Кинурениназа - Kynureninase
| кинурениназа | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура Homo sapiens кинурениназа.[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 3.7.1.3 | ||||||||
| Количество CAS | 9024-78-6 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Кинурениназа или L-кинуренингидролаза (KYNU) (EC 3.7.1.3 ) это PLP зависимый фермент что катализирует расщепление кинуренин (Кын) в антраниловая кислота (Муравей). Он также может действовать на 3hKyn (производить 3hAnt ) и некоторые другие (3-арилкарбонил) -аланины. У человека экспрессируется один фермент кинурениназа, который кодируется KYNU ген расположен на хромосоме 2.[6][7]
KYNU - это часть пути к катаболизм из Trp и биосинтез НАД кофакторы из триптофан (Трп).
Кинурениназа катализирует следующую реакцию:
- L-кинуренин + H2O = антранилат + L-аланин
Структура
Кинурениназа относится к класс V группа аспартатаминотрансфераза надсемейство структурно гомологичного пиридоксаль-5'-фосфата (PLP ) зависимые ферменты. На сегодняшний день две структуры кинурениназы человека определены методом дифракции рентгеновских лучей с разрешением 2,0 и 1,7 Å.[1][8] Сорок процентов аминокислот расположены в виде альфа-спирали, а двенадцать процентов - в виде бета-листов. Закрепление кинуренинового субстрата в активном сайте предполагает, что Asn-333 и His-102 участвуют в связывании субстрата.[1]
Функция
В реакции KYNU PLP способствует Cβ-Cγ разрыв связи. Реакция выполняется так же, как и трансаминирование реакция, но не гидролизует таутомеризованный База Шиффа. Предлагаемый механизм реакции включает атаку фермента. нуклеофил на карбонильном углероде (Cγ) таутомеризованного основания Шиффа 3hKyn-PLP. Далее следует Cβ-Cγ разрыв связи с образованием промежуточного соединения ацил-фермент вместе с таутомеризованным аддуктом Ala-PLP. Затем гидролиз ацил-фермента дает 3hAnt.
 Механизм реакции KYNU. Цветовая гамма следующая: KYNU, PLP, названия субстратов, неорганические молекулы, Фрагмент 3hAn, Часть Алы |
Рекомендации
- ^ а б c PDB: 2HZP; Лима С., Христофоров Р., Моманы С., Филлипс Р.С. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура кинурениназы Homo sapiens». Биохимия. 46 (10): 2735–44. Дои:10.1021 / bi0616697. ЧВК 2531291. PMID 17300176.
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115919 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026866 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Альберати-Джани Д., Бучли Р., Малхерб П., Брогер С., Ланг Г., Келер С., Лам Х. В., Цесура А. М. (июль 1996 г.). «Выделение и экспрессия клона кДНК, кодирующего кинурениназу человека». Евро. J. Biochem. 239 (2): 460–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0460u.x. PMID 8706755.
- ^ Тома С., Накамура М., Тоне С., Окуно Е., Кидо Р., Бретон Дж., Аванзи Н., Коззи Л., Специале С., Мостардини М., Гатти С., Бенатти Л. (май 1997 г.). «Клонирование и рекомбинантная экспрессия кинурениназы крысы и человека». FEBS Lett. 408 (1): 5–10. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00374-8. PMID 9180257. S2CID 36265922.
- ^ PDB: 3E9K; Лима С., Кумар С., Гаванди В., Момани С., Филлипс Р.С. (январь 2009 г.). «Кристаллическая структура комплекса ингибиторов кинурениназы-3-гидроксигиппуровой кислоты Homo sapiens: понимание молекулярных основ субстратной специфичности кинурениназы». J. Med. Chem. 52 (2): 389–96. Дои:10.1021 / jm8010806. PMID 19143568.
дальнейшее чтение
- Лима С., Христофоров Р., Моманы С., Филлипс Р.С. (2007). «Кристаллическая структура кинурениназы Homo sapiens». Биохимия. 46 (10): 2735–2744. Дои:10.1021 / bi0616697. ЧВК 2531291. PMID 17300176.
- Привет, член парламента, Чен Си, майор Е.О., Сайто К. (1997). «Различные ферменты кинуренинового пути ограничивают образование хинолиновой кислоты различными типами клеток человека». Biochem. J. 326 (2): 351–6. Дои:10.1042 / bj3260351. ЧВК 1218677. PMID 9291104.
- Rose JE, Behm FM, Drgon T и др. (2010). «Персонализированный отказ от курения: взаимосвязь между дозой никотина, зависимостью и оценкой генотипа успеха в отказе от курения». Мол. Med. 16 (7–8): 247–53. Дои:10.2119 / молмед.2009.00159. ЧВК 2896464. PMID 20379614.
- Zhang Y, Zhang KX, He X и др. (2005). «[Полиморфизм гена кинурениназы в хромосомной области-кандидате от гипертонии связан с эссенциальной гипертензией]». Чжунхуа Синь Сюэ Гуань Бин За Чжи. 33 (7): 588–91. PMID 16080802.
- Инада Дж, Окуно Э, Кимура М, Кидо Р. (1984). «Внутриклеточная локализация и характеристика 3-гидроксикинурениназы в печени человека». Int. J. Biochem. 16 (6): 623–8. Дои:10.1016 / 0020-711x (84) 90031-4. PMID 6468727.
- Ubbink JB, Vermaak WJ, Bissbort SH (1991). «Высокоэффективный жидкостный хроматографический анализ уровней активности кинурениназы лимфоцитов человека». J. Chromatogr. 566 (2): 369–75. Дои:10.1016/0378-4347(91)80253-9. PMID 1939450.
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Магни Дж., Амичи А., Эмануэли М. и др. (2004). «Энзимология гомеостаза НАД + у человека». Клетка. Мол. Life Sci. 61 (1): 19–34. Дои:10.1007 / s00018-003-3161-1. PMID 14704851. S2CID 22041610.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Кристенсен М., Дуно М., Лунд А.М. и др. (2007). «Ксантуреновая ацидурия из-за мутации в KYNU, кодирующей кинурениназу». J. Inherit. Метаб. Дис. 30 (2): 248–55. Дои:10.1007 / s10545-007-0396-2. PMID 17334708. S2CID 13295336.
- Уолш Х.А., Боттинг Н.П. (2002). «Очистка и биохимическая характеристика некоторых свойств рекомбинантной кинурениназы человека». Евро. J. Biochem. 269 (8): 2069–74. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2002.02854.x. PMID 11985583.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
внешняя ссылка
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для кинурениназы человека
PDB галерея | |
|---|---|
|
