RRH - RRH

RRH
Идентификаторы
ПсевдонимыRRH, гомолог родопсина, полученный из пигментного эпителия сетчатки
Внешние идентификаторыOMIM: 605224 MGI: 1097709 ГомолоГен: 55977 Генные карты: RRH
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек)[1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение RRH
Геномное расположение RRH
Группа4q25Начинать109,827,972 бп[1]
Конец109,849,123 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RRH 208314 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006583

NM_009102

RefSeq (белок)

NP_006574

NP_033128

Расположение (UCSC)Chr 4: 109,83 - 109,85 МбChr 3: 129,8 - 129,82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Перопсин, зрительный пигментоподобный рецептор, представляет собой белок что у людей кодируется RRH ген.[5][6]

Перопсин является опсином и поэтому относится к рецепторам, связанным с гуанин-нуклеотид-связывающим белком (G-белок). Гены перопсина имеют семь экзонов, таких как гены нейропсина и RGR-опсина.[6]

Филогения

Перопсины являются одной из четырех подгрупп опсинов Go / RGR, также известных как опсины RGR / Go или группы 4. Опсины Go / RGR являются одной из четырех основных групп опсинов типа II, также известных как опсины метазоа или животных. Опсины Go / RGR состоят из четырех групп: Go-opsins, РГР-опсины, перопсины и нейропсины. Опсины животных относятся к четырем классам: C-опсины (ресничные), R-опсины (рабдомерные), Cnidops (книдарийные) и Go / RGR-опсины. Три из этих субкладов встречаются только в Bilateria (все, кроме Cnidops). Однако двуногие клады составляют парфилетический таксон без Cnidops.[7][8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000180245 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028012 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Сан Х., Гилберт Диджей, Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А., Натанс Дж. (Сентябрь 1997 г.). «Перопсин, новый визуальный пигментоподобный белок, расположенный в апикальных микроворсинках пигментного эпителия сетчатки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (18): 9893–8. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9893. ЧВК  23288. PMID  9275222.
  6. ^ а б «Ген Entrez: RRH, гомолог родопсина, полученный из пигментного эпителия сетчатки».
  7. ^ Портер М.Л., Бласик-младший, Бок М.Дж., Кэмерон Э.Г., Прингл Т., Кронин Т.В., Робинсон П.Р. (январь 2012 г.). «Проливая новый свет на эволюцию опсинов». Труды Королевского общества B: биологические науки. 279 (1726): 3–14. Дои:10.1098 / rspb.2011.1819. ЧВК  3223661. PMID  22012981.
  8. ^ Liegertová M, Pergner J, Kozmiková I., Fabian P, Pombinho AR, Strnad H, Pačes J, Vlček Č, Bartůněk P, Kozmik Z (2015). «Геном кубозоя указывает на функциональную диверсификацию опсинов и эволюцию фоторецепторов». Научные отчеты. 5: 11885. Дои:10.1038 / srep11885. ЧВК  5155618. PMID  26154478.

дальнейшее чтение

  • Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С., Джексон П. Д., Перри Р., Каин С., Левенталь К., Торнтон М., Рамачандран Р., Уиттингтон Дж., Лернер Л., Костанцо Д., Макэллиготт К., Бузер С., Мэйс Р., Смит Е., Велозо Н. , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (май 2001 г.). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Природа Биотехнологии. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
  • Беллингем Дж., Уэллс ди-джей, Фостер Р.Г. (январь 2003 г.). «In silico характеристика и хромосомная локализация человеческого RRH (перопсина) - значение для эволюции опсина». BMC Genomics. 4 (1): 3. Дои:10.1186/1471-2164-4-3. ЧВК  149353. PMID  12542842.
  • Барриос-Родилес М., Браун К. Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р. С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзулдж Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Wrana JL (март 2005 г.). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
  • Риволта С., Берсон Э.Л., Дрыя Т.П. (2007). «Скрининг мутаций гена перопсина, гомолога родопсина, специфичного для пигментного эпителия сетчатки, у пациентов с пигментным ретинитом и родственными заболеваниями». Молекулярное зрение. 12: 1511–5. PMID  17167409.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.