Родопсиноподобные рецепторы - Rhodopsin-like receptors

Родопсиноподобные рецепторы
PDB 1f88 EBI.jpg
Структура родопсина: рецептор, связанный с G-белком.[1]
Идентификаторы
Символ7тм_1
PfamPF00001
Pfam кланGPCR_A
ИнтерПроIPR000276
PROSITEPDOC00211
SCOP21f88 / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство6
Белок OPM1гм
CDDcd00637

Родопсиноподобные рецепторы площадь семья из белки которые составляют самую большую группу G-белковые рецепторы.[2]

Объем

Рецепторы, связанные с G-белками, GPCR, составляют обширное семейство белков, которые выполняют широкий спектр функций (включая различные аутокринные, паракринные и эндокринные процессы). Они демонстрируют значительное разнообразие на уровне последовательностей, на основании чего их можно разделить на отдельные группы. GPCR обычно описывают как «суперсемейство», потому что они охватывают группу семьи для которых есть признаки эволюционной взаимосвязи, но между которыми нет статистически значимого сходства в последовательности.[2] Известные в настоящее время члены суперсемейства включают родопсин-подобные GPCR (это семейство), секретин-подобные GPCR, то рецепторы цАМФ, то грибковые рецепторы феромонов спаривания, а метаботропный рецептор глутамата семья. Есть специализированная база данных для GPCR.[3]

Функция

Родопсиноподобные GPCR сами по себе представляют собой широко распространенное семейство белков, которое включает гормональные, нейропептидные, нейротрансмиттерные и световые рецепторы, все из которых передают внеклеточные сигналы посредством взаимодействия с белками, связывающими гуанин-нуклеотид (G). Хотя их активирующие лиганды широко различаются по структуре и характеру, аминокислотные последовательности рецепторов очень похожи и, как полагают, принимают общую структурную основу, состоящую из 7 трансмембранных (TM) спиралей.[4][5][6]

Классы

Родопсин-подобные GPCR были разделены на следующие 19 подгрупп (A1-A19) на основе филогенетического анализа.[7]

Подсемейство A1

Подсемейство A2

Подсемейство A3

Подсемейство A4

Подсемейство A5

Подсемейство A6

Подсемейство A7

Подсемейство A8

Подсемейство A9

Подсемейство A10

Подсемейство A11

Подсемейство A12

Подсемейство A13

Подсемейство A14

Подсемейство A15

Подсемейство A16

Подсемейство A17

Подсемейство A18

Подсемейство A19

Неклассифицированный

Рекомендации

  1. ^ Пальчевски К., Кумасака Т., Хори Т. и др. (Август 2000 г.). «Кристаллическая структура родопсина: рецептор, связанный с G-белком». Наука. 289 (5480): 739–45. Bibcode:2000Sci ... 289..739P. Дои:10.1126 / science.289.5480.739. PMID  10926528.
  2. ^ а б Аттвуд Т.К., Финдли Дж. Б. (1994). «Отпечатки пальцев рецепторов, связанных с G-белком». Protein Eng. 7 (2): 195–203. Дои:10.1093 / белок / 7.2.195. PMID  8170923.
  3. ^ «Информационная система для рецепторов, связанных с G-белком». GPCRDB. www.gpcr.org. Архивировано из оригинал на 2009-04-22. Получено 2008-12-05.
  4. ^ Бирнбаумер Л. (1990). «G-белки в сигнальной трансдукции». Анну. Rev. Pharmacol. Токсикол. 30: 675–705. Дои:10.1146 / annurev.pa.30.040190.003331. PMID  2111655.
  5. ^ Гилман А.Г., Кейси П.Дж. (1988). «Участие G-белка в связывании рецептора и эффектора». J. Biol. Chem. 263 (6): 2577–2580. PMID  2830256.
  6. ^ Аттвуд Т.К., Финдли Дж. Б. (1993). «Дизайн распознающего отпечатка пальца для рецепторов, связанных с G-белком». Protein Eng. 6 (2): 167–176. Дои:10.1093 / белок / 6.2.167. PMID  8386361.
  7. ^ Йост П., Метнер А. (2002). «Филогенетический анализ 277 человеческих рецепторов, связанных с G-белком, как инструмент для предсказания лигандов орфанных рецепторов». Геном Биол. 3 (11): research0063.1–0063.16. Дои:10.1186 / gb-2002-3-11-research0063. ЧВК  133447. PMID  12429062.
  8. ^ Теракита А (2005). "Опсины". Геном Биол. 6 (3): 213. Дои:10.1186 / gb-2005-6-3-213. ЧВК  1088937. PMID  15774036.
  9. ^ а б Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (сентябрь 2011 г.). «Независимый поиск HH, анализ на основе Needleman-Wunsch и анализ мотивов выявили общую иерархию для большинства семейств рецепторов, связанных с G-белком». Молекулярная биология и эволюция. 28 (9): 2471–80. Дои:10.1093 / molbev / msr061. PMID  21402729.

внешняя ссылка