Циклическая гуанилат-специфическая фосфодиэстераза - Cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase

Циклическая гуанилат-специфическая фосфодиэстераза
Идентификаторы
Номер ЕС3.1.4.52
Количество CAS338732-46-0
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

Циклическая гуанилат-специфическая фосфодиэстераза (EC 3.1.4.52, циклическая бис (3-> 5 ') дигуанилат фосфодиэстераза, c-ди-GMP-специфическая фосфодиэстераза, c-ди-GMP фосфодиэстераза, фосфодиэстераза, фосфодиэстераза A1, PDEA1, VieA) является фермент с участием систематическое название циклическая бис (3-> 5 ') дигуанилат-3-гуанилилгидролаза.[1][2][3][4][5] Этот фермент катализирует следующее химическая реакция

циклический ди-3 ', 5'-гуанилат + H2О 5'-фосфогуанилил (3 '-> 5') гуанозин

Этот фермент требует Mg2+ или Mn2+ для деятельности. Он ингибируется Ca2+ и Zn2+.

использованная литература

  1. ^ Chang, A.L .; Tuckerman, J.R .; Gonzalez, G .; Mayer, R .; Weinhouse, H .; Volman, G .; Amikam, D .; Benziman, M .; Жиль-Гонсалес, М.А. (2001). «Фосфодиэстераза А1, регулятор синтеза целлюлозы в Acetobacter xylinum, представляет собой датчик на основе гема ". Биохимия. 40 (12): 3420–3426. Дои:10.1021 / bi0100236. PMID  11297407.
  2. ^ Christen, M .; Christen, B .; Folcher, M .; Schauerte, A .; Jenal, U. (2005). «Идентификация и характеристика циклической ди-GMP-специфической фосфодиэстеразы и ее аллостерического контроля с помощью GTP». J. Biol. Chem. 280 (35): 30829–30837. Дои:10.1074 / jbc.M504429200. PMID  15994307.
  3. ^ Schmidt, A.J .; Рыженков, Д.А .; Гомельский, М. (2005). «Повсеместно распространенный белковый домен EAL представляет собой циклическую дигуанилат-специфичную фосфодиэстеразу: ферментативно активные и неактивные домены EAL». J. Bacteriol. 187 (14): 4774–4781. Дои:10.1128 / JB.187.14.4774-4781.2005. ЧВК  1169503. PMID  15995192.
  4. ^ Tamayo, R .; Tischler, A.D .; Камилли, А. (2005). «Белок домена EAL VieA представляет собой циклическую дигуанилатфосфодиэстеразу». J. Biol. Chem. 280 (39): 33324–33330. Дои:10.1074 / jbc.M506500200. ЧВК  2776828. PMID  16081414.
  5. ^ Чуа С.Л., Лю Й., Ям Дж. К., Толкер-Нильсен Т., Кьеллеберг С., Гивсков М., Ян Л. (2014). «Диспергированные клетки представляют собой отдельную стадию перехода от бактериальной биопленки к образу жизни планктона». Nature Communications. 5: 4462. Дои:10.1038 / ncomms5462. PMID  25042103.

внешние ссылки