Гистидин декарбоксилаза - Histidine decarboxylase

Гистидин декарбоксилаза
HDC 3D Ray Image.png
Карикатура изображения C-усеченного димера HDC с PLP проживающие на активном сайте.
Идентификаторы
Номер ЕС4.1.1.22
Количество CAS9024-61-7
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

Гистидин декарбоксилаза (HDC) является фермент ответственный за катализирующий декарбоксилирование гистидин формировать гистамин. У млекопитающих гистамин является важным биогенный амин с регулирующими функциями в нейротрансмиссия, Желудочный сок секреция и иммунная реакция.[1][2] Гистидиндекарбоксилаза является единственным участником синтеза гистамина. путь, производя гистамин в одностадийной реакции. Гистамин не может быть произведен никаким другим известным ферментом.[3] Таким образом, HDC является основным источником гистамина в большинстве млекопитающие и эукариоты. Фермент использует пиридоксаль 5'-фосфат (PLP) кофактор, как и многие другие аминокислота декарбоксилазы.[4][5] Эукариоты, а также грамотрицательные бактерии использовать общий HDC, а грамположительные бактерии нанять эволюционно несвязанный пирувойл-зависимый HDC.[6] У человека гистидиндекарбоксилаза кодируется HDC ген.[2][7]

Структура

PLP обычно ковалентно связывается с HDC по лизину 305. Он также удерживается на месте водородными связями с другими соседними аминокислотами. Здесь активный сайт показан с PLP, привязанным к метиловый эфир гистидина, что было необходимо для кристаллизации.[8] Создано из 4E1O.

Гистидиндекарбоксилаза представляет собой пиридоксаль-зависимая декарбоксилаза группы II, вместе с декарбоксилаза ароматических L-аминокислот, и тирозиндекарбоксилаза. HDC выражается как 74 кДа полипептид который не является ферментативно функциональным.[8][9] Только после посттрансляционная обработка активизируется ли фермент. Эта обработка состоит из усечения большей части белка C-терминал цепь, восстанавливающая пептид молекулярный вес до 54 кДа.

Гистидиндекарбоксилаза существует как гомодимер, с несколькими аминокислотами из соответствующей противоположной цепи, стабилизирующей HDC активный сайт. В состоянии покоя HDC PLP является ковалентно связанный в База Шиффа к лизин 305, и стабилизируется несколькими водородными связями с соседними аминокислотами. аспартат 273, серин 151 и серин 354 противоположной цепи.[8] HDC содержит несколько регионов, последовательно и структурно аналогичны таковым в ряде других пиридоксальзависимых декарбоксилаз.[10] Это особенно заметно в окрестности лизина активного центра 305.[11]

Механизм

Механизм декарбоксилирования гистидина HDC с использованием PLP кофактор.[12] Этот механизм похож на многие другие PLP-зависимые карбоксилазы.

HDC декарбоксилат гистидин за счет использования PLP кофактор первоначально связывается в основании Шиффа с лизином 305.[12] Гистидин инициирует реакция путем вытеснения лизина 305 и образования альдимин с PLP. Затем гистидин карбоксильная группа покидает субстрат, образуя углекислый газ. Это этап, ограничивающий скорость всего процесса, требующий энергии активации 17,6 ккал / моль. [13] и соответствует экспериментальному обороту 1,73 .[14] После декарбоксилирования промежуточный продукт PLP протонируется тирозином 334 из второй субъединицы. Протонирование опосредуется молекулой воды, оно очень быстрое и очень эксергоническое.[13] Наконец, PLP восстанавливает свое исходное основание Шиффа по лизину 305, и высвобождается гистамин. Этот механизм очень похож на те, которые используются другими пиридоксаль-зависимыми декарбоксилазами. В частности, промежуточный альдимин является общим признаком всех известных PLP-зависимых декарбоксилаз.[15] HDC очень специфичен для своего гистидинового субстрата.[16]

Биологическая значимость

Гистидиндекарбоксилаза является основным биологический источник гистамина. Гистамин - важный биогенный амин что сдерживает многочисленные физиологические процессы. Есть четыре разных гистамина рецепторы, ЧАС1, ЧАС2, ЧАС3, и ЧАС4,[3] каждый из которых имеет различное биологическое значение. ЧАС1 модулирует несколько функций центральный и периферическая нервная система, включая циркадный ритм, температура тела и аппетит.[17] ЧАС2 активация приводит к Желудочный сок секреция и гладкая мышца расслабление.[18][19] ЧАС3 контролирует оборот гистамина подавление обратной связи гистамина синтез и отпустить.[20] Наконец, H4 играет роль в тучных клетках хемотаксис и цитокин производство.[17]

У человека HDC в первую очередь экспрессируется в тучные клетки и базофил гранулоциты. Соответственно, эти клетки содержать высшее тело концентрации гистамина гранулы. Гистамин немастоцитов также обнаружен в мозг, где он используется как нейротрансмиттер.[21]

Торможение

HDC может быть подавленный к α-фторметилгистидин и метиловый эфир гистидина.[22][23]

Клиническое значение

Антигистаминные препараты являются классом лекарства разработан для уменьшения нежелательного воздействия гистамина на организм. Типичные антигистаминные препараты специфически блокируют гистаминовые рецепторы в зависимости от того, какой физиологической цели они служат. Например, дифенгидрамин (Бенадрил ™), нацеливается и ингибирует гистаминовый рецептор H1 для облегчения симптомы из аллергические реакции.[24] Ингибиторы гистидиндекарбоксилазы предположительно могут использоваться как атипичные антигистаминные препараты. Тритоквалин, а также различные катехины, Такие как эпигаллокатехин-3-галлат, основной компонент зеленый чай, было показано, что нацелены на HDC и гистамин-продуцирующие клетки, снижая уровень гистамина и обеспечивая противовоспалительное средство, противоопухолевый, и антиангиогенный последствия.[25]

Мутации в гене гистидиндекарбоксилазы наблюдались в одной семье с синдром Туретта (TS) и, как считается, не учитывают большинство случаев TS.[26]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Эппс ХМ (1945). «Исследования бактериальных декарбоксилаз аминокислот: 4. 1 (-) - гистидиндекарбоксилаза из Cl. Welchii типа A». Биохимический журнал. 39 (1): 42–6. Дои:10.1042 / bj0390042. ЧВК  1258146. PMID  16747851.
  2. ^ а б «Entrez Gene: гистидиндекарбоксилаза».
  3. ^ а б Шахид, Мохаммад (2009). «Гистамин, гистаминовые рецепторы и их роль в иммуномодуляции: обновленный систематический обзор» (PDF). Открытый журнал иммунологии. 2: 9–41. Дои:10.2174/1874226200902010009.
  4. ^ Райли У. Д., Снелл Э. Э. (октябрь 1968 г.). «Гистидиндекарбоксилаза Lactobacillus 30a. IV. Наличие ковалентно связанного пирувата в качестве простетической группы». Биохимия. 7 (10): 3520–8. Дои:10.1021 / bi00850a029. PMID  5681461.
  5. ^ Rosenthaler J, Guirard BM, Chang GW, Snell EE (июль 1965 г.). «Очистка и свойства гистидиндекарбоксилазы из Lactobacillus 30a». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 54 (1): 152–8. Дои:10.1073 / пнас.54.1.152. ЧВК  285813. PMID  5216347.
  6. ^ Кимура Б., Такахаши Х., Хокимото С., Танака И., Фуджи Т. (август 2009 г.). «Индукция генов гистидиндекарбоксилазы Photobacterium damselae subsp. Damselae (формально P. histaminum) при низком pH». Журнал прикладной микробиологии. 107 (2): 485–97. Дои:10.1111 / j.1365-2672.2009.04223.x. PMID  19302297.
  7. ^ Bruneau G, Nguyen VC, Gros F, Bernheim A, Thibault J (ноябрь 1992 г.). «Получение пробы кДНК гистидиндекарбоксилазы головного мозга крысы (HDC) с помощью ПЦР и отнесение гена HDC человека к хромосоме 15». Генетика человека. 90 (3): 235–8. Дои:10.1007 / bf00220068. PMID  1487235.
  8. ^ а б c Комори Х., Нитта Й., Уэно Х., Хигучи Й. (август 2012 г.). «Структурное исследование показывает, что Ser-354 определяет субстратную специфичность гистидиндекарбоксилазы человека». Журнал биологической химии. 287 (34): 29175–83. Дои:10.1074 / jbc.M112.381897. ЧВК  3436558. PMID  22767596.
  9. ^ Нитта, Йоко (2010). «Экспрессия рекомбинантной гистидиндекарбоксилазы человека с полноразмерными и усеченными с С-конца формами в дрожжевых и бактериальных клетках» (PDF). J. Biol. Макромол. 10.
  10. ^ Джексон, Ф. Роб (1990-10-01). «Прокариотические и эукариотические пиридоксаль-зависимые декарбоксилазы гомологичны». Журнал молекулярной эволюции. 31 (4): 325–329. Дои:10.1007 / BF02101126. ISSN  0022-2844.
  11. ^ Сандмайер Э., Хейл Т.И., Кристен П. (май 1994 г.). «Множественное эволюционное происхождение пиридоксаль-5'-фосфат-зависимых декарбоксилаз аминокислот». Европейский журнал биохимии. 221 (3): 997–1002. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1994.tb18816.x. PMID  8181483.
  12. ^ а б Ву Ф, Ю Дж, Геринг Х (март 2008 г.). «Ингибирующие и структурные исследования новых аналогов кофермента-субстрата гистидиндекарбоксилазы человека». Журнал FASEB. 22 (3): 890–7. Дои:10.1096 / fj.07-9566com. PMID  17965265.
  13. ^ а б Фернандес Х.С., Рамос М.Дж., Серкейра Н.М. (июль 2017 г.). «Каталитический механизм пиридоксаль-5'-фосфат-зависимого фермента, гистидиндекарбоксилазы: компьютерное исследование». Химия. 23 (38): 9162–9173. Дои:10.1002 / chem.201701375. PMID  28613002.
  14. ^ Комори Х., Нитта Й., Уэно Х., Хигучи Й. (август 2012 г.). «Структурное исследование показывает, что Ser-354 определяет субстратную специфичность гистидиндекарбоксилазы человека». Журнал биологической химии. 287 (34): 29175–83. Дои:10.1074 / jbc.m112.381897. ЧВК  3436558. PMID  22767596.
  15. ^ «Пиридоксальфосфат-зависимая декарбоксилаза». ИнтерПро.
  16. ^ Тони MD (январь 2005 г.). «Специфичность реакции пиридоксальфосфатных ферментов». Архивы биохимии и биофизики. Выделите вопрос о ферментных механизмах. 433 (1): 279–87. Дои:10.1016 / j.abb.2004.09.037. PMID  15581583.
  17. ^ а б Панула П., Чазот П.Л., Коварт М., Гутцмер Р., Леурс Р., Лю В.Л., Старк Х., Турмонд Р.Л., Хаас Х.Л. (июль 2015 г.). "Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии. XCVIII. Гистаминовые рецепторы". Фармакологические обзоры. 67 (3): 601–55. Дои:10.1124 / пр.114.010249. ЧВК  4485016. PMID  26084539.
  18. ^ Canonica GW, Blaiss M (февраль 2011 г.). «Антигистаминные, противовоспалительные и противоаллергические свойства не вызывающего седативного эффекта антигистаминного препарата второго поколения дезлоратадина: обзор доказательств». Журнал Всемирной организации аллергии. 4 (2): 47–53. Дои:10.1097 / WOX.0b013e3182093e19. ЧВК  3500039. PMID  23268457.
  19. ^ Хилл, С.Дж. (1997). «Классификация гистаминовых рецепторов». Фармакологические обзоры. 49: 253–278 - через ASPET.
  20. ^ West RE, Zweig A, Shih NY, Siegel MI, Egan RW, Clark MA (ноябрь 1990 г.). «Идентификация двух подтипов H3-гистаминовых рецепторов». Молекулярная фармакология. 38 (5): 610–3. PMID  2172771.
  21. ^ Бландина П., Мунари Л., Провенси Г., Пассани МБ (01.01.2012). «Гистаминовые нейроны в туберомамиллярном ядре: целый центр или отдельные субпопуляции?». Границы системной нейробиологии. 6: 33. Дои:10.3389 / fnsys.2012.00033. ЧВК  3343474. PMID  22586376.
  22. ^ Август Т.Ф., Муссон Д.Г., Хван СС, Дагган Д.Е., Гук К.Ф., Роман И.Дж., Фергюсон Р.Дж., Бейн В.Ф. (август 1985 г.). «Биоанализ и утилизация альфа-фторметилгистидина, нового ингибитора гистидиндекарбоксилазы». Журнал фармацевтических наук. 74 (8): 871–5. Дои:10.1002 / jps.2600740814. PMID  4032273.
  23. ^ Lane RS, Manning JM, Snell EE (сентябрь 1976 г.). «Гистидиндекарбоксилаза Lactobacillus 30a: инактивация и мечение активных сайтов метиловым эфиром L-гистидина». Биохимия. 15 (19): 4180–5. Дои:10.1021 / bi00664a008. PMID  963031.
  24. ^ «Дифенгидрамина гидрохлорид». Drugs.com.
  25. ^ Мельгарехо Э., Медина М.А., Санчес-Хименес Ф., Урдиалес Ю.Л. (сентябрь 2010 г.). «Нацеливание на клетки, продуцирующие гистамин, с помощью EGCG: зеленый стрелок против воспаления?». Журнал физиологии и биохимии. 66 (3): 265–70. Дои:10.1007 / s13105-010-0033-7. PMID  20652470.
  26. ^ «Интернет-менделевское наследование в человеке: гистидиндекарбоксилаза».

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.