Jaguar (программное обеспечение) - Jaguar (software)
 | Эта статья поднимает множество проблем. Пожалуйста помоги Улучши это или обсудите эти вопросы на страница обсуждения. (Узнайте, как и когда удалить эти сообщения-шаблоны) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения)
|
| Разработчики) | Schrödinger Inc. |
|---|---|
| Операционная система | Linux, Майкрософт Виндоус, Mac OS X |
| Тип | Вычислительная химия |
| Лицензия | Коммерческий |
| Интернет сайт | https://www.schrodinger.com/jaguar |
Ягуар это компьютерное программное обеспечение пакет, используемый для ab initio квантовая химия расчеты как для газовой фазы, так и для фазы раствора.[1] Это коммерческое программное обеспечение, продаваемое компанией. Шредингер. Программа зародилась в исследовательских группах Ричард Фриснер и Уильям Годдард и первоначально назывался PS-GVB (имея в виду так называемый псевдоспектральный обобщенная валентная связь метод, указанный в программе).
Jaguar является составной частью двух других продуктов Schrödinger: Maestro, обеспечивающих графический интерфейс пользователя Ягуару и QM / MM программа QSite, который использует Jaguar в качестве квантово-химического двигателя. Текущая версия - Jaguar 10.4 (2020).
Функции
Отличительной особенностью Jaguar является использование псевдоспектрального приближения.[2] Это приближение может быть применено к вычислительно дорогостоящим интегральным операциям, присутствующим в большинстве квантово-химических расчетов. В результате вычисления выполняются быстрее с небольшой потерей точности.[3][4][5]
Текущая версия включает в себя следующие функции:
- Хартри – Фок (RHF, УВЧ, ROHF ) и теория функционала плотности (LDA, с поправкой на градиент, с поправкой на дисперсию и гибридный функционалы)
- местный второго порядка Теория возмущений Меллера – Плессе. (LMP2)
- обобщенная валентная связь расчеты идеального сопряжения (GVB-PP) и GVB-LMP2
- предсказание возбужденных состояний с помощью конфигурационное взаимодействие (СНГ) и теория функционала плотности, зависящая от времени (TDDFT)
- оптимизация геометрии и переходное состояние поиск
- расчеты сольватации на основе Уравнение Пуассона – Больцмана.
- предсказание инфракрасный (ИК), ядерный магнитный резонанс (ЯМР), ультрафиолетовый (УФ) и колебательный круговой дихроизм (VCD) спектры
- pKa прогноз
- создание различных молекулярных поверхностей (электростатический потенциал, электронная плотность, молекулярные орбитали так далее.)
- предсказание различных молекулярных свойств (мультипольные моменты, поляризуемости, колебательные частоты так далее.)
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Молодой, Дэвид (2001). «Приложение A. A.2.5 Jaguar». Вычислительная химия. Wiley-Interscience. п. 337.
- ^ Орзаг, Стивен А. (сентябрь 1972 г.). «Сравнение псевдоспектрального и спектрального приближения». Исследования по прикладной математике. 51 (3): 253–259. Дои:10.1002 / sapm1972513253.
- ^ Фриснер, Р.А. (октябрь 1991 г.). «Новые методы расчета электронной структуры больших молекул» (PDF). Ежегодный обзор физической химии. 42 (1): 341–367. Bibcode:1991ARPC ... 42..341F. Дои:10.1146 / annurev.pc.42.100191.002013.
- ^ Фриснер, Ричард А .; Мерфи, Роберт Б .; Бичи, Майкл Д .; Ringnalda, Murco N .; Поллард, В. Томас; Dunietz, Barry D .; Цао, Исян (апрель 1999 г.). "Коррелированные ab initio расчеты электронной структуры больших молекул". Журнал физической химии A. 103 (13): 1913–1928. Bibcode:1999JPCA..103.1913F. Дои:10.1021 / jp9825157.
- ^ Ладо, Ф .; Lomba, E .; Ломбардеро, М. (1995). «Алгоритм интегрального уравнения для жидкостей с полностью анизотропными молекулами» (PDF). Журнал химической физики. 103 (1): 481. Bibcode:1995ЖЧФ.103..481Л. Дои:10.1063/1.469615.