Jmol - Jmol

Jmol
	Jmol трехмерная структура рендеринга стрептавидин
Разработчики)	Команда разработчиков jmol
изначальный выпуск	2001; 19 лет назад
Стабильный выпуск	14.6.4 (15 октября 2016 г.; 4 года назад) [±]
Предварительный выпуск	14.5.0 (7 ноября 2015 г.; 5 лет назад) [±]
Репозиторий	Sourceforge.сеть/ проекты/ мкмоль
Написано в	Ява
Операционная система	Кроссплатформенность
Платформа	Системы с Ява и Веб-браузеры без Java
Доступно в	16 языков
	Список языков Каталонский, китайский, чешский, датский, голландский, английский, французский, немецкий, венгерский, индонезийский, итальянский, корейский, португальский, испанский, турецкий, украинский
Тип	Молекулярное моделирование
Лицензия	LGPL 2.0
Интернет сайт	www.jmol.org

Jmol компьютер программного обеспечения для молекулярное моделирование химические структуры в 3-х мерный.^[2] Jmol возвращает трехмерное представление молекула который можно использовать как обучающий инструмент,^[3] или для исследования, например, в химия и биохимия Написано на языке программирования. Ява, поэтому он может работать в операционных системах Windows, macOS, Linux, и Unix, если установлена Java. это бесплатное программное обеспечение с открытым исходным кодом выпущен под Стандартная общественная лицензия ограниченного применения GNU (LGPL) версии 2.0. Автономное приложение и комплект для разработки программного обеспечения (SDK), который можно интегрировать в другие приложения Java, такие как Биоклипс и Таверна.

Популярной функцией является апплет, который можно интегрировать в веб-страницы для отображения молекул различными способами. Например, молекулы могут отображаться как клюшечные модели, модели, заполняющие пространство, ленточные диаграммы, так далее.^[4]Jmol поддерживает широкий спектр форматы файлов химических веществ, в том числе Банк данных белков (PDB), Кристаллографический информационный файл (cif), MDL Molfile (моль) и Язык химической разметки (CML). Также есть JavaScript -только (HTML5 ) версия, JSmol, который можно использовать на компьютерах без Java.^[5]

Апплет Jmol, среди других возможностей, предлагает альтернативу Перезвон плагин^[3] который больше не находится в активной разработке. Хотя Jmol имеет множество функций, которых не хватает Chime, он не претендует на воспроизведение всех функций Chime, в первую очередь, Лепить Режим. Перезвон требует плагин установка и Internet Explorer 6.0 или Firefox 2.0 на Майкрософт Виндоус, или Коммуникатор Netscape 4.8 на Mac OS 9. Jmol требует Ява установка и работает на самых разных платформах. Например, Jmol полностью работает в Mozilla Firefox, Internet Explorer, Опера, Гугл Хром, и Сафари.

Скриншоты

Кристаллическая структура РНП H / ACA-бокса из Pyrococcus furiosus.
Выделение двух солевых мостиков в тетрамере гемоглобина (гемогруппа в виде палочек внизу справа).
Фрагмент фактора транскрипции TFIIIA, образующий три последовательных мотива «цинковые пальцы», связанный с участком ДНК.
Эубактериальная рибосома 70S из Термус термофильный.