Экзорибонуклеаза - Exoribonuclease

Диаграммы реакций гидролитического (слева) и фосфоролитического (справа) расщепления РНК 3'-5'-экзорибонуклеазой.

An экзорибонуклеаза является экзонуклеаза рибонуклеаза, которые являются ферментами, разрушающими РНК удалив терминал нуклеотиды либо из 5 'конец или 3 'конец молекулы РНК. Ферменты, удаляющие нуклеотиды с 5 'конца, называются 5'-3 'экзорибонуклеазы, а ферменты, удаляющие нуклеотиды с 3 'конца, называются 3'-5 'экзорибонуклеазы.

Экзорибонуклеазы могут использовать воду для разрыва нуклеотидно-нуклеотидной связи (что называется гидролитической активностью) или неорганический фосфат (что называется фосфоролитической активностью). Гидролитические экзорибонуклеазы классифицируются как Номер ЕС 3.1 и фосфоролитические экзорибонуклеазы под номером ЕС 2.7.7. Поскольку фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления связей, которые они освобождают нуклеотиддифосфаты, тогда как гидролитические ферменты (которые используют воду) высвобождают нуклеотидные монофосфаты.

Экзорибонуклеазы существуют во всех царствах жизни, бактерии, археи, и эукариоты. Экзорибонуклеазы участвуют в деградации многих различных видов РНК, включая информационная РНК, переносить РНК, рибосомная РНК и miRNA. Экзорибонуклеазы могут быть одиночными белками (такими как РНКаза D или же РНКаза PH ), но также могут быть комплексами из нескольких белков, таких как экзосомальный комплекс (в котором представлены четыре основных семейства экзорибонуклеаз).

Основные семьи

СемьяПримеры участниковРаспределениеКаталитическая активность
RNRРНКаза RБольшинство бактерий, все эукариоты3'-5 'гидролитический
РНКаза II
Rrp44
DEDDРНКаза DНекоторые бактерии, все эукариоты3'-5 'гидролитический
РНКаза Т
PM / Scl-100
Олигорибонуклеаза
RBNРНКаза BNОпределенные бактерии3'-5 'гидролитический
PDXPNPaseВсе королевства3'-5 'фосфоролитический
PM / Scl-75
РНКаза PH
RRP4Rrp4Все эукариоты, большинство архей3'-5 'гидролитический
5PXЭкзорибонуклеаза IВсе эукариоты5'-3 'гидролитический
Экзорибонуклеаза II

Смотрите также

Рекомендации

  • Zuo Y; Deutscher MP. (2001). «Суперсемейства экзорибонуклеаз: структурный анализ и филогенетическое распределение». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (5): 1017–26. Дои:10.1093 / nar / 29.5.1017. ЧВК  56904. PMID  11222749.

внешняя ссылка