Метилмалонил-КоА эпимераза - Methylmalonyl CoA epimerase
| метилмалонил-КоА эпимераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 5.1.99.1 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| метилмалонил-КоА эпимераза | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Символ | MCEE | ||||||
| Ген NCBI | 84693 | ||||||
| HGNC | 16732 | ||||||
| OMIM | 608419 | ||||||
| RefSeq | NM_028626 | ||||||
| UniProt | Q96PE7 | ||||||
| Прочие данные | |||||||
| Номер ЕС | 5.1.99.1 | ||||||
| Locus | Chr. 2 p13.3 | ||||||
| |||||||
Метилмалонил-КоА эпимераза (ЕС 5.1.99.1, метилмалонил-КоА рацемаза, метилмалонил-коэнзим А рацемаза, DL-метилмалонил-КоА рацемаза, 2-метил-3-оксопропаноил-КоА 2-эпимераза [неверно]) является фермент участвует в катаболизм жирных кислот что кодируется в человеке "MCEE" ген расположен на хромосома 2. Его обычно неправильно называют «метилмалонил-КоА рацемаза». Это не рацемаз потому что CoA часть есть 5 других стереоцентры.
Структура
"МЦЭИ" ген находится в области 2p13 и содержит 4 экзоны, и кодирует для белок размером примерно 18 кДа, расположенный в митохондриальный матрикс.[1] Существует несколько природных вариантов аминокислотных последовательностей. Структура белка MCEE была решена с помощью Рентгеновская кристаллография [2] при разрешении 1,8 ангстрем.
Функция
Ген MCEE кодирует фермент, который взаимно превращает D- и L-метилмалонил-КоА во время деградации аминокислоты с разветвленной цепью, жирные кислоты с нечетной длиной цепи и другие метаболиты. С точки зрения биохимии, он катализирует реакцию, которая превращает (S)-метилмалонил-КоА в (р) форма.[3][4] Этот фермент катализирует следующее химическая реакция
- (S) -метилмалонил-КоА (р) -метилмалонил-КоА
Метилмалонил-КоА-эпимераза играет важную роль в катаболизме жирные кислоты с углеродными цепями нечетной длины. В катаболизме четной цепи насыщенные жирные кислоты, то β-окислительный путь расщепляет молекулы жирного ацил-КоА в повторяющихся последовательностях четырех реакций с образованием одной ацетил-КоА на повторяющуюся последовательность. Это означает, что в каждом цикле β-окисления жирный ацил-Со-А укорачивается на два атома углерода. Если бы жирная кислота начиналась с четного числа атомов углерода, этот процесс мог бы расщепить всю насыщенную жирную кислоту на единицы ацетил-КоА. Однако, если бы жирная кислота начиналась с нечетного числа атомов углерода, β-окисление разрушило бы жирный ацил-КоА до тех пор, пока три атома углерода пропионил-КоА сформирован. Чтобы превратить это в метаболически полезный сукцинил-КоА, необходимы три реакции. Пропионил-КоА сначала карбоксилируется до (S) -метилмалонил-КоА ферментом Пропионил-КоА карбоксилаза. Метилмалонил-КоА-эпимераза затем катализирует перегруппировку (S) -метилмалонил-КоА к (р) в реакции, использующей витамин B12 кофактор и резонансно-стабилизированный карбанион средний.[нужна цитата ] (р) -метилмалонил-КоА затем превращается в сукцинил-КоА в реакции, катализируемой метилмалонил-КоА мутаза.
Действуя как общая база, фермент отрывает протон от β-углерода (р) -метилмалонил-КоА. Это приводит к образованию промежуточного карбаниона, в котором -углерод стабилизирован резонансом. Затем фермент действует как обычная кислота, протонируя β-углерод, что приводит к образованию (S) -метилмалонил-КоА.
Клиническое значение
Мутации в гене MCEE вызывает дефицит метималонил-КоА эпимеразы (MCEED),[5] редкий аутосомно-рецессивный врожденная ошибка обмена веществ в метаболизме аминокислот с участием аминокислоты с разветвленной цепью валин, лейцин, и изолейцин. Пациенты с MCEED могут иметь опасные для жизни неонатальные Метаболический ацидоз, гипераммониемия, трудности с кормлением, и кома.
использованная литература
- ^ «MCEE - Метилмалонил-КоА эпимераза, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (Human) - ген и белок MCEE». www.uniprot.org.
- ^ Европа, Банк данных по белкам в. "Краткое описание структуры PDB 3rmu‹ Банк данных по белкам в Европе (PDBe) ‹EMBL-EBI". www.ebi.ac.uk.
- ^ Мазумдер Р., Сасакава Т., Казиро Ю., Очоа С. (октябрь 1962 г.). «Метаболизм пропионовой кислоты в тканях животных. IX. Метилмалонил-кофермент А рацемаза». Журнал биологической химии. 237: 3065–8. PMID 13934211.
- ^ Оверат П., Келлерман Г.М., Линен Ф., Фриц Х.П., Келлер Г.Дж. (1962). «[О механизме перегруппировки метилмалонил-Со А в сукцинил-Со А. II. Эксперименты по механизму действия метилмалонил-Со А изомеразы и метилмалонил-Со А рацемазы]». Biochemische Zeitschrift. 335: 500–18. PMID 14482843.
- ^ Bikker H, Bakker HD, Abeling NG, Poll-The BT, Kleijer WJ, Rosenblatt DS, Waterham HR, Wanders RJ, Duran M (июль 2006 г.). «Гомозиготная нонсенс-мутация в гене метилмалонил-КоА-эпимеразы (MCEE) приводит к легкой метилмалоновой ацидурии». Человеческая мутация. 27 (7): 640–3. Дои:10.1002 / humu.20373. PMID 16752391. S2CID 5821956.
внешние ссылки
- метилмалонил-КоА + эпимераза в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
