Панкреатическая рибонуклеаза - Pancreatic ribonuclease

Панкреатическая рибонуклеаза
РНКаза A.png
Структура РНКазы А
Идентификаторы
Номер ЕС3.1.27.5
Количество CAS9001-99-4
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
Панкреатическая рибонуклеаза
Идентификаторы
СимволРНКазаА
PfamPF00074
ИнтерПроIPR001427
УМНАЯSM00092
PROSITEPDOC00118

Рибонуклеазы поджелудочной железы (EC 3.1.27.5, РНКаза, РНКаза I, РНКаза А, панкреатическая РНКаза, рибонуклеаза I, эндорибонуклеаза I, рибонуклеиновая фосфатаза, щелочная рибонуклеаза, рибонуклеаза, гликопротеины гена S, Щелочная рибонуклеаза Ceratitis capitata, Гликопротеины SLSG, гликопротеины, специфичные для локуса S гена, S-генотип-ассоциированный. гликопротеины, рибонуклеат 3'-пиримидино-олигонуклеотидогидролаза) находятся пиримидин -специфический эндонуклеазы найдено в большом количестве в поджелудочная железа определенных млекопитающие и некоторых рептилии.[1]

В частности, ферменты участвуют в эндонуклеолитическом расщеплении 3'-фосфомононуклеотиды и 3'-фосфулигонуклеотиды, оканчивающиеся на C-P или U-P с 2 ', 3'-циклическими фосфатными промежуточными соединениями. Рибонуклеаза может раскрутить РНК спираль за счет образования комплекса с одноцепочечной РНК; комплекс возникает в результате расширенного многоузлового катион-анионного взаимодействия между лизин и аргинин остатки фермента и фосфатные группы нуклеотидов.

Известные члены семьи

Рибонуклеаза поджелудочной железы крупного рогатого скота является наиболее изученным членом семьи и служил образцовой системой в работе, связанной с сворачивание белка, дисульфидная связь образование, белок кристаллография и спектроскопия, и динамика белка.[2] Геном человека содержит 8 генов, которые имеют общую структуру и функцию с рибонуклеазой поджелудочной железы крупного рогатого скота, с 5 дополнительными псевдогенами. Такая структура и динамика этих ферментов связаны с их разнообразными биологическими функциями.[3]

Другие белки, принадлежащие к суперсемейству панкреатических рибонуклеаз, включают: рибонуклеазы семенных пузырьков крупного рогатого скота и мозга; несекреторные рибонуклеазы почек;[4] рибонуклеазы печеночного типа;[5] ангиогенин, который вызывает васкуляризацию нормальных и злокачественных тканей; эозинофильный катионный белок,[6] цитотоксин и гельминтотоксин с рибонуклеазной активностью; и рибонуклеаза печени лягушки и лектин, связывающий сиаловую кислоту. Последовательность рибонуклеаз поджелудочной железы содержит четыре консервативных дисульфидные связи и три аминокислотных остатка, участвующих в каталитической активности.[7]

Гены человека

Человек гены кодирующие белки, содержащие это домен включают:

Цитотоксичность

Некоторые члены семейства панкреатических рибонуклеаз имеют цитотоксический последствия. Клетки млекопитающих защищены от этих воздействий из-за их чрезвычайно высокого близость за ингибитор рибонуклеазы (RI), который защищает клеточную РНК от деградации рибонуклеазами поджелудочной железы.[8] Рибонуклеазы поджелудочной железы, которые не ингибируются RI, примерно так же токсичны, как альфа-сарцин, дифтерийный токсин, или же рицин.[9]

Две панкреатические рибонуклеазы, выделенные из ооциты из Леопардовая лягушка - амфиназа и ранпирназа - не ингибируются RI и проявляют дифференциальную цитотоксичность против опухоль клетки.[10] Ранпирназа изучалась в Фаза III клиническое испытание в качестве кандидата на лечение мезотелиома, но испытание не продемонстрировало статистической значимости в отношении основных конечных точек.[11]

Рекомендации

  1. ^ Бейнтема Дж. Дж., Ван дер Лаан Дж. М. (1986). «Сравнение структуры рибонуклеазы поджелудочной железы черепахи с таковой рибонуклеаз млекопитающих». FEBS Lett. 194 (2): 338–343. Дои:10.1016/0014-5793(86)80113-2. PMID  3940901. S2CID  21907373.
  2. ^ Маршалл Г.Р., Фэн Дж. А., Кустер Д. Д. (2008). «Назад в будущее: рибонуклеаза А». Биополимеры. 90 (3): 259–77. Дои:10.1002 / bip.20845. PMID  17868092. S2CID  2905312.
  3. ^ Нараянан К., Бернар Д. Н., Бафна К., Ганье Д., Ченнубхотла С. С., Дусет Н., Агарвал П. К. (март 2018 г.). «Сохранение динамики, связанной с биологической функцией в суперсемействе ферментов». Структура. 26 (3): 426–436. Дои:10.1016 / j.str.2018.01.015. ЧВК  5842143. PMID  29478822.
  4. ^ Розенберг Х.Ф., Тенен Д.Г., Акерман С.Дж. (1989). «Молекулярное клонирование нейротоксина человеческого эозинофила: члена семейства генов рибонуклеазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (12): 4460–4464. Дои:10.1073 / pnas.86.12.4460. ЧВК  287289. PMID  2734298.
  5. ^ Хофстинг Дж., Мэттис Р., Стоун С. Р. (1989). «Первичная структура рибонуклеазы из печени свиньи, нового члена надсемейства рибонуклеаз». Биохимия. 28 (25): 9806–9813. Дои:10.1021 / bi00451a040. PMID  2611266.
  6. ^ Розенберг Х.Ф., Акерман С.Дж., Тенен Д.Г. (1989). "Катионный белок эозинофилов человека. Молекулярное клонирование цитотоксина и гельминтотоксина с рибонуклеазной активностью". J. Exp. Med. 170 (1): 163–176. Дои:10.1084 / jem.170.1.163. ЧВК  2189377. PMID  2473157.
  7. ^ Рейнс RT (1998). «Рибонуклеаза А». Chem. Rev. 98 (3): 1045–1066. Дои:10.1021 / cr960427h. PMID  11848924.
  8. ^ Гаур, Д; Сваминатан, S; Батра, JK (6 июля 2001 г.). «Взаимодействие рибонуклеазы поджелудочной железы человека с ингибитором рибонуклеазы человека. Создание цитотоксических вариантов, устойчивых к ингибиторам». Журнал биологической химии. 276 (27): 24978–84. Дои:10.1074 / jbc.m102440200. PMID  11342552.
  9. ^ Saxena, SK; Рыбак С.М.; Винклер, G; Мид, HM; McGray, P; Youle, RJ; Акерман, EJ (5 ноября 1991 г.). «Сравнение РНКаз и токсинов при инъекции в ооциты Xenopus». Журнал биологической химии. 266 (31): 21208–14. PMID  1939163.
  10. ^ Ли Дж. Э., Рейнс RT (2008). «Рибонуклеазы как новые химиотерапевтические препараты: пример ранпирназы». BioDrugs. 22 (1): 53–58. Дои:10.2165/00063030-200822010-00006. ЧВК  2802594. PMID  18215091.
  11. ^ «Годовой отчет Alfacell за 2009 год» (PDF). Получено 2 февраля 2015.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001427