CDS2 - CDS2

CDS2
Идентификаторы
ПсевдонимыCDS2, CDP-диацилглицеринсинтаза 2
Внешние идентификаторыOMIM: 603549 MGI: 1332236 ГомолоГен: 37854 Генные карты: CDS2
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение CDS2
Геномное расположение CDS2
Группа20п12.3Начинать5,126,879 бп[1]
Конец5,197,887 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CDS2 212862 в формате fs.png

PBB GE CDS2 212864 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003818

NM_001291039
NM_001291040
NM_138651

RefSeq (белок)

NP_003809

NP_001277968
NP_001277969
NP_619592

Расположение (UCSC)Chr 20: 5.13 - 5.2 МбChr 2: 132,26 - 132,31 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фосфатидатцитидилилтрансфераза 2 является фермент что у людей кодируется CDS2 ген.[5][6][7]

Продукты распада фосфоинозитиды повсеместно вторые посланники эта функция ниже по течению многих G-белковые рецепторы и тирозинкиназы регулирование роста клеток, метаболизма кальция и протеинкиназа C Мероприятия. Этот ген кодирует фермент, который регулирует количество фосфатидилинозитола, доступного для передачи сигналов, катализируя превращение фосфатидная кислота к CDP -диацилглицерин. Этот фермент представляет собой интегральный мембранный белок, локализованный в двух субклеточных доменах, на матричной стороне внутренней митохондриальной мембраны, где, как считается, он участвует в синтезе фосфатидилглицерина и кардиолипин.[8][9] и цитоплазматическая сторона эндоплазматического ретикулума, где он участвует в биосинтезе фосфатидилинозитола. Два гена, кодирующие этот фермент, были идентифицированы у людей, один картирован с человеческой хромосомой 4q21 (CDS1 ) и второй (этот ген) к 20p13.[10]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции CDS2. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая CD2tm1a (КОМП) Wtsi[15][16] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа, проект мутагенеза с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[17][18][19]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[13][20] Было проведено 26 испытаний и два фенотипы сообщалось. Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких значительных отклонений от нормы.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101290 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058793 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Halford S, Dulai KS, Daw SC, Fitzgibbon J, Hunt DM (ноябрь 1998 г.). «Выделение и хромосомная локализация двух генов CDP-диацилглицеринсинтазы человека (CDS)». Геномика. 54 (1): 140–4. Дои:10.1006 / geno.1998.5547. PMID  9806839.
  6. ^ Volta M, Bulfone A, Gattuso C, Rossi E, Mariani M, Consalez GG, Zuffardi O, Ballabio A, Banfi S, Franco B. (январь 1999 г.). «Идентификация и характеристика CDS2, млекопитающего гомолога гена CDP-диацилглицеринсинтазы дрозофилы». Геномика. 55 (1): 68–77. Дои:10.1006 / geno.1998.5610. PMID  9889000.
  7. ^ «Ген Entrez: CDS2, CDP-диацилглицеринсинтаза (фосфатидатцитидилилтрансфераза) 2».
  8. ^ Новицки М, Мюллер Ф, Френтцен М (апрель 2005 г.). «Кардиолипинсинтаза Arabidopsis thaliana». Письма FEBS. 579 (10): 2161–5. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.03.007. PMID  15811335. S2CID  21937549.
  9. ^ Новицки М (2006). «Характеристика кардиолипин-синтазы Arabidopsis thaliana». Кандидат наук. Диссертация, RWTH-Aachen University. Архивировано из оригинал на 2011-10-05. Получено 2011-07-11.
  10. ^ «Ген Entrez: CDS1, CDP-диацилглицеринсинтаза (фосфатидатцитидилилтрансфераза) 1».
  11. ^ "Сальмонелла данные о заражении CD2 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ "Citrobacter данные о заражении CD2 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  13. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  14. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  15. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей». Архивировано из оригинал на 2012-03-20. Получено 2012-01-05.
  16. ^ "Информатика генома мыши".
  17. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  18. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  19. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  20. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение