Галактозо-1-фосфат уридилилтрансфераза - Galactose-1-phosphate uridylyltransferase

ГАЛТ
Галактозо-1-фосфатуридилилтрансфераза 1GUP.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыГАЛТ, entrez: 2592, галактозо-1-фосфатуридилилтрансфераза
Внешние идентификаторыOMIM: 606999 MGI: 95638 ГомолоГен: 126 Генные карты: ГАЛТ
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное местоположение для GALT
Геномное местоположение для GALT
Группа9п13.3Начните34,638,133 бп[1]
Конец34,651,035 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001258332
NM_000155

NM_016658
NM_001302511

RefSeq (белок)

NP_000146
NP_001245261

Расположение (UCSC)Chr 9: 34,64 - 34,65 МбChr 4: 41.76 - 41.76 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Галактозо-1-фосфатуридилтрансфераза, N-концевой домен
Идентификаторы
СимволGalP_UDP_transf
PfamPF01087
Pfam кланCL0265
PROSITEPDOC00108
SCOP21hxp / Объем / СУПФАМ
Галактозо-1-фосфатуридилтрансфераза, С-концевой домен
PDB 1gup EBI.jpg
структура нуклеотидилтрансферазы в комплексе с udp-галактозой
Идентификаторы
СимволGalP_UDP_tr_C
PfamPF02744
Pfam кланCL0265
ИнтерПроIPR005850
PROSITEPDOC00108
SCOP21hxp / Объем / СУПФАМ

Галактозо-1-фосфат уридилилтрансфераза (или ГАЛТ) является фермент (EC 2.7.7.12 ) отвечает за преобразование полученного галактоза к глюкоза.[5]

Галактозо-1-фосфатуридиллилтрансфераза (GALT) катализирует вторую стадию Leloir путь галактоза обмен веществ, а именно:

UDP-глюкоза + галактозо-1-фосфат глюкозо-1-фосфат + UDP-галактоза

Выражение GALT контролируется действиями FOXO3 ген. Отсутствие этого фермента приводит к классической галактоземии у человека и может быть фатальным в период новорожденности, если лактоза не удаляется из рациона. Патофизиология галактоземии четко не определена.[5]

Механизм

GALT катализирует вторую реакцию пути Лелуара метаболизма галактозы через би-би для пинг-понга. кинетика с двойное перемещение механизм.[6] Это означает, что чистая реакция состоит из двух реагентов и двух продуктов (см. Реакцию выше) и протекает по следующему механизму: фермент реагирует с одним субстратом с образованием одного продукта и модифицированного фермента, который продолжает реагировать со вторым. субстрат для получения второго продукта при регенерации исходного фермента.[7] В случае GALT остаток His166 действует как мощный нуклеофил для облегчения переноса нуклеотида между UDP-гексозами и гексозо-1-фосфатами.[8]

  1. UDP-глюкоза + E-His ⇌ глюкозо-1-фосфат + E-His-UMP
  2. Галактоза-1-фосфат + E-His-UMP ⇌ UDP-галактоза + E-His[8]
Двухступенчатое действие галактозо-1-фосфатуридилтрансферазы. Изображение адаптировано из [9]

Структурные исследования

Трехмерная структура на 180 вечера разрешающая способность (рентгеновская кристаллография ) GALT был определен Ведекиндом, Фреем и Реймент, и их структурный анализ показал ключевые аминокислоты необходим для функции GALT.[8] Среди них Leu4, Phe75, Asn77, Asp78, Phe79 и Val108, которые согласуются с остатками, которые участвовали как в экспериментах по точечной мутации, так и в клиническом скрининге, которые играют роль в галактоземии человека.[8][10]

Клиническое значение

Причины дефицита GALT классическая галактоземия. Галактоземия является аутосомно-рецессивным наследственным заболеванием, выявляемым у новорожденных и детей.[11] Это происходит примерно у 1 из 40 000-60 000 живорожденных младенцев. Классическая галактоземия (G / G) вызвано дефицитом активности GALT, тогда как более частые клинические проявления, Дуарте (D / D) и Дуарте / классический вариант (D / G) вызваны ослаблением активности GALT.[12] Симптомы включают недостаточность функции яичников, диспраксия (трудно говорить правильно и последовательно),[13] и неврологический дефицит.[12] Единственная мутация в любой из нескольких пар оснований может привести к дефициту активности GALT.[14] Например, одна мутация от A до G в экзоне 6 гена GALT изменяет Glu188 на аргинин а мутация от A до G в экзоне 10 превращает Asn314 в аспарагиновая кислота.[12] Эти две мутации также добавляют новые рестрикционный фермент сайты cut, которые позволяют обнаруживать и проводить крупномасштабный скрининг населения с помощью ПЦР (полимеразной цепной реакции ).[12] Скрининг в основном устранил неонатальную смерть от G / G-галактоземии, но болезнь из-за роли GALT в биохимической метаболизм проглоченного галактоза (который токсичен при накоплении) на энергетически полезный глюкоза, безусловно, может быть фатальным.[11][15] Тем не менее, люди, страдающие галактоземией, могут жить относительно нормальной жизнью, избегая молочных продуктов и всего, что содержит галактозу (потому что она не может быть метаболизирована), но все же существует вероятность проблем с неврологическим развитием или других осложнений, даже у тех, кто избегает галактозы.[16]

База данных болезней

База данных мутаций галактоземии (GALT)

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000213930 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036073 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Энтрез Ген: Галактозо-1-фосфатуридилтрансфераза GALT».
  6. ^ Вонг LJ, Фрей PA (сентябрь 1974 г.). «Галактозо-1-фосфат уридилилтрансфераза: исследования скорости, подтверждающие наличие промежуточного уридилил-фермента на каталитическом пути». Биохимия. 13 (19): 3889–94. Дои:10.1021 / bi00716a011. PMID  4606575.
  7. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2016-03-03. Получено 2010-05-19.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (ссылка на сайт)
  8. ^ а б c d Ведекинд Дж. Э., Фрей П. А., Реймент I (сентябрь 1995 г.). «Трехмерная структура галактозо-1-фосфат уридилилтрансферазы из Escherichia coli при разрешении 1,8 A». Биохимия. 34 (35): 11049–61. Дои:10.1021 / bi00035a010. PMID  7669762.
  9. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2008-12-04. Получено 2010-05-19.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (ссылка на сайт)
  10. ^ Сейрантепе В., Озгуц М., Джошкун Т., Озалп И., Райхардт Дж. К. (1999). «Идентификация мутаций в гене галактозо-1-фосфатуридилтрансферазы (GALT) у 16 ​​турецких пациентов с галактоземией, включая новую мутацию F294Y. Краткое описание мутации № 235. Онлайн». Человеческая мутация. 13 (4): 339. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 13: 4 <339 :: AID-HUMU18> 3.0.CO; 2-S. PMID  10220154.
  11. ^ а б Фридович-Кейл Ю.Л. (декабрь 2006 г.). «Галактоземия: хорошее, плохое и неизвестное». Журнал клеточной физиологии. 209 (3): 701–5. Дои:10.1002 / jcp.20820. PMID  17001680. S2CID  32233614.
  12. ^ а б c d Эльзас Л.Дж., Лэнгли С., Полк Е.М., Хьельм Л.Н., Дембур П.П. (1995). «Молекулярный подход к галактоземии». Европейский журнал педиатрии. 154 (7 Прил. 2): S21-7. Дои:10.1007 / BF02143798. PMID  7671959. S2CID  11937698.
  13. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2006-02-28. Получено 2010-05-19.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (ссылка на сайт)
  14. ^ Добровольски С.Ф., Банас Р.А., Сузов Дж. Г., Беркли М., Нейлор Е. В. (февраль 2003 г.). «Анализ распространенных мутаций в гене галактозо-1-фосфатуридилтрансферазы: новые методы для повышения чувствительности и специфичности скрининга новорожденных на галактоземию». Журнал молекулярной диагностики. 5 (1): 42–7. Дои:10.1016 / S1525-1578 (10) 60450-3. ЧВК  1907369. PMID  12552079.
  15. ^ Лай К., Эльзас Л.Дж., Вьеренга К.Дж. (ноябрь 2009 г.). «Галактозная токсичность у животных». IUBMB Life. 61 (11): 1063–74. Дои:10.1002 / iub.262. ЧВК  2788023. PMID  19859980.
  16. ^ http://www.umm.edu/ency/article/000366trt.htm

дальнейшее чтение

внешние ссылки