OPN5 - OPN5

OPN5
Идентификаторы
ПсевдонимыOPN5, GPR136, GRP136, PGR12, TMEM13, опсин 5
Внешние идентификаторыOMIM: 609042 MGI: 2662912 ГомолоГен: 72341 Генные карты: OPN5
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение OPN5
Геномное расположение OPN5
Группа6п12.3Начинать47,781,982 бп[1]
Конец47,832,780 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

221391

353344

Ансамбль

ENSG00000124818

ENSMUSG00000043972

UniProt

Q6U736

Q6VZZ7

RefSeq (мРНК)

NM_001030051
NM_181744

NM_181753

RefSeq (белок)

NP_859528

NP_861418

Расположение (UCSC)Chr 6: 47,78 - 47,83 МбChr 17: 42,56 - 42,61 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нейропсин это белок что у людей кодируется OPN5 ген.[5][6][7] Это фоторецепторный белок чувствительны к ультрафиолетовый (УФ) свет. Ген OPN5 был обнаружен в геномах мышей и человека, и его мРНК экспрессия также была обнаружена в нервных тканях. Нейропсин является бистабильным при 0 ° C и активирует чувствительный к УФ-излучению гетеротримерный G протеин Gi-опосредованный путь в тканях млекопитающих и птиц.[8][9]

Функция

Опсины являются членами Суперсемейство рецепторов, связанных с G-белком. Человеческий нейропсин экспрессируется в глазу, головном мозге, яичках и спинном мозге. Нейропсин принадлежит к семейству экзонных генов опсинов млекопитающих, которое включает: перопсин (RRH) и рецептор, связанный с G-белком сетчатки (RGR). Нейропсин имеет разные изоформы создается альтернативной сваркой.[7]

Фотохимия

При восстановлении с 11-цис-ретиналь, нейропсины мыши и человека поглощают максимум при 380 нм. При освещении эти нейропсины превращаются в фотопродукты, поглощающие синий цвет (470 нм), которые стабильны в темноте. Фотопродукты снова преобразуются в форму, поглощающую УФ, когда они освещаются оранжевым светом (> 520 нм).[8]

Филогения

Нейропсины составляют один из четырех субкладов группы опсинов Go / RGR, также известных как RGR / Go или Группа 4. Go / RGR является одним из четырех основных субкладов опсинов типа II, также известных как метазоа или животные опсины. . Go / RGR состоит из Go-coupled, RGR, перопсины, и нейропсины. Опсины типа II включают четыре субклада: C-опсины (цилиарные), R-опсины (рабдомерные), Cnidops (книдарийные) и Go / RGR. Три из этих субкладов встречаются только в Bilateria (все, кроме Cnidops). Однако двуногие клады составляют парфилетический таксон без Cnidops.[10][11]

Распространение видов

Нейропсин и его ортологи были обнаружены экспериментально у небольшого числа животных, среди них человек, домовая мышь (Mus musculus ),[5] курица (Gallus gallus domesticus ),[9][12] то Японский перепел (Coturnix japonica),[13] европейская хрупкая звезда Amphiura filiformis (относится к морским звездам),[14] то тихоходка водяной медведь (Гипсибиус дюжардини ),[15] и головастик Xenopus laevis.[16]

Поиски в общедоступных базах данных генетических последовательностей обнаружили предполагаемые ортологи нейропсина в обеих основных ветвях Bilateria: протостомы и дейтеростомы. Среди протостомов предполагаемые нейропсины были обнаружены в моллюски соваLottia gigantea ) (вид морской улитки) и Тихоокеанская устрица (Crassostrea gigas), в водяная блоха (Дафния пулекс ) (ан членистоногие ), а в кольчатые червя червь Capitella teleta.[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124818 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043972 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Тартелин Е.Е., Беллингхэм Дж., Хэнкинс М.В., Фостер Р.Г., Лукас Р.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Нейропсин (Opn5): новый опсин, обнаруженный в нервной ткани млекопитающих». Письма FEBS. 554 (3): 410–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01212-2. PMID  14623103. S2CID  9577067.
  6. ^ Fredriksson R, Höglund PJ, Gloriam DE, Lagerström MC, Schiöth HB (ноябрь 2003 г.). «Семь эволюционно законсервированных рецепторов человеческого родопсина G, связанных с белком, не имеющих близких родственников». Письма FEBS. 554 (3): 381–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01196-7. PMID  14623098. S2CID  11563502.
  7. ^ а б "Энтрез Ген: OPN5 опсин 5".
  8. ^ а б Кодзима Д., Мори С., Тории М., Вада А., Моришита Р., Фукада Ю. (2011). «УФ-чувствительный фоторецепторный белок OPN5 у людей и мышей». PLOS ONE. 6 (10): e26388. Bibcode:2011PLoSO ... 626388K. Дои:10.1371 / journal.pone.0026388. ЧВК  3197025. PMID  22043319.
  9. ^ а б Yamashita, T .; Ohuchi, H .; Tomonari, S .; Икеда, К .; Sakai, K .; Шичида Ю. (6 декабря 2010 г.). «Opn5 - это чувствительный к ультрафиолету бистабильный пигмент, который сочетается с подтипом Gi белка G» (PDF). Труды Национальной академии наук. 107 (51): 22084–22089. Bibcode:2010PNAS..10722084Y. Дои:10.1073 / pnas.1012498107. ЧВК  3009823. PMID  21135214.
  10. ^ Портер М.Л., Бласик-младший, Бок М.Дж., Кэмерон Э.Г., Прингл Т., Кронин Т.В., Робинсон П.Р. (январь 2012 г.). «Проливая новый свет на эволюцию опсинов». Труды Королевского общества B: биологические науки. 279 (1726): 3–14. Дои:10.1098 / rspb.2011.1819. ЧВК  3223661. PMID  22012981.
  11. ^ Liegertová M, Pergner J, Kozmiková I., Fabian P, Pombinho AR, Strnad H, Pačes J, Vlček Č, Bartůněk P, Kozmik Z (2015). «Геном кубозоя указывает на функциональную диверсификацию опсинов и эволюцию фоторецепторов». Научные отчеты. 5: 11885. Bibcode:2015НатСР ... 511885Л. Дои:10.1038 / srep11885. ЧВК  5155618. PMID  26154478.
  12. ^ Tomonari S, Migita K, Takagi A, Noji S, Ohuchi H (июль 2008 г.). «Паттерны экспрессии генов, связанных с опсином 5, в развивающейся сетчатке курицы». Динамика развития. 237 (7): 1910–22. Дои:10.1002 / dvdy.21611. PMID  18570255. S2CID  42113764.
  13. ^ Накане Й., Икегами К., Оно Х., Ямамото Н., Йошида С., Хирунаги К., Эбихара С., Кубо Й, Йошимура Т. (август 2010 г.). «Опсин нервной ткани млекопитающих (Опсин 5) является фоторецептором глубокого мозга у птиц». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (34): 15264–8. Bibcode:2010PNAS..10715264N. Дои:10.1073 / pnas.1006393107. ЧВК  2930557. PMID  20679218.
  14. ^ Delroisse J, Ullrich-Lüter E, Ortega-Martinez O, Dupont S, Arnone MI, Mallefet J, Flammang P (2014). «Высокое разнообразие опсинов в невизуальной инфаунальной хрупкой звезде». BMC Genomics. 15 (1): 1035. Дои:10.1186/1471-2164-15-1035. ЧВК  4289182. PMID  25429842.
  15. ^ а б Геринг Л., Майер Г. (сентябрь 2014 г.). «Анализ репертуара опсинов тихоходки Hypsibius dujardini дает представление об эволюции генов опсинов у панартропод». Геномная биология и эволюция. 6 (9): 2380–91. Дои:10.1093 / gbe / evu193. ЧВК  4202329. PMID  25193307.
  16. ^ Карри, Стивен П .; Доэрти, Гейл Х .; Силлар, Кейт Т. (10 мая 2016 г.). «Фотоприемник в глубоком мозге связывает обнаружение яркости с моторной мощностью у головастиков лягушек». Труды Национальной академии наук. 113 (21): 6053–8. Дои:10.1073 / pnas.1515516113. ЧВК  4889350. PMID  27166423.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.