Эндонуклеаза UvrABC - UvrABC endonuclease

Эндонуклеаза UvrABC представляет собой мультиферментный комплекс в бактерии участвует в Ремонт ДНК к эксцизионная репарация нуклеотидов, и поэтому его иногда называют эксинуклеаза. Этот процесс репарации UvrABC, иногда называемый процессом короткого пятна, включает удаление двенадцати нуклеотидов, где произошла генетическая мутация, за которой следует ДНК-полимераза, замена этих аберрантных нуклеотидов правильными нуклеотидами и завершение Ремонт ДНК. Субъединицы этого фермента кодируются в uvrA, uvrB, и uvrC гены. Этот ферментный комплекс способен восстанавливать множество различных типов повреждений, в том числе циклобутиловый димер формирование.[1]

Механизм

  1. Два белка UvrA образуют димер, и оба они обладают активностью АТФазы / ГТФазы.
  2. УврА димер связывается с димером UvrB[2] и образует комплекс, способный обнаруживать Повреждение ДНК. Димер UvrA функционирует как единица, отвечающая за обнаружение повреждений ДНК, вероятно, за счет механизма обнаружения искажений в ДНК. Двойная спираль ДНК.
  3. После привязки УВРА2B2 комплекс с предполагаемым поврежденным сайтом, ДНК оборачивается вокруг UvrB[3]
  4. Димер UvrA выходит и белок UvrC входит и связывается с UvrB и, следовательно, образует новый комплекс UvrBC.
  5. UvrC отвечает за раскалывание нуклеотиды по обе стороны от повреждения ДНК.[4] Он раскалывает фосфодиэфирная связь четыре нуклеотида ниже повреждения ДНК и расщепляет фосфодиэфирная связь восемь нуклеотидов перед повреждением ДНК и создает вырезанный из двенадцати нуклеотидов сегмент.
  6. ДНК-геликаза Затем входит II (иногда называемый UvrD) и удаляет вырезанный сегмент путем удаления пары оснований. UvrB все еще остается на месте, даже несмотря на то, что UvrC отделился на данном этапе, поскольку UvrB может быть задействован для предотвращения повторный отжиг вырезанной ДНК.
  7. ДНК-полимераза I входит и заполняет правильную последовательность нуклеотидов, запуская UvrB в процессе, а последняя фосфодиэфирная связь завершается ДНК-лигазой.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Гроссман Л., Йунг А. Т. (1990). «Эндонуклеазная система UvrABC Escherichia coli - взгляд из Балтимора». Мутат. Res. 236 (2–3): 213–21. Дои:10.1016 / 0921-8777 (90) 90006-кв. PMID  2144612.
  2. ^ Верховен, Эстер Э. А .; Вайман, Клэр; Мооленаар, Джери Ф .; Гусен, Нора (2002-08-01). «Наличие двух субъединиц UvrB в комплексе UvrAB обеспечивает обнаружение повреждений в обеих цепях ДНК». Журнал EMBO. 21 (15): 4196–4205. Дои:10.1093 / emboj / cdf396. ISSN  0261-4189. ЧВК  126143. PMID  12145219.
  3. ^ «uvrB - системный белок B UvrABC - Escherichia coli (штамм K12) - ген и белок uvrB». www.uniprot.org. Получено 2016-02-28.
  4. ^ Verhoeven, E. E .; ван Кестерен, М .; Moolenaar, G.F .; Visse, R .; Гусен, Н. (18 февраля 2000 г.). «Каталитические сайты для 3 'и 5' разрезов эксцизионной репарации нуклеотидов Escherichia coli расположены в UvrC». Журнал биологической химии. 275 (7): 5120–5123. Дои:10.1074 / jbc.275.7.5120. ISSN  0021-9258. PMID  10671556.

внешняя ссылка