 12 (9–10): 595–605. Дои:10.1016 / s0898-6568 (00) 00113-3. PMID  11080611.
  5. ^ Манкузо М., Филосто М., Цуджино С., Ламперти С., Шанске С., Кокет М., Деснуэль С., ДиМауро С. (октябрь 2003 г.). «Мышечный гликогеноз и митохондриальная гепатопатия у младенца с мутациями в генах миофосфорилазы и дезоксигуанозинкиназы». Архив неврологии. 60 (10): 1445–7. Дои:10.1001 / archneur.60.10.1445. PMID  14568816.

внешняя ссылка